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生合成

索引 生合成

生合成(せいごうせい)とは、生体がその構成成分である生体分子を作り出すことをいう。多くの生物に共通している基本的な化合物(アミノ酸、糖、脂肪酸、核酸など)を合成する経路を一次代謝、特定の種や科に特有の化合物(ホルモン、フェロモン、毒素など)を作り出す経路を二次代謝と呼ぶが、両者の区分は必ずしも明確ではない。 ひとつの化合物が生合成されるには単一の酵素でなく、酸化還元酵素、転移酵素、合成酵素、加水分解酵素など数多くの酵素が関わり、多数の段階を踏むことが普通である。 生合成が不可能な分子は、体外より栄養素として取り入れなければならず、こういった栄養素を必須栄養素と呼ぶ。ヒトにおいて生合成が不可能なアミノ酸、脂肪酸をそれぞれ必須アミノ酸、必須脂肪酸と呼び、栄養学において非常に重要である。さらに、生体内での代謝に必須でありながら、生合成できない補酵素群をビタミンと呼び、同様に生合成できないミネラルとともにこれらもまた、栄養学上重要である。 Category:生化学.

173 関係: 半矮性遺伝子大隅良典三浦謹一郎乳酸ラセマーゼ二次代謝化学に関する記事の一覧ペラグラペントースリン酸経路ペプチド合成ミクロビリジンノーベル化学賞ノーベル生理学・医学賞チロシンtRNAリガーゼチオストレプトンバリンtRNAリガーゼバレンセンポドフィロトキシンメチオニンメルドニウムモミラクトンBモノリグノールラモプラニンリコペンリシンtRNAリガーゼリゾホスファチジン酸ルシフェリンロドストレプトマイシンロイシンtRNAリガーゼロキソプロフェントランスケトラーゼトリプトファンtRNAリガーゼトレオニントレオニンtRNAリガーゼヘミセルロースブラシノステロイドブラシカステロールブラストサイジンSブリオスタチンプロリンtRNAリガーゼプロピザミドプロテオグリカンプロストラチンプロスタグランジンパクロブトラゾールヒスチジンtRNAリガーゼビフェニルビオチンビタミンCビサボレンピノバンクシン...ピノセムブリンピクテ・スペングラー反応テルペンテヌアゾン酸デサチュラーゼフラノクマリンフラボノイドフロログルシノールファルネシル二リン酸フィラグリンフィトンチッドフェニルプロパノイドフェニルアラニンフェニルアラニンtRNAリガーゼフェニルケトン尿症ドコサヘキサエン酸ニコチアナミンホモセリンベンチオカーブアラニンtRNAリガーゼアリルグリシンアルバート・ラスカー基礎医学研究賞アルビノアルカロイドアルカンニンアルギニンtRNAリガーゼアレクサンダー・トッドアデノシン三リン酸アグマチンアザジラクチンアザスピロ酸アジサイアスペルギルス・ニデュランスアスパラギン酸tRNAリガーゼアスパラギンtRNAリガーゼアセト乳酸イミノ酸イリドイドイソペニシリン-NエピメラーゼイソペニシリンNシンターゼイソロイシンtRNAリガーゼウリジン二リン酸グルクロン酸エラスチンエキソソーム複合体エストロゲン受容体オキサシリンカマズレンカルニチンカルコンイソメラーゼカロテンキヌレニンクルクミンクロム親和性細胞クロトリマゾールクエン酸回路グリコシダーゼグリシンtRNAリガーゼグルタミングルタミン酸tRNAリガーゼグルタミンtRNAリガーゼグアノシン三リン酸ゲラニルゲラニル二リン酸ゲラニルゲラニオールゲラニオールコレステロールコーヒー酸コスミドゴシポールシガトキシンシキミ酸経路システインtRNAリガーゼジョン・ベーンジケトピペラジン類スペルミンステマレンステロールステロイドセリンセリンtRNAリガーゼセルロースセコロガニンタキサンサイトカイニン前駆体CAZy皮膚硫酸エステル糖鎖生物学細胞骨格終止コドン熊谷英彦D-ツボクラリン菊酸非メバロン酸経路非リボソームペプチド鮒信学転写 (生物学)胆汁薬草藤原賞還元的アミノ化脱炭酸脂肪酸野口博司酢酸鉄欠乏性貧血電解質代謝O-アセチルセリンRiPPs抗真菌薬林康紀渡辺賢二(+)-ネオメントールデヒドロゲナーゼ(+)-ボルネオールデヒドロゲナーゼ(+)-サビノールデヒドロゲナーゼ(+)-trans-カルベオールデヒドロゲナーゼ(-)-メントールデヒドロゲナーゼ10-ホルミルテトラヒドロ葉酸2-ヒドロキシ-4-メトキシベンズアルデヒド4-ヒドロキシベンズアルデヒド5''-ホスホリボスタマイシンホスファターゼ6-アミノペニシラン酸7,8-ジヒドロネオプテリン三リン酸 インデックスを展開 (123 もっと) »

半矮性遺伝子

半矮性遺伝子(はんわいせいいでんし、semidwarf gene)とは、植物の背の高さ(草丈)を低くする遺伝子。主に植物育種学で用いられる用語。緑の革命においてイネ、コムギ品種の改良に用いられ、その子孫に当たる品種に引き継がれている。.

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大隅良典

大隅 良典(おおすみ よしのり、1945年2月9日 - )は、日本の生物学者(分子細胞生物学)。学位は理学博士(東京大学・1974年)。東京工業大学科学技術創成研究院特任教授・栄誉教授、自然科学研究機構特別栄誉教授、総合研究大学院大学名誉教授、基礎生物学研究所名誉教授、東京大学特別栄誉教授。福岡市名誉市民、大磯町名誉町民、京都大学名誉博士。 自然科学研究機構基礎生物学研究所教授兼総合研究大学院大学生命科学研究科教授、東京工業大学フロンティア研究機構特任教授などを歴任した。「オートファジーの仕組みの解明」により2016年のノーベル生理学・医学賞を受賞した。.

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三浦謹一郎

三浦 謹一郎(みうら きんいちろう、1931年3月25日 - 2009年9月21日)は、日本の生命科学者。株式会社プロテイオス研究所取締役社長兼研究所長。日本ウイルス学会名誉会員、元日本分子生物学会会長、元日本蛋白質科学会会長。元千葉工業大学教授、元学習院大学教授、元放送大学講師、国立遺伝学研究所名誉教授、東京大学名誉教授。.

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乳酸ラセマーゼ

乳酸ラセマーゼ(lactate racemase)は、乳酸の2つの立体異性体の間の相互変換を触媒する酵素である。.

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二次代謝

二次代謝(にじたいしゃ)とは、生物自身が生合成し、生物が生育・成長する上で必要不可欠ではない(と考えられていた)代謝経路、および低分子化合物のことであり、有名なものとして抗菌物質や色素などが挙げられる。二次代謝は様々な生物種が行っており、様々な生理活性を持つものがある。代表的な二次代謝産物として、テルペノイド系化合物、ポリケタイド系化合物、アルカロイド化合物などがある。 Category:生化学 Category:代謝.

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化学に関する記事の一覧

このページの目的は、化学に関係するすべてのウィキペディアの記事の一覧を作ることです。この話題に興味のある方はサイドバーの「リンク先の更新状況」をクリックすることで、変更を見ることが出来ます。 化学の分野一覧と重複することもあるかもしれませんが、化学分野の項目一覧です。化学で検索して出てきたものです。数字、英字、五十音順に配列してあります。濁音・半濁音は無視し同音がある場合は清音→濁音→半濁音の順、長音は無視、拗音・促音は普通に(ゃ→や、っ→つ)変換です。例:グリニャール反応→くりにやるはんのう †印はその内容を内含する記事へのリダイレクトになっています。 註) Portal:化学#新着記事の一部は、ノート:化学に関する記事の一覧/化学周辺に属する記事に分離されています。.

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ペラグラ

ペラグラ(Pellagra)は、代謝内分泌疾患の一つで、ナイアシン欠乏症(栄養失調)である。Pellagraはイタリア語で「皮膚の痛み」を意味する。栄養不良(亜鉛、鉄、ビタミンB2、B6)のある者は、ペラグラを発症するリスクが高くなる。ニコチン酸アミド及びビタミンB群の投与により治療する。.

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ペントースリン酸経路

ペントースリン酸経路 ペントースリン酸経路(ペントースリンさんけいろ、pentose phosphate pathway: PPP)は、解糖系のグルコース-6-リン酸から出発して、同じく解糖系のグリセルアルデヒド-3-リン酸へとつながる経路で、NADPHや、デオキシリボース、リボースといった核酸の生合成に不可欠な糖を含む各種ペントースの産生に関与する。また、NADPHの供給源として脂質の生産にも関与している。ペントースリン酸経路によって、1分子のグルコース-6-リン酸から1分子のCO2と2分子のNADPHが生成される。肝臓、脂肪組織、精巣、副腎皮質、授乳期の乳腺においてペントースリン酸経路の活性は高い。.

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ペプチド合成

ペプチド合成(ペプチドごうせい、peptide synthesis)とは、ヒトが設計した通りのアミノ酸配列を持つペプチドを合成する手法のことである。 ペプチド合成の方法論 ペプチド合成の手法の1つとして、まず純粋に有機合成化学の手法によって合成する方法がある。 この方法では天然には存在しないアミノ酸等の構成ユニットを持つペプチドを合成することが可能である。 また、生体内ではDNAがRNAに転写され、さらにRNAが翻訳されることによって、設計図であるDNAに記録されている通りのアミノ酸配列を持つペプチドが生合成されている。 そのため、望みのアミノ酸配列に対応するDNAを細胞に導入してやれば、この生体内のペプチド合成機構を利用して、望みのアミノ酸配列を持つペプチドを合成させることができる。 この方法は遺伝子工学を利用して行なわれる。 望むペプチドを産生する細胞を増殖させることができるため、この方法はペプチドの量産化に向いている。.

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ミクロビリジン

ミクロビリジンBの構造 ミクロビリジン(Microviridin)は、数種の藍藻が産出するセリンプロテアーゼ阻害剤の分類の一つである。ゲノムマイニングの結果により、ミクロビリジンの生合成に関わる遺伝子クラスターはかなり広範に存在し、プロテオバクテリア門やバクテロイデス門の多くの種でも見られることが分かった 。ミクロビリジンは、RiPPsファミリーの一つである。 最初のミクロビリジンは、Microcystis viridisから単離され、その構造は1990年に報告された。2種類の特化したATP-graspリアーゼの酵素活性に由来する三環のデプシペプチドであり、前駆ペプチドのコア部分に2つのラクトン環と1つのラクタム環を持つ。.

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ノーベル化学賞

ノーベル化学賞(ノーベルかがくしょう、Nobelpriset i kemi)はノーベル賞の一部門。アルフレッド・ノーベルの遺言によって創設された6部門のうちの一つ。化学の分野において重要な発見あるいは改良を成し遂げた人物に授与される。 ノーベル化学賞のメダルは、表面にはアルフレッド・ノーベルの横顔(各賞共通)、裏面には宝箱を持ち雲の中から現れた自然の女神のベールを科学の神が持ち上げて素顔を眺めている姿(物理学賞と共通)がデザインされている。.

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ノーベル生理学・医学賞

ノーベル生理学・医学賞(ノーベルせいりがく・いがくしょう、Nobelpriset i fysiologi eller medicin)はノーベル賞6部門のうちの一つ。「生理学および医学の分野で最も重要な発見を行った」人物に与えられる。選考はカロリンスカ研究所のノーベル賞委員会が行う。 ノーベル生理学・医学賞のメダルは、表面にはアルフレッド・ノーベルの横顔(各賞共通)、裏面には膝の上に本を広げつつ、病気の少女のために岩から流れる水を汲んでいる医者の姿がデザインされている。.

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チロシンtRNAリガーゼ

チロシンtRNAリガーゼ(Tyrosine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-チロシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-チロシル-tRNATyrの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-チロシン:tRNATyrリガーゼ(AMP生成)(L-tyrosine:tRNATyr ligase (AMP-forming))である。この酵素は、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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チオストレプトン

チオストレプトン(英:Thiostrepton)とはストレプトマイセス属の細菌によって生合成される、環形オリゴペプチド系(チオペプチド系)抗生物質であり、複素環含有リボソーム翻訳系翻訳系複素環ペプチド(RiPPs)に分類される。Streptomyces azureusやStreptomyces laurentiiなどから単離することができる。.

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バリンtRNAリガーゼ

バリンtRNAリガーゼ(Valine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-バリンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-バリル-tRNAValの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-バリン:tRNAValリガーゼ(AMP生成)(L-Valine:tRNAVal ligase (AMP-forming))である。バリルtRNAシンターゼ、バリントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、バリン、ロイシン、イソロイシンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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バレンセン

バレンセン()は、柑橘類に含まれるセスキテルペンの一種である。バレンシアオレンジなどから安価に採取できる。グレープフルーツの香気成分であり、ココアにも含まれる。複数の異性体があるが、柑橘類からは(+)-バレンセンが発見されている。ファルネシル二リン酸からCVS酵素により生合成される。飲料などのフレーバーに0.9ppm以下程度使用されるほか、ノートカトンの合成原料にもなる。.

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ポドフィロトキシン

ポドフィロトキシン(podophyllotoxin, PPT、ポドフィロックス)は、ポドフィルム属植物の根および根茎に含まれる毒性リグナンである。コンジロックス(Condylox、局所ゲル剤)の商品名で、ある種のヒトパピローマウイルスが原因の外性器尖圭コンジローマの治療に用いられる。ポドフィロトキシンおよびその誘導体(エトポシド、テニポシド、エトポホス)は、瀉下薬、発疱薬、抗リウマチ薬、抗ウイルス薬、抗腫瘍剤と幅広く応用されている。これらの抗がん活性は精力的に研究されており、肺がん、リンパ腫、生殖器腫瘍などに対する治療に使用されている。.

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メチオニン

メチオニン(methionine)は、側鎖に硫黄を含んだ疎水性のアミノ酸である。 対応するコドンが単一なアミノ酸は2つだけであり、1つはAUGでコードされるメチオニン、もう1つはUGGでコードされるトリプトファンである。コドンAUGはリボソームにmRNAからのタンパク質翻訳を「開始」させるメッセージを送る開始コドンとしても重要である。結果として真核生物および古細菌では全てのタンパク質のN末端はメチオニンになる。しかしながら、これは翻訳中のタンパク質に限るものであり、普通は翻訳完了後に修飾を受けて取り除かれる。メチオニンはN末端以外の位置にも出現する。なお、ヒトにとってメチオニンは必須アミノ酸の1つである。.

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メルドニウム

メルドニウム(meldonium、ミルドロネート、mildronate、THP、MET-88、Mildronāts、Quaterine)は、狭心症治療薬として一部の国で使用される薬物。現在はラトビアの製薬会社Grindeksが生産してリトアニアとロシア連邦で使用されている。アメリカ食品医薬品局 (FDA) と日本の厚生労働省は認可しておらず、2018年時点で日本国内では販売されていない。.

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モミラクトンB

モミラクトンB(momilactone B)は、イネ(Oryza sativa L.)の根で生産されるアレロパシー物質の一種である(乾燥もみ殻200 kgから100 mg)。イネ苗の根によって高濃度で生産されることが明らかにされている。モミラクトンBの生産はまた、イネいもち病菌(Magnaporthe grisea syn.

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モノリグノール

モノリグノール類の構造 モノリグノール (monolignol) はリグニンやリグナン生合成の原料となるヒドロキシケイ皮アルコール類縁体である。モノリグノールはアミノ酸であるフェニルアラニンから生合成される。なお、イネ科植物においてはチロシンを前駆体とする場合もある。モノリグノール生合成の第一段階はフェニルプロパノイド経路と共通しており、モノリグノールはフェニルプロパノイドに分類される。主要なモノリグノールとしては、コニフェリルアルコール、シナピルアルコール、p-クマリルアルコール (paracoumaryl alcohol) がある。植物はそれぞれの種が異なったモノリグノールを使用している。例えば、オウシュウトウヒに含まれるリグニンがほぼ完全にコリフェリルアルコール由来である様に裸子植物のリグニンはコニフェリルアルコールに由来するグアイアシル・リグニン(Gリグニン)である。一方、被子植物のリグニンにはGリグニンとシナピルアルコールに由来するシリンギル・リグニン(Sリグニン)が含まれる。なお、被子植物の中でもイネ科植物の草本リグニンはGリグニンとSリグニンの他、p-クマリルアルコールに由来するp-ヒドロキシフェニル・リグニン(Hリグニン)を多量に含んでいる特徴を持つ。Hリグニンは草本リグニンに特徴的であり、裸子植物や他の被子植物のリグニンにはほとんど含まれていない。その他、茎の曲がった部分に生じるあて材や植物の生育条件や生育時期によってリグニンの合成に用いられるモノリグノールの割合は変化する。 モノリグノールは、細胞質基質においてグルコシド(glucoside、グルコース配糖体)として合成される。グルコースが付加することにより、水溶性となり毒性が低減される。これらのグルコシドはモノリグノールの残基によってコニフェリンとかシリンギンと呼ばれる。これらのグルコシドは細胞膜を経由してアポプラスト (apoplast) へ輸送される。ここでグルコースが除去され、ペルオキシダーゼやラッカーゼによるモノリグノールの重合によりリグニンが生成する。.

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ラモプラニン

ラモプラニン(英:ramoplanin)は、アクチノプラネス属のATCC 33076株から単離される、グリコリポデプシペプチド系の抗生物質である。.

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リコペン

リコペン (リコピン、lycopene) は、カロテンの1種で、鮮やかな赤色を呈す有機化合物である。.

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リシンtRNAリガーゼ

リシンtRNAリガーゼ(Lysine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-リシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-リシルtRNALysの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-リシン:tRNALysリガーゼ(AMP生成)(L-Lysine:tRNAIle ligase (AMP-forming))である。リシントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、リシンの生合成、アミノアシルtRNAの生合成、及び筋萎縮性側索硬化症の3つの代謝経路に関与している。.

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リゾホスファチジン酸

リゾホスファチジン酸(Lysophosphatidic acid、LPA)は、シグナリング分子の働きをするリン脂質誘導体であり、ホスファチジン酸合成の中間生成物でもある。その生合成にはいくつかの潜在的ルートがあるが、もっともよく特徴付けられているのは、オートタキシンと呼ばれるリゾホスホリパーゼDによるものであり、リゾホスファチジルコリンからコリンを除去する。 LPAは、LPA1、LPA2、およびLPA3(またはEDG2、EDG4、およびEDG7)と呼ばれる3つの高親和性Gタンパク質共役受容体の活性化のためのマイトジェンとして作用する。加えて、LPA受容体としてLPA4 (p2y9/GPR23)、LPA5 (GPR92) そして LPA6 (GPR87)が最近確認された。 細胞増殖を刺激するため、異常なLPAシグナリングは多くの経路で癌へリンクする。オートタキシンまたはLPA受容体の異常調節は腫瘍形成と転移に寄与する過剰増殖を誘導する。.

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ルシフェリン

ホタルルシフェリンの構造式 ルシフェリン (luciferin) とは、ルシフェラーゼによって酸化されて発光する物質の総称であり、ホタル、深海魚、微生物などが起こす生物発光の源である。発光素とも言う。 その基本骨格はイミダゾピラジノンであり、多くの互変異性体がある。生合成には、イソロイシン、アルギニン、トリプトファンの三種のアミノ酸が含まれる。.

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ロドストレプトマイシン

ドストレプトマイシン(Rhodostreptomycin) は、ストレプトマイセス・パダヌスから遺伝子の水平伝播を受けたロドコッカス・ファシアンスによって生合成された、新しい構造を持つアミノグリコシド系抗生物質である。ロドストレプトマイシンは、米国のマサチューセッツ工科大学生物学部アンソニー・シンスキー研究室のクロサワ・カズヒコらによって2008年に発見、構造の同定がなされた。.

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ロイシンtRNAリガーゼ

イシンtRNAリガーゼ(Leucine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-ロイシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-ロイシルtRNALeuの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-ロイシン:tRNATyrリガーゼ(AMP生成)(L-leucine:tRNATrp ligase (AMP-forming))である。ロイシルtRNAシンセターゼ、ロイシントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、バリン、ロイシン、イソロイシンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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ロキソプロフェン

プロフェン(Loxoprofen)、プロピオン酸系の消炎鎮痛剤。商品名はロキソニン(Loxonin)で、第一三共が発売し、後発医薬品も各社から発売されている。現在、日本・メキシコ・ブラジルでよく使用されている抗炎症薬の一つである。.

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トランスケトラーゼ

トランスケトラーゼ(Transketolase)は、全ての生物が持つペントースリン酸経路と、光合成のカルビン回路に関与する酵素である。この酵素は、これら2つの経路で反対方向に進む2つの重要な反応を触媒する。非酸化的なペントースリン酸経路の最初の反応では、補因子のチアミンピロリン酸が5炭素のケトース(D-キシルロース-5-リン酸)から2つの炭素を受け取り、これを5炭素のアルドース(D-リボース-5-リン酸)に転移させ、7炭素のケトース(セドヘプツロース-7-リン酸)を形成する。2つの炭素を取られたD-キシルロース-5-リン酸は、3炭素のアルドースであるグリセルアルデヒド-3-リン酸になる。カルビン回路では、トランスケトラーゼは逆の反応を触媒し、セドヘプツロース-7-リン酸とグリセルアルデヒド-3-リン酸をアルドースのD-グリセルアルデヒド-3-リン酸及びケトースのD-キシルロース-5-リン酸に変換する。 ペントースリン酸経路でトランスケトラーゼによって触媒される2つめの反応でも、同じようにチアミンピロリン酸がD-キシルロース-5-リン酸から2炭素をエリトロース-4-リン酸に転移し、フルクトース-6-リン酸とグリセルアルデヒド-3-リン酸を形成する。カルビン回路でも全く同じ反応が逆向きに起きる。さらに、カルビン回路ではこれがトランスケトラーゼによって触媒される最初の反応となる。 哺乳類では、トランスケトラーゼはペントースリン酸経路と解糖系を繋げ、過剰の糖リン酸を炭水化物代謝経路に供給している。この存在は、特に脂肪酸を合成する肝臓や乳腺、ステロイドの合成を行う肝臓や副腎等の生合成の盛んな組織で、NADPHの生産に不可欠である。チアミンピロリン酸は、カルシウムとともに必須の補因子である。 トランスケトラーゼは、哺乳類の角膜で角膜角質細胞によって大量に発現し、角膜のクリスタリンの1つになっていると言われている。.

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トリプトファンtRNAリガーゼ

トリプトファンtRNAリガーゼ(Tryptophan—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-トリプトファンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-トリプトフィルtRNATrpの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-トリプトファン:tRNATyrリガーゼ(AMP生成)(L-tryptophan:tRNATrp ligase (AMP-forming))である。この酵素は、トリプトファンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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トレオニン

トレオニン (threonine) はアミノ酸の一種で、側鎖にヒドロキシエチル基を持つ。読みの違いでスレオニンと表記されることも多い。略号は Thr または T。トレオースに構造が似ていることから命名された。 極性無電荷側鎖アミノ酸に分類される。必須アミノ酸の1つ。穀物中のトレオニン含量は比較的高いが、消化吸収が悪い。糖原性を持つ。 遺伝子中ではコドンACU、ACC、ACA、ACGによってコードされている。 光学活性中心を2つ持つため4つの異性体がある。すなわち L-トレオニンには2つのジアステレオマーが存在するが、(2S,3R) 体のみが L-トレオニンと呼ばれる。(2S,3S) 体は天然にはほとんど存在せず、L-アロトレオニン (L-allo-threonine) と呼ばれる。 側鎖のヒドロキシ基にグリコシル化を受け、糖鎖を形成する。トレオニンキナーゼの作用によりリン酸化され、ホスホトレオニンとなる。トレオニンを多く含む食品としてカッテージチーズ、鶏肉、魚、肉、レンズマメが挙げられる。.

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トレオニンtRNAリガーゼ

トレオニンtRNAリガーゼ(Threonine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-トレオニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-トレオニルtRNAThrの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-トレオニン:tRNAThrリガーゼ(AMP生成)(L-Threonine:tRNAThr ligase (AMP-forming))である。トレオニントランスラーゼ、トレオニルtRNAシンターゼ、TRS等とも呼ばれる。この酵素は、グリシン、セリン、トレオニンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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ヘミセルロース

ヘミセルロース(hemicellulose)は植物細胞壁に含まれる、セルロースを除く水に対して不溶性の多糖類の総称。 1891年にE.シュルツェによって発見される。発見当初はセルロース生合成の中間体と見なされていたが、現在では別の多糖であることが知られている。植物の細胞壁でリグニンやセルロースと共に複合体を形成しており、その存在比は植物によって異なるがおおよそ30%前後である。成分はキシランやマンナンのほか、グルコマンナンやグルクロノキシランなどのような複合多糖もある。キシランはキシロースの材料として工業的に利用されている。また、食品に含まれている食物繊維の一部を占める。 へみせるろおす.

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ブラシノステロイド

ブラシノリド(ブラシノステロイドの一種)の構造式 ブラシノステロイド (brassinosteroid, BR) は、植物ホルモンの一種。ステロイド骨格をもつ化合物の一群である。植物体全身の伸長成長、細胞分裂と増殖、種子の発芽などを促進する。またストレス耐性を誘導するが、これらの作用のほとんどは他の植物ホルモンと関連してはたらくものが多い。 1979年のブラシノリドの単離以後、70種類以上のブラシノステロイド類縁体が植物から単離されている。1997年に、細胞膜上のブラシノステロイド受容体としてBRI1 (BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1) が同定されている。.

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ブラシカステロール

ブラシカステロール (brassicasterol) は28個の炭素からなる骨格を持つステロールであり、単細胞の藻類(植物プランクトン)やアブラナ (Brassica) などの陸生植物によって生合成される。生態系中における(海洋性)藻類の存在を示す生物マーカーとしてしばしば使われる。.

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ブラストサイジンS

ブラストサイジンS()は抗生物質の一種で、主に農業用殺菌剤として使われた。.

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ブリオスタチン

ブリオスタチン類 (bryostatins) は、フサコケムシ Bugula neritina (外肛動物の一種)から単離されるマクロラクトン化合物(マクロライド)である。主要な成分であるブリオスタチン1に関する研究は、Pettitらのグループにより1968年から始まり、1982年にX線結晶構造解析によって構造決定された。以後、ブリオスタチン1からブリオスタチン20までを含め、20種類以上の類縁体がフサコケムシから単離、同定されている総説: 総説: 。 ブリオスタチン類はフサコケムシ自身が生産しているのではなく、フサコケムシの共生微生物がフサコケムシ幼生のための防御物質として生産している。ブリオスタチンは細胞毒性を示すことから、抗がん剤としての臨床試験が行われている。また、アルツハイマー病治療薬としての臨床試験も行われている。 ブリオスタチン1は、発がんプロモーターである12-''O''-テトラデカノイルホルボール 13-アセタート (TPA) と同様にプロテインキナーゼCの強力な活性化剤であるが、TPAのアンタゴニストとしての作用(抗発がんプロモーション作用等)を示す。.

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プロリンtRNAリガーゼ

プロリンtRNAリガーゼ(Proline—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-プロリンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-プロリルtRNAProの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-プロリン:tRNAProリガーゼ(AMP生成)(L-Proline:tRNAPro ligase (AMP-forming))である。プロリルtRNAシンターゼ、プロリントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アルギニン、プロリンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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プロピザミド

プロピザミド()は、酸アミド系除草剤の一種である。.

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プロテオグリカン

プロテオグリカン(Proteoglycan)は、特殊な構造をもつ糖とタンパク質の複合体で、複合糖質の一種である。「プロテオ」はプロテインつまりタンパク質、「グリカン」は多糖類を意味する。 動物学におけるプロテオグリカンは、動物特有の成分であるグリコサミノグリカン(多糖類)とコアタンパク質(糖鎖が結合する “芯”となるタンパク質)が一定の様式で結合したものを指し、グリコサミノグリカンとしてはヒアルロン酸やコンドロイチン硫酸が有名である。臓器、脳、皮膚を始めとした体全体の組織中の細胞外マトリックスや細胞表面に存在するほか、軟骨の主成分としても存在している。 植物学におけるプロテオグリカンは、植物特有の成分であるアラビノガラクタン(多糖類)とコアタンパク質が一定の様式で結合したものを指し、正式にはアラビノガラクタン-プロテイン(AGP)と呼ばれている。細胞壁や樹液に細胞外マトリックスとして存在する。.

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プロストラチン

プロストラチン (prostratin, 12-deoxyphorbol 13-acetate) はサモアのママラ(Homalanthus nutans、トウダイグサ科)の木に含まれているプロテインキナーゼC活性化剤である。プロストラチンは1976年に、オーストラリアのピメレア属(ジンチョウゲ科)植物 Pimelea prostrata から新規ホルボール類縁体として初めて単離された。後に、民族植物学者のポール・アラン・コックスとアメリカ国立癌研究所 (NCI) の研究チームが行った、サモア人ヒーラーの伝統的な知識に関する研究で、プロストラチンの抗ウイルス活性が発見された。サモア人ヒーラーは肝炎の治療にママラの木を用いていた。ホルボールエステル類縁体はCD4+T細胞(ヘルパーT細胞)に潜伏しているヒト免疫不全ウイルス (HIV) を活性化させ、健康な細胞へのウイルスの感染を阻害する。プロストラチンは発がんプロモーション活性を示さないことから、HIV感染に対する治療に有用である可能性が示された。.

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プロスタグランジン

プロスタグランジン (prostaglandin, PG) は、プロスタン酸骨格をもつ一群の生理活性物質。アラキドン酸から生合成されるエイコサノイドの 1 つで、様々な強い生理活性を持つ。プロスタグランジンとトロンボキサンを合わせてプロスタノイドという。.

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パクロブトラゾール

パクロブトラゾール(paclobutrazol, PBZ, IUPAC名: (2RS, 3RS)-1-(4-chlorophenyl)-4,4-dimethyl-2-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)pentan-3-ol)は植物成長調整剤、トリアゾール系殺菌剤の一種。植物ホルモンジベレリンの生合成を阻害することで、節間伸長の抑制による茎を太くする、根の生長、早期着果および結実などを、トマトやコショウにおいて引き起こす。PBZは、植物の寒冷に対する感受性を低下させる。PBZは、茎葉部の生長阻害を目的として樹木医に用いられるが、その他の有用な効果を樹木に与える。例えば、乾燥ストレスへの耐性の改善、深緑色の葉、カビやバクテリアへの抵抗性、根の成長の促進などである。いくつかの木の種では、形成組織および茎葉部の成長の抑制が見られる。 PBZは、ジベレリンの生合成経路において、ent-kaureneからent-kaurenoic acidへの反応を触媒するシトクロムP450を阻害する。.

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ヒスチジンtRNAリガーゼ

ヒスチジンtRNAリガーゼ(Histidine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-ヒスチジンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-ヒスチジルtRNAHisの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-ヒスチジン:tRNAHisリガーゼ(AMP生成)(L-Histidine:tRNAHis ligase (AMP-forming))である。ヒスチジルtRNAシンターゼ、ヒスチジントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、ヒスチジンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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ビフェニル

ビフェニル(biphenyl)とは、分子式 C12H10、構造式 C6H5-C6H5のポリフェニル系炭化水素で、2つのフェニル基が単結合で共有結合した構造を持つ芳香族炭化水素である。Ph2 とも表記される。 コールタール中に存在し、ベンゼンを赤熱した環に通じると生成する。 常温常圧では白色結晶の固体である。固体のビフェニルは2つのベンゼン環は同一平面上にあるが、溶液または気相では約45°ねじれていることが知られている。 1937年頃からイスラエルで使用され,防ばい効果が認められて欧米でも使用されるようになったのを受けて、日本でも柑橘類の防かび剤(食品添加物扱い)として用いられているが、最近では耐性菌が見られるようになり、あまり使用されていない。.

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ビオチン

ビオチン(biotin)とは、D- のこと。ビタミンB群に分類される水溶性ビタミンの一種で、ビタミンB7(Vitamin B7)とも呼ばれるが、欠乏症を起こすことが稀なため、単にビオチンと呼ばれることも多い。.

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ビタミンC

ビタミンC (vitamin C, VC) は、水溶性ビタミンの1種。化学的には L-アスコルビン酸をさす。生体の活動においてさまざまな局面で重要な役割を果たしている。食品に含まれるほか、ビタミンCを摂取するための補助食品もよく利用されている。WHO必須医薬品モデル・リスト収録品。 壊血病の予防・治療に用いられる。鉄分・カルシウムなどミネラルの吸収を促進する効果があるが、摂取しすぎると鉄過剰症の原因になることがある。風邪を予防することはできない。.

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ビサボレン

ビサボレン()はセスキテルペンの一種で、天然にはレモン、ライム、ベルガモット、クスノキ、スターアニス、カルダモン、サンダルウッドなどの精油中に広く存在する。ビサボレンの誘導体の中には、ミバエやカメムシなど昆虫のフェロモンとして作用するものがある。生物学的な役割は未解明であるが、いくつかの真菌が本物質を産出することが確認されている。.

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ピノバンクシン

ピノバンクシン(Pinobanksin)は、抗酸化物質のフラバノノールである。低比重リポタンパク質の脂質過酸化反応を阻害し、還元α-トコフェロールラジカルの電子供与体となる。ヒマワリの蜂蜜中で見られる。 ピノバンクシンは、ピノセムブリンから生合成される。.

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ピノセムブリン

ピノセムブリン(Pinocembrin)は、フラバノンである。ダミアナ、蜂蜜、プロポリスから見つかる抗酸化物質である。 ピノセムブリンは、ケトン隣接基のヒドロキシル化によってピノバンクシンに生合成される。.

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ピクテ・スペングラー反応

ピクテ・スペングラー反応(—はんのう、Pictet-Spengler reaction)とは、有機化学における化学反応のひとつで、トリプタミンのようなβ-アリールエチルアミンとアルデヒドを縮合させ閉環させる反応である。1911年にピクテとスペングラーにより報告された。通常は酸性条件下、加熱することで反応が進行するが、反応性の高い基質は生理的条件下でも良好に反応が進行する。.

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テルペン

テルペン (terpene) はイソプレンを構成単位とする炭化水素で、植物や昆虫、菌類などによって作り出される生体物質である。もともと精油の中から大量に見つかった一群の炭素10個の化合物に与えられた名称であり、そのため炭素10個を基準として体系化されている。分類によってはテルペン類のうち、カルボニル基やヒドロキシ基などの官能基を持つ誘導体はテルペノイド (terpenoid) と呼ばれる。それらの総称としてイソプレノイド (isoprenoid) という呼称も使われる。テルペノイドは生体内でメバロン酸から生合成される。.

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テヌアゾン酸

テヌアゾン酸(テヌアゾンさん、tenuazonic acid)はアルテルナリア属真菌によって生産されるマイコトキシンである。テヌアゾン酸は強力な真核生物のである。1958年にから単離され、翌1959年に構造決定された。 テヌアゾン酸はTPAによるマウス皮膚発がんプロモーションを阻害した。.

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デサチュラーゼ

デサチュラーゼ(desaturase)は、炭化水素鎖から2個の水素原子を除去する酵素で、炭素-炭素二重結合を生成する。不飽和化酵素とも。デサチュラーゼは以下のように分類される。.

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フラノクマリン

フラノクマリンまたはフロクマリン(furanocoumarin, furocoumarin)類は、様々な植物によって産生される有機化合物の一種である。フラノクマリン類は、ジメチルアリル二リン酸 (DMAPP) および7-ヒドロキシクマリン(ウンベリフェロン)のカップリングによって生合成される。ウンベリフェロンおよびDMAPPはそれぞれ、フェニルプロパノイド経路およびメバロン酸経路によって生合成される。 フラノクマリンの化学構造は、フラン環とクマリンが縮環した構造をしている。フラン環が様々な方法で縮環することによって、いくつかの異性体が生成する。最も一般的な2つの母核構造はプソラレン (psoralen) およびアンゲリシン (angelicin) である。これら2つの母核構造の誘導体は、それぞれ直線型 (linear) フラノクマリン、角度型 (angular) フラノクマリンと呼ばれる。 多くのフラノクマリン類は毒性があり、植物は昆虫からほ乳類まで様々なタイプの捕食者に対する防御機構の一つとしてこれらの化合物を生産している。この種のフィトケミカルは、パースニップやジャイアント・ホグウィードの汁に曝された際に見られる植物性光線皮膚炎 (phytophotodermatitis) の原因である。 フラノクマリン類は、その他の生物学的効果を示す。例えば、ヒトにおいて、ベルガモチン (Bergamottin) やジヒドロキシベルガモチンは、グレープフルーツの薬物相互作用の原因である。これらのフラノクマリン類はある種の薬の代謝に影響を及ぼす。また、グレープフルーツやベルガモットなどの柑橘類の精油は、上記の光線過敏を引き起こすフラノクマリン類が含まれているため、外用するに当たってはフラノクマリン類を取り除いてあるかどうか確認する必要がある。.

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フラボノイド

フラボノイド (flavonoid) は天然に存在する有機化合物群で、クマル酸CoAとマロニルCoAが重合してできるカルコンから派生する植物二次代謝物の総称。いわゆるポリフェノールと呼ばれる、より大きな化合物グループの代表例。その中にアントシアニン、カテキンやフラバンを含む広い概念で、付着する糖のバリエーションを考慮すると7,000以上の構造が知られている。フラボンやアントシアニンは天然色素として用いられる。また花の色素として知られるアントシアニンは紅葉(赤色)の原因でもある。フラボノイドのうち、クエルセチン、ヘスペリジンなどをあわせてビタミンPと呼ぶこともある。しかし、日本ビタミン学会はビタミンPをビタミン様物質として規定している。つまり、ビタミンPはビタミンではない。 シキミ酸経路でできるフェニルアラニンの脱アミノで生成するクマル酸が補酵素Aと結合してクマル酸CoA(4-クマロイルCoA)ができる。次に酢酸マロン酸経路のマロニルCoA、3分子がそれと反応してカルコンが生成する。カルコンからフラバノンを経てジヒドロフラボノールが生成し、ジヒドロフラボノールからフラボノール、アントシアニ(ジ)ンやプロアントシアニジン(タンニン)誘導される。.

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フロログルシノール

フロログルシノール(phloroglucinol)は、医薬品や爆薬の合成に使われる有機化合物である。フロログルシノールはフェノール型である1,3,5-トリヒドロキシベンゼンと、ケトン型である1,3,5-シクロヘキサトリオン(フロログルシン)の2種の互変異性体が存在し、それぞれ化学平衡の関係にある。フロログルシノールは多官能性であることから有機合成における中間体として便利である。 フロログルシノール二水和物の結晶の融点は116-117 であるが、無水和物の融点は218-220 と高い。沸騰はせず、昇華性を持つ。.

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ファルネシル二リン酸

ファルネシル二リン酸()またはファルネシルピロリン酸 とは、テルペン、テルペノイド、ステロイドを生合成するメバロン酸経路の中間体となる物質である。 ユビキノンの合成に電子伝達系の一部として用いられ、またスクアレン、ドリコールの前駆体となるジヒドロドリコール二リン酸、ゲラニルゲラニル二リン酸の前駆体となる。.

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フィラグリン

フィラグリン(Filaggrin)は、表皮の顆粒細胞で産生される塩基性タンパク質の一種であり、皮膚のバリア機能に欠かすことのできない角質層を形成するにあたり、ケラチンとともに重要な役割を担っている。前駆体のプロフィラグリンとして生合成され、角質層が形成される段階で、リン酸プロフィラグリンが脱リン酸化と加水分解を受けて分解し、フィラグリンが作られる。プロフィラグリンは、フィラグリンが10~12個繋がった巨大なタンパク質である。フィラグリンは、ケラチンと凝集・結合し、ケラチン・パターンを構成するが、最終的にはフィラグリンは角質上層でアミノ酸などの低分子まで分解される。フィラグリンが作られないと角質に異常がおこり、皮膚のバリア機能が低下し、皮膚炎の原因となる。別名ヒスチジン・リッチ・プロテイン。 アトピー性皮膚炎の患者に、フィラグリンの遺伝子異常が多く見つかっていて、アトピー性皮膚炎治療の鍵となる物質として、注目されている。また、尋常性魚鱗癬の患者は、フィラグリンの発現が極度に低下していることが分かっている。 Category:構造タンパク質.

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フィトンチッド

Fitoncidas Fitoncidios Phytoncide Phytoncides International Forest Medicine フィトンチッド(phytoncide)とは、微生物の活動を抑制する作用をもつ、樹木などが発散する化学物質。植物が傷つけられた際に放出し、殺菌力を持つ揮発性物質のことを指す。 森林浴はこれに接して健康を維持する方法だが、健康だけでなく癒しや安らぎを与える効果もある。フィトンチッドはその殺菌性や森林の香りの成分であるということから良いイメージがあり、森林浴の効能を紹介する際に良く用いられている。.

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フェニルプロパノイド

フェニルプロパノイド (phenylpropanoid)、別名リグノイド (lignoid) はフェニルアラニンを起源とする、1-フェニルプロパン (C6C3) が複数縮合した形の化合物およびその化合物の誘導体の総称である。維管束植物で見られ、ポリフェノールと呼ばれる化合物の一部はこれに含まれる。主たる物質の例としてリグニン、リグナンやタンニン、スベリン等がある。 フェニルプロパノイドの生合成はフェニルアラニンの脱アミノ化によってケイヒ酸ができるところから始まる。ケイヒ酸はパラ位に水酸化を受け 4-クマル酸となる。ここから様々な生合成過程を経るが、詳細な反応については各項に譲る。 多くの場合ベンゼン環がヒドロキシ基で修飾されており、還元剤として働く性質がみられる。また、殺菌作用のあるものも多い。ウルシの樹液や松脂等に大量に存在する。.

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フェニルアラニン

フェニルアラニン (phenylalanine) はアミノ酸の一種で、側鎖にベンジル基を持つ。略号は Phe または F。アラニンの側鎖の水素原子が1つフェニル基で置き換えられた構造を持つことが名称の由来である。室温では白色の粉末性固体である。.

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フェニルアラニンtRNAリガーゼ

フェニルアラニンtRNAリガーゼ(Phenylalanine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-フェニルアラニンとtRNAPheの3つの基質、AMPと二リン酸とL-フェニルアラニルtRNAPheの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-フェニルアラニン:tRNAPheリガーゼ(AMP生成)(L-phenylalanine:tRNAPhe ligase (AMP-forming))である。フェニルアラニルtRNAシンターゼ、フェニルアラニントランスラーゼ、PheRS等とも呼ばれる。この酵素は、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。 フェニルアラニンtRNAリガーゼは、アミノアシルtRNA合成酵素の中で最も複雑な酵素であることが知られている。細菌及びミトコンドリアのフェニルアラニンtRNAリガーゼは、挿入のないα+βモチーフを持つフェレドキシンフォールドのアンチコドン結合(FDX-ACB)ドメインを共有している。FDX-ACBドメインは、2つのαヘリックスを含む4鎖の逆平行βシートから構成される典型的なRNA認識フォールド(RRM)を示す。.

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フェニルケトン尿症

フェニルケトン尿症 (ふぇにるけとんにょうしょう、Phenylketonuria) とは、先天的な酵素(または補酵素)の異常によって、フェニルアラニンの代謝が阻害され起こる疾病である。頭字語のPKUで呼ばれることもある。.

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ドコサヘキサエン酸

ドコサヘキサエン酸(ドコサヘキサエンさん、Docosahexaenoic acid、略称 DHA )は、不飽和脂肪酸のひとつで、僅かに黄色を呈する油状物質。 分子式 C22H32O2、示性式 CH3CH2(CH.

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ニコチアナミン

ニコチアナミン (nicotianamine) は、ムギネ酸生合成における中間体の一つ。化学式はC12H21N3O6。金属キレート分子であり、高等植物に普遍的に存在する。 ニコチアナミンシンターゼ (EC 2.5.1.43) によって3分子の''S''-アデノシル-L-メチオニン (SAM) から合成され、ニコチアナミンアミノトランスフェラーゼ (EC 2.6.1.80) によって3-デアミノ-3-オキソニコチアナミンに変換される。 アンジオテンシン変換酵素の阻害剤であり、抗高血圧作用を示す。.

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ホモセリン

ホモセリン(homoserine)は、化学式HO2CCH(NH2)CH2CH2OHのα-アミノ酸の一種。イソスレオニン(isothreonine)とも呼ばれる。L-ホモセリンはDNAにコードされた一般的なアミノ酸の一つではない。タンパク質を構成するアミノ酸であるセリンとは、メチレン基が一つ挿入されている違いがる。ホモセリンあるいはそのラクトン型は、臭化シアンを用いたメチオニンの分解によるペプチドの切断の生成物である。 ホモセリンは、3種の必須アミノ酸(メチオニン、スレオニン、イソロイシン)の生合成中間体である。ホモセリンは、アスパラギン酸セミアルデヒドを介したアスパラギン酸の2段階の還元によって形成される 。.

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ベンチオカーブ

ベンチオカーブ(、ベンチオカルブ)はチオカルバマートの一種。チオベンカルブ( )とも呼ばれ、除草剤として用いられる。.

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アラニンtRNAリガーゼ

アラニンtRNAリガーゼ(Alanine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アラニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アラニル-tRNAAlaの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アラニン:tRNAAlaリガーゼ(AMP生成)(L-Alanine:tRNAAla ligase (AMP-forming))である。アラニルtRNAシンターゼ、アラニントランスラーゼ、AlaRS等とも呼ばれる。この酵素は、アラニン、アスパラギン酸の生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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アリルグリシン

アリルグリシン(Allylglycine)はグリシンの誘導体の一つ。テングタケ、タマシロオニタケなどのテングタケ科のキノコに含まれる毒成分の一つである。 アリルグリシンは、グルタミン酸デカルボキシラーゼ(GAD)の酵素阻害剤である。グルタミン酸デカルボキシラーゼが阻害されることによりGABAの生合成が抑制され、結果神経伝達物質の量が低下すると考えられている。動物実験において、アリルグリシンはおそらくGAD阻害活性によると見られる痙攣発作を引き起こすことが知られている。.

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アルバート・ラスカー基礎医学研究賞

アルバート・ラスカー基礎医学研究賞(アルバート・ラスカーきそいがくけんきゅうしょう)は、アルバート・ラスカー医学研究賞の一部門。ラスカー財団によって授与される国際的な医学賞の一つで、障害や死の原因を取り除くための技術・情報・概念をもたらす基礎的な発見を成し遂げた科学者を対象とする。 ノーベル生理学・医学賞の受賞者がそれに先行して本賞を受賞している場合が多く、その割合は約50%に達する。.

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アルビノ

アルビノのペンギン アルビノ(albino)は、動物学においては、メラニンの生合成に係わる遺伝情報の欠損により先天的にメラニンが欠乏する遺伝子疾患がある個体である。 は元はスペイン語ないしポルトガル語で、albo(白)の語幹 alb- に in(指小辞)+ o(男性形名詞語尾) をつけた語である。正確には、疾患それ自体はアルビニズム という。ヒトの個体のことも、政治的正しさからは「アルビノ」より「アルビニズムの人」の方が好ましいという主張もある。アルビニズムの対義語(メラニン沈着症)は である。 この遺伝子疾患に起因する症状は先天性白皮症(せんてんせいはくひしょう)、先天性色素欠乏症、白子症などの呼称がある。また、この症状を伴う個体のことを白化個体、白子(しらこ・しろこ) 「白子」という表現には差別的な意味合いが含まれているという見方もあり、近年では使用が避けられる傾向にある。などとも呼ぶ。さらに、アルビノの個体を生じることは白化(はくか・はっか)、あるいは白化現象という。 一方、植物学では、光合成色素を合成できない突然変異個体のことである。このような個体は独立栄養が営めないため、種子中の栄養を使い切ってしまった時点で枯死することになる。 本稿では、主として動物学用語としてのアルビノについて解説する。.

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アルカロイド

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アルカンニン

アルカンニン(alkannin)は、フランス南部で自生するルリジサから抽出される天然色素である。食品添加物や化粧品に使われる。オーストラリアでは食品用の赤茶色の着色料として使われ、欧州ではE番号がE103に指定されているが使用は既に承認されていない。.

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アルギニンtRNAリガーゼ

アルギニンtRNAリガーゼ(Arginine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アルギニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アルギニルtRNAArgの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アルギニン:tRNAArgリガーゼ(AMP生成)(L-Arginine:tRNAHis ligase (AMP-forming))である。アルギニルtRNAシンターゼ、アルギニントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アルギニン、プロリンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。N末端に、アルギニル tRNAシンテターゼN末端ドメインまたはアディショナルドメイン1(Add-1)と呼ばれる保存ドメインを持つ。このドメインは約140残基の長さで、tRNA認識に関わっていると考えられている。.

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アレクサンダー・トッド

トッド男爵、アレグザンダー・ロバータス・トッド(Alexander Robertus Todd, Baron Todd, 1907年10月2日 - 1997年1月10日)は、イギリスのスコットランド出身の生化学者。ヌクレオチド及びヌクレオシドの構造に関する研究とその生合成、並びにヌクレオチドを含む補酵素の研究によって1957年のノーベル化学賞受賞者となった。「トッド男爵」として一代貴族に叙されている。.

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アデノシン三リン酸

アデノシン三リン酸(アデノシンさんリンさん、adenosine triphosphate)とは、アデノシンのリボース(=糖)に3分子のリン酸が付き、2個の高エネルギーリン酸結合を持つヌクレオチドのこと。IUPAC名としては「アデノシン 5'-三リン酸」。一般的には、「adenosine triphosphate」の下線部のアルファベットをとり、短縮形で「ATP(エー・ティー・ピー)」と呼ばれている。.

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アグマチン

アグマチン(agmatine)は、アルギニンの脱炭酸化生成物であり、ポリアミン生合成の中間体である。神経伝達物質であると推測されている。脳で生産され、シナプス小胞に貯蔵される。摂取によって蓄積され、膜の脱分極によって放出され、アグマチナーゼによって不活化される。アグマチンはα2-アドレナリン受容体とイミダゾリン結合部位に結合し、NMDA型グルタミン酸受容体やカチオンリガンド依存性イオンチャネルをブロックする。アグマチンは一酸化窒素合成酵素の働きを阻害する。また、ペプチドホルモンの放出を促進する作用も持つ。.

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アザジラクチン

アザジラクチン(azadirachtin)はリモノイドに分類される天然有機化合物である。インドセンダン Azadirachta indica(ニーム)の木の種子に含まれている二次代謝産物。アザジラクチンは高度に酸化されたテトラノルトリテルペノイドであり、エノールエーテルやアセタール、ヘミアセタール、四置換オキシラン、カルボン酸エステルなど多くの酸素官能基を有する。.

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アザスピロ酸

アザスピロ酸(アザスピロさん、azaspiracid、略称: AZA)類は、海洋に生息する渦鞭毛藻Azadinium spinosumによって生合成される、海洋多環エーテル構造を持つ毒素である。ヒトに蓄積すると中毒の原因となる。 1990年代にアイルランドの産の汚染された貝類を摂取したことによりオランダで大規模な中毒が起こり、その後にアザスピロ酸が原因物質として初めて同定された。今日までに、20種類を超えるAZA類縁体が植物プランクトンおよび貝類において同定されている。西ヨーロッパや北アフリカ、南米、北米の多くの沿岸地域の貝類にAZA類が含まれていることが報告されている。加えて、日本のカイメンやスカンジナビアのカニからもAZA類が見出されている。驚くことでないが、AZA類の地球規模の分布はAzadinium属渦鞭毛藻の広い分布に対応しているように見える。経験的な証拠は、貝類におけるAZA類の蓄積がAZAを生産するA.

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アジサイ

アジサイ(紫陽花、学名 Hydrangea macrophylla)は、アジサイ科アジサイ属の落葉低木の一種である。広義には「アジサイ」の名はアジサイ属植物の一部の総称でもある。狭義には品種の一つ H. macrophylla f. macrophylla の和名であり、他との区別のためこれがホンアジサイと呼ばれることもある。原種は日本に自生するガクアジサイ H. macrophylla f. normalis である。.

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アスペルギルス・ニデュランス

アスペルギルス・ニデュランス(Aspergillus nidulans)は、''Aspergillus''属の中で研究者にとっては最も有名な糸状菌。古くから有性世代の存在が知られているため、モデル生物として古典遺伝学的手法による研究に用いられており、しばしば二次代謝産物生合成遺伝子の発現の宿主として使用される。有性世代が存在するため分類学上の正式な名称はEmericella nidulansであるが、一般的にはその無性世代に付けられた名称であるAspergillus nidulansが用いられることが多い。 糸状菌の研究で使用される発現プロモーターや選択マーカーなどもこの菌に由来するものが多い。Aspergillus属のなかで最初にゲノム配列が読まれた菌でもある(2005年に達成)。.

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アスパラギン酸tRNAリガーゼ

アスパラギン酸tRNAリガーゼ(Aspartate—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アスパラギン酸とRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アスパルチルtRNAAspの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アスパラギン酸:tRNAAspリガーゼ(AMP生成)(L-Aspartate:tRNAAsp ligase (AMP-forming))である。アスパルチルtRNAシンターゼ、アスパラギン酸トランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アラニンとアスパラギン酸の代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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アスパラギンtRNAリガーゼ

アスパラギンtRNAリガーゼ(Asparagine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アスパラギンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アスパラギニルtRNAAsnの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アスパラギン:tRNAAsnリガーゼ(AMP生成)(L-Asparagine:tRNAAsn ligase (AMP-forming))である。アスパラギニルtRNAシンターゼ、アスパラギントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アラニンとアスパラギン酸の代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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アセト乳酸

α-アセト乳酸(アルファ-あせとにゅうさん、英語:α-Acetolactic acid(α-acetolactate))はバリンやロイシンなど分枝鎖アミノ酸を生合成する際の前駆体である。α-アセト乳酸はピルビン酸との2つの物質から合成される。アセト乳酸デカルボキシラーゼによって脱炭酸され、アセトインとなる。.

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イミノ酸

イミノ酸(イミノさん、Imino acid)とは、分子中にイミノ基(>C.

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イリドイド

イリドイド(iridoid)は、二次代謝物の一種として多種多様な植物および動物にみられ、イソプレンより生合成されるモノテルペンで、多くの場合アルカロイド生合成の中間体である。化学的にはイリドイドは通常酸素などの複素6員環と融合した5員環からなる。イリドミルメクス属 (Iridomyrmex) のアリで防御化学物質として合成されるイリドミルメシンにより化学構造は例証され、はじめて単離されたことからイリドイドは名付けられた。.

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イソペニシリン-Nエピメラーゼ

イソペニシリン-Nエピメラーゼ(Isopenicillin N epimerase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の基質はイソペニシリン-N、生成物はペニシリン-Nである。 この酵素は異性化酵素、特にアミノ酸及びその誘導体に作用するラセマーゼ、エピメラーゼに分類される。系統名は、ペニシリンN 5-アミノ-5-カルボキシペンタノイル-エピメラーゼ(Penicillin N 5-amino-5-carboxypentanoyl-epimerase)である。この酵素は、ペニシリン及びセファロスポリンの生合成に関与している。.

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イソペニシリンNシンターゼ

イソペニシリンNシンターゼ(isopenicillin-N synthase、IPNS)は、ペニシリンおよびセファロスポリン生合成酵素の一つで、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 N--L-システイニル-D-バリン + O2 \rightleftharpoons イソペニシリンN + 2 H2O この酵素の基質はN--L-システイニル-D-バリンとO2で、生成物はイソペニシリンNとH2Oである。 この酵素は酸化還元酵素に属し、酸素を受容体としてX-HとY-HからのX-Y結合の形成に特異的に作用する。組織名はN--L-cysteinyl-D-valine:oxygen oxidoreductase (cyclizing) である。.

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イソロイシンtRNAリガーゼ

イソロイシンtRNAリガーゼ(Isoleucine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-イソロイシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-イソロイシルtRNAIleの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-イソロイシン:tRNAIleリガーゼ(AMP生成)(L-isoleucine:tRNAIle ligase (AMP-forming))である。イソロイシントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、バリン、ロイシン、イソロイシンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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ウリジン二リン酸グルクロン酸

ウリジン二リン酸グルクロン酸(ウリジンにリンさんグルクロンさん、Uridine diphosphate glucuronic acid、UDP-グルクロン酸、UDP glucuronic acid)は、ウリジン二リン酸 (UDP) にグルクロン酸がグリコシド結合したもの。糖ヌクレオチドの一種で、多糖の合成に使われる。また、アスコルビン酸の生合成の中間生成物である(サル目とテンジクネズミを除く)。 NAD+を補因子としてUDP-グルコース-6-デヒドロゲナーゼ(EC 1.1.1.22)によってUDP-グルコースから作られる。この物質は、グルクロン酸転移酵素反応におけるグルクロノシル基(グルクロン酸)の供給元である。.

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エラスチン

ラスチン()もしくは弾性線維(だんせいせんい)とはコラーゲンの線維を支える役割を持つ線維である。ヒトのエラスチン含有量は、項靱帯で約78~80%、動脈で約50%、肺で約20%、真皮で約2~5%を占める。ヒトだけでなく、ブタやウシ、ウマなどの哺乳類やその他では魚類などにも含まれている。エラスチンは皮膚や血管では年齢と共に減少し皺の原因となる。.

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エキソソーム複合体

ーム複合体 (又はPM/Scl複合体、単にエキソソームとも)は真核生物、古細菌の核に存在し、様々なRNAを分解する多タンパク複合体である。細菌ではデグラドソームと呼ばれる複合体が似た役割を果たす。 エキソソームの中心部は他のタンパクが付随した6つのタンパク質から構成されている。真核細胞では、エキソソームは細胞全体に存在するが、特に核小体に多い。だが、複合体を制御するタンパクが異なるため、存在する場所によって活性、基質特異性が異なる。エキソソームの基質はmRNA、rRNA、ncRNA等である。エキソソームはエキソリボヌクレアーゼ活性を有し、RNAを3'末端から分解する。また、真核細胞の場合はエンドリボヌクレアーゼ活性も有し、RNA鎖の途中を切断することもできる。 エキソソームを直接の原因とする疾患は知られていないが、幾つかの自己免疫疾患(特に筋炎/強皮症重複症候群)では、エキソソームの構成タンパクを標的とする自己抗体が生産される。エキソソームを阻害することで効果を示す癌化学療法剤もある。.

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エストロゲン受容体

トロゲン受容体(エストロゲンじゅようたい、英:Estrogen Receptor、ER)とはステロイド受容体スーパーファミリーに属する分子の一つである。卵胞ホルモン受容体とも呼ばれる。そもそもエストロゲンとはエストロン(E1)、エストラジオール(E2)およびエストリオール(E3)の3種類の分子を指しており、いずれもERとの結合能を有するが、中でも生体における産生量はE2が多い。エストロゲンはステロイドホルモンの一種であり、生殖機能の形成および細胞の増殖を促進する働きを持つ。その生理作用を発現するためには標的組織に存在しているERへの結合を介する必要がある。ERに対してリガンドが結合するとERは活性化を受けてDNAへの結合が促進され、遺伝子の転写を制御する転写因子として機能する。また、植物中に含まれるイソフラボンなどの分子(植物性エストロゲン)や内分泌撹乱物質もERに対して結合能を有し、作用を発現することが知られている。.

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オキサシリン

リン(oxacillin;OX)は、β-ラクタム系抗生物質でメチシリン類似の抗菌・耐性菌活性を示す抗生物質である。 メチシリンの代わりにメチシリン耐性黄色ブドウ球菌 (MRSA) 検査用に繁用される。経口、注射で投与される。母核構造として6-アミノペニシラン酸を持つ。.

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カマズレン

マズレン (Chamazulene) は、カモミール、ニガヨモギ、セイヨウノコギリソウ等の植物に含まれる、C14H16の分子式を持つ芳香族化合物である。カマズレンは、セスキテルペンであるマトリシンから生合成される青紫色のアズレン誘導体である。カマズレンは、in vivoで抗炎症作用を持つ。.

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カルニチン

ルニチン(carnitine)は、生体の脂質代謝に関与するビタミン様物質で、アミノ酸から生合成される誘導体である。動物の体内で生合成されるため必須アミノ酸ではない田島眞、 日本調理科学会誌 Vol.37 (2004) No.1 p.104-107, 。 立体異性体のうち脂質代謝に利用されるのは L-カルニチンのみであり、エナンチオマーのD-カルニチンは活性がないとされている。日本においては、食品分野で利用されるL-カルニチン、希少疾病用医薬品であるレボカルニチン、胃薬として使用されるDL-カルニチンがある。以下は特に断らない限りL体について記述する。分子式は C7H15NO3、分子量 161.20、CAS登録番号(L体)541-15-1。.

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カルコンイソメラーゼ

ルコンイソメラーゼ(Chalcone isomerase、)は、次の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の基質はカルコンのみであり、生成物はフラバノンのみである。 この酵素はイソメラーゼ、特に分子間リアーゼに分類される。系統名は、フラバノンリアーゼであり、カルコン-フラバノンイソメラーゼとも呼ばれる。フラボノイドの生合成に関与する。 ペチュニア(Petunia hybrida)のゲノムは、非常によく似た2つの酵素ChiA及びChiBをコードする遺伝子を含むが、ChiAのみが機能を有するカルコンイソメラーゼをコードしていると考えられている。.

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カロテン

テン、カロチン(carotene、carotine)は、カロテノイドのうち炭素と水素とから成る化合物の総称である。植物によって生合成されるが、動物は生合成することができない。カロテンは光合成において重要な橙色光合成色素の一つである。ニンジン(carota、carrot)の橙色の元であり、これがカロテンの語源となっている。しかし、ニンジンだけでなく多くの果物や野菜(例えばサツマイモやマスクメロン)に含まれている。枯れ葉の橙色や乳脂肪、バター、卵黄の黄色も、カロテンによる着色である。ヒトやニワトリの典型的な黄色脂肪は、それら食物由来のカロテンの脂肪貯蔵の結果である。 カロテンは、吸収した光エネルギーをクロロフィルへ伝送することで光合成に寄与している。また、カロテンは、光合成中に形成する酸素分子の活性型である一重項酸素のエネルギーを吸収するので、植物組織の保護に役立っている。 化学的には、カロテンはテルペンの一つであり、8個のイソプレン単位から生合成される。カロテンには、主にα-カロテンとβ-カロテンの2種の異性体がある。カロテンは酸素原子を含まない炭化水素分子なので、脂溶性であり水には溶けない。.

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キヌレニン

ヌレニン(Kynurenine)は、トリプトファンからナイアシンを生合成するキヌレニン経路における主要な代謝中間体のひとつである。アミノ酸のひとつで(伝統的記法を用いると)D体とL体の2つのエナンチオマーが存在する。.

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クルクミン

ルクミン (curcumin) は、ウコン(ターメリック、学名Curcuma longa)などに含まれる黄色のポリフェノール化合物。クルクミノイドに分類される。スパイスや食品領域の着色剤として利用され、日本ではウコン色素として既存添加物(着色料)に指定されている。ウコン由来のクルクミンは「医薬品の範囲に関する基準」では医薬品でないものに分類され健康食品の安全性と有効性情報 「クルクミン」国立栄養・健康研究所 2016年8月3日閲覧効用を謳わない限りは食品扱いとなる。.

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クロム親和性細胞

ム親和性細胞(クロムしんわせいさいぼう、Chromaffin Cells)は、内分泌細胞の一種であり、細胞内に分泌小胞であるクロム親和性顆粒(クロマフィン顆粒、英:Chromaffin Granule)を含み、副腎髄質に存在する。組織切片が重クロム酸カリウム(二クロム酸カリウム、K2Cr2O7)により褐色調に染色される。顆粒内にはカテコールアミンやエンケファリンなどの物質が貯蔵される。クロム親和性細胞は副腎髄質の他に膀胱や前立腺等の組織にも存在する。 一方、胃腸においても同様の染色像を示す細胞群が見られ、これらはそれぞれ腸クロム親和性細胞(Enterochromaffin Cells、EC細胞)及び腸クロム親和性細胞様細胞(Enterochromaffin-like Cells、ECL細胞)と呼ばれる。EC細胞は胃腸におけるオータコイドであるセロトニンの産生に関与している。またECL細胞は顆粒内にセロトニンは含有せずヒスタミンを貯蔵し、胃酸の分泌に関与している。.

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クロトリマゾール

トリマゾール(Clotrimazole)はヒトおよび動物に用いるアゾール系真菌感染症治療薬の一つである。カンジダ症、白癬、癜風の治療に用いられる。商品名エンペシド。 WHO必須医薬品モデル・リストに収載されている。.

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クエン酸回路

ン酸回路。クリックで拡大 クエン酸回路(クエンさんかいろ)とは好気的代謝に関する最も重要な生化学反応回路であり、酸素呼吸を行う生物全般に見られる。1937年にドイツの化学者ハンス・クレブスが発見し、この功績により1953年にノーベル生理学・医学賞を受賞している。 解糖や脂肪酸のβ酸化によって生成するアセチルCoAがこの回路に組み込まれ、酸化されることによって、電子伝達系で用いられるNADHなどが生じ、効率の良いエネルギー生産を可能にしている。またアミノ酸などの生合成の前駆体も供給する。 クエン酸回路の呼称は高等学校の生物学でよく用いられるが、大学以降ではTCA回路、TCAサイクル (tricarboxylic acid cycle) と呼ばれる場合が多い。その他に、トリカルボン酸回路、クレブス回路 (Krebs cycle) などと呼ばれる場合もある。.

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グリコシダーゼ

リコシダーゼ(glycosidase)とは、グリコシド結合を加水分解する酵素の総称であり、グリコシドヒドロラーゼ(glycoside hydrolase)とも呼ばれる。 主な役割として、バイオマスにおけるセルロースやヘミセルロースの分解、バクテリアに対する防御(例:リゾチーム)、ウイルスによる細胞への感染(例:ノイラミニダーゼ)、細胞内における糖タンパク質の生合成などに関係している。 グリコシダーゼは、グリコシド結合の形成や分解においてグリコシルトランスフェラーゼとともに重要な役割を担っている。.

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グリシンtRNAリガーゼ

リシンtRNAリガーゼ(Glycine—tRNA ligase、)は、酵素である。ヒトでは、GARS遺伝子によってコードされる。この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はグリシン:tRNAGlyリガーゼ(AMP生成)(Glycine:tRNAGly ligase (AMP-forming))である。グリシルtRNAシンテターゼ(Glycyl-tRNA synthetase)、グリシルトランスラーゼ(Glycyl translase)等とも呼ばれる。.

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グルタミン

ルタミン (glutamine) はアミノ酸の一種で、2-アミノ-4-カルバモイル酪酸(2-アミノ-4-カルバモイルブタン酸)のこと。側鎖にアミドを有し、グルタミン酸のヒドロキシ基をアミノ基に置き換えた構造を持つ。酸加水分解によりグルタミン酸となる。略号は Gln あるいは Q で、2-アミノグルタルアミド酸とも呼ばれる。グルタミンとグルタミン酸の両方を示す3文字略号は Glx、1文字略号は Z である。動物では細胞外液に多い。 極性無電荷側鎖アミノ酸、中性極性側鎖アミノ酸に分類される。蛋白質構成アミノ酸のひとつ。非必須アミノ酸だが、代謝性ストレスなど異化機能の亢進により、体内での生合成量では不足する場合もあり、準必須アミノ酸として扱われる場合もある。 1870年頃にエルンスト・シュルツが発見した。.

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グルタミン酸tRNAリガーゼ

ルタミン酸tRNAリガーゼ(Glutamate—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-グルタミン酸とRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-グルタミルtRNAGlnの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-グルタミン酸:tRNAGlnリガーゼ(AMP生成)(L-Glutamate:tRNAGlu ligase (AMP-forming))である。グルタミルtRNAシンターゼ、グルタミン酸トランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、グルタミン酸の代謝、ポルフィリンやクロロフィルの代謝、及びアミノアシルtRNAの生合成の3つの代謝経路に関与している。.

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グルタミンtRNAリガーゼ

ルタミンtRNAリガーゼ(Glutamine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-グルタミンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-グルタミニルtRNAGlnの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-グルタミン:tRNAGlnリガーゼ(AMP生成)(L-Glutamine:tRNAGln ligase (AMP-forming))である。グルタミニルtRNAシンターゼ、グルタミントランスラーゼ、GlnRS等とも呼ばれる。この酵素は、グルタミン酸の代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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グアノシン三リン酸

アノシン三リン酸(グアノシンさんリンさん、guanosine triphosphate)は生物体内に存在するヌクレオチドである。正式名はグアノシン-5'-三リン酸、普通は略称 GTP で呼ばれる。分子量 523.18。 グアノシン二リン酸 (GDP) からアデノシン三リン酸 (ATP) のリン酸を受容して生合成される。類似した構造を持つ ATP が生物体内で高エネルギーリン酸結合のエネルギーを利用して、様々な生合成や輸送、運動などの反応に用いられるのに対し、GTP は主として細胞内シグナル伝達やタンパク質の機能の調節に用いられる。.

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ゲラニルゲラニル二リン酸

ラニルゲラニル二リン酸(Geranylgeranyl diphosphate, GGPP)は、生物のメバロン酸経路におけるテルペンやテルペノイドの生合成の中間生成物である。植物においては、カロテノイド、ジベレリン、トコトリエノール(ビタミンE)、クロロフィルなどの生合成の前駆物質である。また、ゲラニルゲラニル二リン酸は、プレニル化タンパク質の一つであるゲラニルゲラニル化タンパク質の生合成の前駆物質でもある。習慣的にゲラニルゲラニルピロリン酸(Geranylgeranyl pyrophosphate)とも呼ばれるが推奨されない。.

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ゲラニルゲラニオール

ラニルゲラニオール はいくつかの重要な生化学反応において役割を担うジテルペンアルコールである。他のジテルペンや、ビタミンEの生合成における中間体である。ゲラニルゲラニル化として知られる翻訳後修飾に利用される。ゲラニルゲラニオールはマルハナバチや各種の他の昆虫におけるフェロモンである。 ゲラニルゲラニオールはin vitroにおいて結核菌の阻害作用を示す。.

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ゲラニオール

ラニオール (geraniol) はゼラニウムから発見された直鎖モノテルペノイドの一種。主にローズオイル、パルマローザ油、シトロネラ油に含まれる。また、ゼラニウムやレモン、いくつかの精油にも含まれている。無色または薄い黄色の液体で、水には溶けないが多くの有機溶媒には溶ける。バラに似た芳香を持ち、広く香水に使われている。また、モモ、ラズベリー、グレープフルーツ、リンゴ、プラム、ライム、オレンジ、レモン、スイカ、パイナップル、ブルーベリーのような芳香としても用いられる。.

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コレステロール

レステロール (cholesterol) とは、ステロイドに分類され、その中でもステロールと呼ばれるサブグループに属する有機化合物の一種である。1784年に胆石からコレステロールが初めて単離された。室温で単離された場合は白色ないしは微黄色の固体である。生体内ではスクアレンからラノステロールを経て生合成される。 コレステロール分子自体は、動物細胞にとっては生体膜の構成物質であったり、さまざまな生命現象に関わる重要な化合物である。よって生体において、広く分布しており、主要な生体分子といえる。また、化粧品・医薬品・液晶の原材料など工業原料としても利用される。 食物由来のコレステロールのほとんどは動物性食品に由来する。卵黄に多量に含まれる。そのため卵の摂取量はしばしば研究の対象となる。植物のフィトステロールは血漿中のコレステロール量を下げるとされる。 いわゆる「善玉/悪玉コレステロール」と呼ばれる物は、コレステロールが血管中を輸送される際のコレステロールとリポタンパク質が作る複合体を示し、コレステロール分子自体を指すものではない。善玉と悪玉の違いは複合体を作るリポタンパク質の違いであり、これにより血管内での振る舞いが変わることに由来する。これらのコレステロールを原料とする複合体分子が血液の状態を計る血液検査の指標となっている。.

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コーヒー酸

ーヒー酸(コーヒーさん、caffeic acid)は、ケイ皮酸のパラ位及びメタ位がヒドロキシ化された構造を持つ芳香族カルボン酸で、フェニルプロパノイドの1種である。化学式はC9H8O4、分子量は180.16。IUPAC名は 3,4-ジヒドロキシケイ皮酸 (3,4-dihydroxycinnamic acid)。カフェ酸、カフェイン酸とも呼ばれる。コーヒー酸はリグニン生合成の重要な中間体であるため、全ての植物に含まれている。 キナ酸とのエステルがクロロゲン酸であり、メタ位のヒドロキシ基がメトキシ基になったものはフェルラ酸として知られる。その他エステルとして植物界に広く分布し、その一部はタンニンとして知られる。生合成はチロシンあるいはフェニルアラニンが原料であり、ケイヒ酸の酸化による。 クロロゲン酸は、コーヒー酸のカルボキシル基がキナ酸5位のヒドロキシ基と脱水縮合した構造を持つ化合物である。 IARCは、コーヒー酸(カフェ酸)をヒトに対する発癌性が疑われる化学物質であるGroup2Bとしている。.

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コスミド

ミド (Cosmid) とはベクターのひとつである。コスミドベクターは、30kbp-45kbpの大きさのDNA断片を挿入することができる。このベクターは、Cos領域という特殊な配列を有し、この配列をバクテリオファージが認識することで、パッケージングが行われる。 昔のコスミドベクターは、Cos領域が一つしかないものであったが、現在では2つあるものが主流である。このため、パッケージングの効率が大幅に上がり、コスミドベクターは実用的なものになった。 コスミドベクターにDNA断片をライゲーションしたあと、バクテリオファージにパッケージングし、そのファージが感染することで大腸菌を形質転換する。 このベクターは比較的大きなDNA断片を挿入できるので、二次代謝産物生合成遺伝子群などの解析のために使用されることもある。.

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ゴシポール

ポール(Gossypol)は、炭素と酸素と水素のみからなる有機化合物の1種で、ワタが生合成するテルペノイドとして知られる。食品がゴシポールによって汚染されたこともある。.

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シガトキシン

トキシン (ciguatoxin) はシガテラ食中毒の原因物質のひとつ。非常に強い神経毒。ある種の藻類(有毒渦鞭毛藻)がつくり魚類に蓄積される。ポリケチド経路によって生合成され、中員環を含む多数のエーテル環が連結した特異な構造を持つ。シガトキシン (CTX) には数多くの類縁体が存在するが、一般的にシガトキシンとはCTX1Bを指す。.

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シキミ酸経路

ミ酸経路(シキミさんけいろ、shikimic acid pathway)は芳香族アミノ酸(チロシン、フェニルアラニンおよびトリプトファン)の生合成反応経路である。間接的にフラボノイドやアルカロイド(モルヒネ(チロシン由来)、キニーネ(トリプトファン由来)等)などの生合成にも必要。微生物や植物の大半は有しているが動物には見られない。 出発反応は解糖系のホスホエノールピルビン酸とペントースリン酸経路のエリトロース-4-リン酸の縮合反応で始まる。反応はコリスミ酸で各アミノ酸への反応に分岐するので、ここまでをシキミ酸経路としている場合もある。.

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システインtRNAリガーゼ

テインtRNAリガーゼ(Cysteine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-システインとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-システイニルtRNACysの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-システイン:tRNACysリガーゼ(AMP生成)(L-Cysteine:tRNACys ligase (AMP-forming))である。システイニルtRNAシンターゼ、システイントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、システインの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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ジョン・ベーン

ョン・ロバート・ベーン(Sir John Robert Vane、1927年3月29日 - 2004年11月19日)は、イギリスの薬理学者。台湾・輔仁大学名誉博士。.

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ジケトピペラジン類

トピペラジン類(ジケトピペラジンるい、Diketopiperazines, 略称: DKP)は、二つのアミノ酸がペプチド結合によりラクタムを形成した環状有機化合物群である。 ジケトピペラジン類は最小構造の環状ペプチドであり、三次元構造が完全に解明された初のペプチドである。この仕事はカリフォルニア工科大学のロバート・コリーにより1930年代になされた。Coreyは ジペプチドであるグリシルグリシンの環状無水物の構造決定を行った。 ジケトピペラジン類はまた、哺乳類を含む多様な生物でアミノ酸から生合成されており、二次代謝であるとみなされている。 ジペプチダルペプチダーゼのような幾つかのプロテアーゼ酵素では、タンパク末端からの開裂によりジペプチドを生成させるが、生成したジペプチドが自然に環化してジケトピペラジン類を形成することが知られている。 さらにジケトピペラジン類は、剛体構造、光学活性、種々の側鎖構造などの構造的特性から、ドラッグデザインの魅力的な足場となっている。天然物由来のジケトピペラジン類と合成されたジケトピペラジン類のいずれもが、 抗腫瘍活性、抗ウイルス活性、抗菌活性、抗微生物活性などを含む多様な生理活性を示すことが報告されている。.

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スペルミン

ペルミン (spermine) は、化学式 C10H26N4 で表されるポリアミンの一種。IUPAC命名法では N,N'-ビス(3-アミノプロピル)ブタン-1,4-ジアミン。融点 26–30 ℃、沸点 150 ℃ (5 mmHg) の固体。 1678年、アントニ・ファン・レーウェンフックにより精液中からリン酸塩として発見され、1888年、アルベルト・ラーデンブルクにより精液 (sperm) から命名された。 体内ではオルニチンなどから生合成されると考えられている。細胞の新陳代謝に関わるDNAと相互作用し、その遺伝情報の読み出しなどに密接に関わる重要な化合物でもある。DNAのらせん構造を安定化させる作用が有ると考えられており、核タンパク質の精製時などにも利用される。 また、スペルミンは精液に多く含まれ、その臭いの元となる化合物でもあるが、実際には精液の臭いはスペルミンの分解物によるものと考えられている。同様の化合物にはスペルミジンがある。.

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ステマレン

テマレン(stemarene)は、米から抽出される酵素によって生合成されるジテルペン炭化水素である。.

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ステロール

テロール (sterol)、別名ステロイドアルコール (steroid alcohol) はステロイドのサブグループのひとつであり、A環の3位にヒドロキシ基(OH基)を持つ誘導体である。ヒドロキシ基は極性基、残りの脂肪族環部分は非極性なため、ステロールは両親媒性を持つ。アセチルCoAによって生合成される脂質である。分子全体は平面に近い構造を持つ。 植物由来のステロールはフィトステロール、動物由来のものはコレステロールあるいはズーステロール (zoosterol) と呼ばれる。重要なステロール類として動物のステロイドホルモン、植物のカンペステロール、β-シトステロール、スチグマステロールが挙げられる。 ステロールは真核生物の生理機能において重要な役割を果たす。例えばコレステロールは細胞膜の一部を形成し、その流動性や機能を調節したり、発生シグナル伝達において二次情報伝達物質としてはたらく。 植物ステロールはヒトの内臓のコレステロール吸収サイトを塞ぎ、コレステロール量の減少を助けることが知られている。.

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ステロイド

300px ステロイド (steroid) は、天然に存在する化合物または合成アナログである。シクロペンタヒドロフェナントレンを基本骨格とし、その一部あるいはすべての炭素が水素化されている。通常はC-10とC-13にメチル基を、また多くの場合C-17にアルキル基を有する。天然のステロイドはトリテルペノイド類から生合成される。共通して、ステロイド核(シクロペンタノ-ペルヒドロフェナントレン核)と呼ばれる、3つのイス型六員環と1つの五員環がつながった構造を持っている。ステロイド骨格そのものは脂溶性で水に不溶であるが、生体物質としてのステロイドはC-3位がヒドロキシル化されあるいはカルボニル基となったステロール類であり、ステロイドホルモンをはじめ、水溶性の性質も有する。 ステロイドはステラン核と付随する官能基群により特徴付けられるテルペノイド脂質で、核部分は3つのシクロヘキサン環と1つのシクロペンタン環から成る4縮合環炭素構造である。ステロイドはこれらの炭素環に付随する官能基およびその酸化状態により異なったものとなる。 何百もの異なるステロイドが植物、動物、菌類で見つかっており、それらすべてのステロイドがそれぞれの細胞においてラノステロール(動物および菌類)またはシクロアルテノール(植物)といったステロールから生成され、これらステロール(ラノステロールとシクロアルテノール)は何れもトリテルペンの一種であるスクアレンの環状化により誘導される。 ステロールはステロイドの特殊型であり、C-3にヒドロキシ基を有しコレスタンから生成される骨格である 。コレステロールは最もよく知られるステロールのひとつである。 ステロイドは、ほとんどの生物の生体内にて生合成され、中性脂質やタンパク質、糖類とともに細胞膜の重要な構成成分となっているほか、胆汁に含まれる胆汁酸や生体維持に重要なホルモン類(副腎皮質ホルモンや昆虫の変態ホルモンなど)として、幅広く利用されている。.

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セリン

リン (serine) とはアミノ酸の1つで、アミノ酸の構造の側鎖がヒドロキシメチル基(–CH2OH)になった構造を持つ。Ser あるいは S の略号で表され、IUPAC命名法に従うと 2-アミノ-3-ヒドロキシプロピオン酸である。セリシン(絹糸に含まれる蛋白質の一種)の加水分解物から1865年に初めて単離され、ラテン語で絹を意味する sericum からこの名がついた。構造は1902年に明らかになった。 極性無電荷側鎖アミノ酸に分類され、グリシンなどから作り出せるため非必須アミノ酸である。糖原性を持つ。酵素の活性中心において、求核試薬として機能している場合がある。.

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セリンtRNAリガーゼ

リンtRNAリガーゼ(Serine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-セリンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-セリル-tRNASerの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-セリン:tRNASerリガーゼ(AMP生成)(L-Serine:tRNASer ligase (AMP-forming))である。セリルtRNAシンターゼ、セリントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、グリシン、セリン、トレオニンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.

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セルロース

ルロース (cellulose) とは、分子式 (C6H10O5)n で表される炭水化物(多糖類)である。植物細胞の細胞壁および植物繊維の主成分で、天然の植物質の1/3を占め、地球上で最も多く存在する炭水化物である。繊維素とも呼ばれる。自然状態においてはヘミセルロースやリグニンと結合して存在するが、綿はそのほとんどがセルロースである。 セルロースは多数のβ-グルコース分子がグリコシド結合により直鎖状に重合した天然高分子である。構成単位であるグルコースとは異なる性質を示す。いわゆるベータグルカンの一種。.

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セコロガニン

ニン(Secologanin)は、メバロン酸経路中のゲラニルピロリン酸から合成されるモノテルペンである。セコロガニンはさらに、ドーパミンと共に、トコンアルカロイドを生成する。.

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タキサン

タキサン (taxane) とは、イチイ属()の植物から発見されたタキサン環またはその類縁構造を有するジテルペンの総称である。タキサン環またはその類縁構造を有するジテルペン類の誘導体はタキソイド (taxoid) と呼ばれる。タキサン類はもともと植物から見つかった天然化合物だが、医薬品の生産に有用ないくつかのタキサン類は合成されて利用されている 。タキサン類は全合成法も知られているが(詳しくはタキソール全合成を参照)、全合成はコストが非常に高くつくため、工業的な生産はもっぱら細胞培養により増殖させたイチイの培養細胞の抽出物からの半合成によって行われている。タキサン類は植物体内ではゲラニルゲラニルピロリン酸から生合成される。.

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サイトカイニン

イトカイニン (cytokinin) は植物ホルモンの一種。一般に オーキシン存在下で細胞分裂、シュート形成の誘導効果をもつ化合物一群の総称とされる。略称 CK。.

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前駆体

化学における 前駆体(ぜんくたい)とは、ある化学物質について、その物質が生成する前の段階の物質のことを指す。有機合成化学や生化学で用いられる用語であり前駆物質、プリカーサー (precursor) とも呼ばれる。.

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CAZy

CAZyは、糖質関連酵素(Carbohydrate-Active enZymes)のデータベースである。CAZyは糖質の生合成、代謝、輸送に関与する酵素の分類に関する情報が主体であり、GenBankなどの配列情報やRCSBの立体構造データへのリンクがある。CAZyには糖質加水分解酵素(Glycoside Hydrolases、GH)、糖転移酵素(GlycosylTransferases、GT)、多糖リアーゼ(Polysaccharide Lyases、PL)、炭水化物エステラーゼ(Carbohydrate Esterases、CE)の酵素群のほか、糖結合モジュール(Carbohydrate-Binding Modules、CBM)が分類されている。.

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皮膚

膚(ひふ)は、動物の器官のひとつで、体の表面をおおっている層のこと生化学辞典第2版、p.1068 【皮膚】。体の内外を区切り、その境をなす構造である。皮膚と毛、爪、羽毛、鱗など、それに付随する構造(器官)とをあわせて、外皮系という器官系としてまとめて扱う場合がある。また、動物種によっては、皮膚感覚を伝える感覚器の働きも持っている場合がある。ヒトの皮膚は「肌」(はだ)とも呼ばれる。 高等脊椎動物では上皮性の表皮、その下にある結合組織系の真皮から構成され、さらに皮下組織そして多くの場合には脂肪組織へと繋がってゆく。 ヒトの皮膚は、上皮部分では細胞分裂から角化し、垢となって剥がれ落ちるまで約4週間かかる解剖学第2版、p.26-31、外皮構造(皮膚)。.

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硫酸エステル

アルキル硫酸の構造(ナトリウムやアンモニウムなどのカチオンは示されていない)。 有機硫酸エステル(ゆうきりゅうさんエステル )は、官能基 -O-SO3− を共有する有機化合物群である。SO4 は核となる硫酸基、R は任意の有機残基を表わす。硫酸エステルはアルコールと硫酸のエステル結合により構成される。硫酸エステルは多くの洗剤やその他有用な試薬として用いられている。アルキル硫酸は疎水性の炭化水素鎖と極性の(アニオンを含む)硫酸基、および硫酸基との電荷の釣り合いをとるためのカチオンもしくはアミンから成り、ラウリル硫酸ナトリウム(硫酸モノドデシルエステルナトリウム塩)および相当するカリウムまたはアンモニウム塩が例として挙げられる。.

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糖鎖生物学

糖鎖生物学(とうさせいぶつがく)は、グリカンの構造、生合成、生物学的機能を研究し理解するために、生化学および分子生物学の基礎を組み合わせた、新しい科学的専門分野である。グリカンは生物に欠かせない成分で、自然界に広く存在している。 生物学では、高分子はDNA、タンパク質、脂質、グリカンまたは糖質の4つに大きく分類される。グリカンには固有の特徴があり、オリゴマーまたはモノマー(単量体)、直鎖構造のものや複雑に枝分かれした構造のものなど、分子的に極めて多様な分子である。グリカンのモノマーは異なる種類の結合によって互いに結合しうる。.

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細胞骨格

細胞骨格(さいぼうこっかく、cytoskeleton, CSK)は、細胞質内に存在し、細胞の形態を維持し、また細胞内外の運動に必要な物理的力を発生させる細胞内の繊維状構造。細胞内での各種膜系の変形・移動と細胞小器官の配置、また、細胞分裂、筋収縮、繊毛運動などの際に起こる細胞自身の変形を行う重要な細胞小器官。 細胞骨格はすべての細胞に存在する。かつては真核生物に特有の構造だと考えられていたが、最近の研究により原核生物の細胞骨格の存在が確かめられた。 細胞骨格という概念と用語(フランス語で )は、1931年、フランスの発生生物学者 Paul Wintrebert によって導入された。.

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終止コドン

終止コドンとは、遺伝暗号を構成する64種のコドンのうち、対応するアミノ酸(とtRNA)がなく、最終産物である蛋白質の生合成を停止させるために使われているコドン。終結コドンあるいはアミノ酸を指定しないことから、ナンセンスコドンとも呼ばれる。 一般に核ゲノムから転写されるmRNA上のコードでは、UAA(オーカー)・UAG(アンバー)・UGA(オパール)の3種がある。.

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熊谷英彦

谷 英彦(くまがい ひでひこ、1940年10月 - )は、日本の農芸化学者(醗酵学・応用微生物学・酵素工学)。学位は農学博士(京都大学・1969年)。京都大学名誉教授、石川県立大学学長・名誉教授。 京都大学農学部教授、京都大学大学院生命科学研究科教授、社団法人日本農芸化学会会長(第54代)、石川県農業短期大学教授などを歴任した。.

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D-ツボクラリン

d-ツボクラリン(tubocurarine)はアルカロイド系の物質。南米の先住民が古くから狩猟などに用いてきたクラーレ(curare)と呼ばれる矢毒のうち、ツヅラフジ科コンドデンドロン属の植物Chondodendron tomentosumが材料のツボクラーレ(壷ではなくチューブTubeの意味)と呼ばれるものから1935年にハロルド・キングにより単離された。 ツボクラリンは少量でも傷口から体内に入ると末梢神経と筋の接続部のニコチン受容体においてアセチルコリンと拮抗、興奮伝達を阻害して目・耳・足指(短筋)→四肢の筋→頚筋→呼吸筋の順に骨格筋を麻痺させることにより、呼吸困難を起させて窒息死させる。逆に経口摂取しても排泄がすみやかで毒性を発揮しないため、これを含む矢毒を用いて倒した動物を食べても害が無く、狩猟に用いるには都合が良い。 単離されたものが筋弛緩剤として用いられていたが、2000年に原料の取得困難を理由として医療目的の販売は中止となっている。しかし、薬理学の実験には欠くことができないものである。.

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菊酸

菊酸(きくさん、chrysanthemic acid)は、様々な天然ならびに合成殺虫剤と関連する有機化合物の一つである。ピレスロイドに分類されるピレトリンI (Pyrethrin I) やピレトリンII (Pyrethrin II) と関連している。菊酸の4種の立体異性体の一つである (1R,3R)- or (+)-trans-chrysanthemic acidは、除虫菊 (Chrysanthemum cinerariaefolium) の種子に含まれるピレトリンIの酸部である。多くの合成ピレスロイド、例えばアレトリン類は、菊酸の4種の異性体全てのエステルである。.

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非メバロン酸経路

非メバロン酸経路(ひメバロンさんけいろ、non-mevalonate pathway)は、イソペンテニル二リン酸(IPP)とジメチルアリル二リン酸(DMAPP)の生合成経路である。 代謝中間体として2-C-メチル-D-エリトリトール-4-リン酸(MEP)および1-デオキシ-D-キシルロース-5-リン酸(DXPまたはDOXP)を生合成することから、MEP経路、DXP経路、DOXP経路、MEP/DOXP経路とも呼ばれる。多くの細菌や植物の葉緑体は非メバロン酸経路によりIPPとDMAPPを生合成する。一方で真核生物や植物の細胞質などは非メバロン酸経路ではなくメバロン酸経路によってIPPが生合成される。.

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非リボソームペプチド

非リボソームペプチド(ひリボソームペプチド、英:Nonribosomal peptide(s))は細菌や真菌など微生物の二次代謝産物の中で、リボソームを経由せずに合成されるペプチドを指す。NRP(s)と略記される。裸鰓類のような高等生物もNRPを作り出していることが知られているが、それも生体表面や内部に住み着いた微生物によるものではないかと考えられている。 リボソームで合成されるポリペプチドとは異なり、非リボソームペプチド合成酵素(ひリボソームペプチドごうせいこうそ、英:Nonribosomal peptide synthetase(s))によりアミノ酸から合成される。この酵素はNRPS(s)と略記される。NRPSはモジュール式の分子組み立て工場のモデルで説明されることが多い。mRNAを設計図としてペプチド鎖を合成するリボソームとは異なり、NRPSには設計図がなく各NRPSにより合成できる分子もあらかじめ決まっている。非リボソームペプチドはリボソームペプチドより非常に多様な分子構造を持っており、様々なNRPSにより合成される。 NRPは環状構造もしくは枝状構造を取ることも多く、コドンにコードされていないアミノ酸(D-アミノ酸や、N,O,S-メチル化、N-ホルミル化、グリコシル化、アシル化、ハロゲン化、ヒドロキシル化などの修飾を受けたアミノ酸)を含むことも多い。同じ配列のペプチドが二量体、三量体となりNRPを形成することも多い。ペプチド鎖が環化されることもあり、オキサゾリンやチアゾリンといった酸化還元可能な分子も合成される。また時には脱水素化も行われ、セリンからデヒドロアラニンが合成される。これらはほんの一例であり、他にもNRPSにより多様な反応・合成が触媒されている。 非リボソームペプチドは高い多様性を持った構造の分子であり、自然界にも生理学的活性や薬理学的特性を持つ分子として広く存在している。毒性を持つものが多く、親鉄性を持つものや、着色しているものもある。このうち一部は抗生物質、細胞増殖抑制剤、免疫抑制剤として利用されている。.

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鮒信学

鮒 信学(ふな のぶたか)は、日本の農芸化学者(応用微生物学・天然物化学・代謝工学)。学位は博士(農学)(東京大学・2003年)。静岡県立大学食品栄養科学部准教授・大学院食品栄養環境科学研究院准教授。 東京大学大学院農学生命科学研究科助手、東京大学大学院農学生命科学研究科助教などを歴任した。.

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転写 (生物学)

転写中のDNAとRNAの電子顕微鏡写真。DNAの周りに薄く広がるのが合成途中のRNA(多数のRNAが同時に転写されているため帯状に見える)。RNAポリメラーゼはDNA上をBeginからEndにかけて移動しながらDNAの情報をRNAに写し取っていく。Beginではまだ転写が開始された直後なため個々のRNA鎖が短く、帯の幅が狭く見えるが、End付近では転写がかなり進行しているため個々のRNA鎖が長く(帯の幅が広く)なっている 転写(てんしゃ、Transcription)とは、一般に染色体またはオルガネラのDNAの塩基配列(遺伝子)を元に、RNA(転写産物transcription product)が合成されることをいう。遺伝子が機能するための過程(遺伝子発現)の一つであり、セントラルドグマの最初の段階にあたる。.

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胆汁

胆汁(たんじゅう)は、肝臓で生成される黄褐色でアルカリ性の液体である。肝細胞で絶えず生成され、総肝管を通って胆のうに一時貯蔵・濃縮される。食事時に胆のうが収縮され、総胆管の十二指腸開口部であるオッディ括約筋が弛緩し十二指腸に排出されて働く。 胆汁は3つに分類される。.

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薬草

草 桂皮 柴胡 薬草(やくそう)、薬用植物(やくようしょくぶつ、medicinal plant)とは、薬用に用いる植物の総称である。そのままであったり、簡単な加工をしたり、有効成分を抽出したりするなどして用いられる。草本類だけでなく木本類も含むため、学問的な場面では、より厳密な表現の「薬用植物」のほうが用いられることが多い。.

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藤原賞

藤原賞(ふじはらしょう、Fujihara Award)は、藤原銀次郎によって1959年に設立された藤原科学財団が授与する科学技術の賞。 日本国内の科学技術の発展に卓越した貢献をした科学者の顕彰を目的とする。.

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還元的アミノ化

還元的アミノ化(かんげんてき-か、reductive amination)とは、アルデヒドあるいはケトンをアミンへと変換する化学反応の総称である。.

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脱炭酸

脱炭酸(だつたんさん、Decarboxylation)は有機反応の形式のひとつで、カルボキシル基 (−COOH) を持つ化合物から二酸化炭素 (CO2) が抜け落ちる反応を指す。.

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脂肪酸

脂肪酸(しぼうさん、Fatty acid)とは、長鎖炭化水素の1価のカルボン酸である。一般的に、炭素数2-4個のものを短鎖脂肪酸(低級脂肪酸)、5-12個のものを中鎖脂肪酸、12個以上のものを長鎖脂肪酸(高級脂肪酸)と呼ぶ。炭素数の区切りは諸説がある。脂肪酸は、一般式 CnHmCOOH で表せる。脂肪酸はグリセリンをエステル化して油脂を構成する。脂質の構成成分として利用される。 広義には油脂や蝋、脂質などの構成成分である有機酸を指すが、狭義には単に鎖状のモノカルボン酸を示す場合が多い。炭素数や二重結合数によって様々な呼称があり、鎖状のみならず分枝鎖を含む脂肪酸も見つかっている。また環状構造を持つ脂肪酸も見つかってきている。.

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野口博司

野口 博司(のぐち ひろし)は、日本の薬学者(生薬学・生物分子科学)。学位は薬学博士(東京大学・1981年)。 東京大学薬学部講師、静岡県立大学薬学部教授、静岡県立大学大学院薬学研究科研究科長、静岡県立大学附属図書館館長、静岡県立大学薬学部学部長などを歴任した。.

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酢酸

酢酸(さくさん、醋酸、acetic acid)は、化学式は示性式 CH3COOH、分子式 C2H4O2と表される簡単なカルボン酸の一種である。IUPAC命名法では酢酸は許容慣用名であり、系統名はエタン酸 (ethanoic acid) である。純粋なものは冬に凍結することから氷酢酸(ひょうさくさん)と呼ばれる。2分子の酢酸が脱水縮合すると別の化合物の無水酢酸となる。 食酢(ヴィネガー)に含まれる弱酸で、強い酸味と刺激臭を持つ。遊離酸・塩・エステルの形で植物界に広く分布する。酸敗したミルク・チーズのなかにも存在する。 試薬や工業品として重要であり、合成樹脂のアセチルセルロースや接着剤のポリ酢酸ビニルなどの製造に使われる。全世界での消費量は年間およそ6.5メガトンである。このうち1.5メガトンが再利用されており、残りは石油化学原料から製造される。生物資源からの製造も研究されているが、大規模なものには至っていない。.

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鉄欠乏性貧血

鉄欠乏性貧血(てつけつぼうせいひんけつ、iron deficiency anemia, IDA)とは、体内に鉄が不足する事により、充分にヘモグロビンを生産できなくなることで生じる貧血のことである。.

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電解質代謝

電解質代謝(でんかいしつたいしゃ、、electrolyte metabolism、Elektrolytstoffwechsel)は、溶媒中に溶解して伝導性をもった物質が生体個々の細胞に出入りし、生体内に分布する動態をいう。.

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O-アセチルセリン

O-アセチルセリン(O-acetylserine)は、α-アミノ酸の一つで、構造式がHO2CCH(NH2)CH2OC(O)CH3の化合物である。細菌や植物でシステイン生合成の中間体となる。 セリン-O-アセチルトランスフェラーゼ(EC 2.3.1.30)によるセリンのアセチル化によって生合成され、システインシンターゼ(EC 2.5.1.47)によって、硫黄源を用いてシステインに変換されると同時に酢酸を放出する。.

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RiPPs

RiPPs (Ribosomally synthesized and post-translatinally modified peptides; リボソーム翻訳系翻訳後修飾ペプチド) はリボソーム翻訳系のペプチドを基にした天然物の総称であり、リボソーム系天然物 (Ribosomal natural products)とも呼ばれる。20以上の亜種に分けられるRiPPsは、真核生物、真正細菌、古細菌など様々な生物によって生合成され、広範囲な生化学的特徴を有する。 RiPPsはアルカロイドやテルペノイドのような天然物に比べて、遺伝的データからその構造が予測しやすいため、ゲノム内の塩基配列からその存在や構造を早く正確に予測することができる。そのため、ここ数十年の科学技術の進歩によってゲノム解析が安価になり遺伝的データが増えていくにしたがって、新たな生物活性天然物のターゲットとしてRiPPsへの注目度は上昇し続けている。.

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抗真菌薬

抗真菌薬(こうしんきんやく、antifungal drug)は、真菌の生育を阻害する医薬品である。真菌症の治療や、農薬として用いられる。細胞膜であるエルゴステロールを阻害するポリエン系抗生物質(ポリエンマクロライド系)のほか、ラノステロールからエルゴステロールの生合成を阻害するアゾール系薬剤、βDグルカン合成酵素を阻害し細胞壁合成を阻害するキャンディン系薬剤、DNA合成を阻害するピリミジン系薬剤などの化学療法薬を含む。真菌に対して選択毒性を示す薬剤は真正細菌に対して選択毒性を示す薬剤よりも少ない。この理由として真菌は動物と同じく真核生物に属しており、真正細菌と比較すると動物細胞に類似することが挙げられる。.

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林康紀

林 康紀(はやし やすのり、1965年7月28日 - )は、日本の神経科学者。理化学研究所脳科学総合研究センター林研究室研究代表者。 愛知県名古屋市出身。.

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渡辺賢二

渡辺 賢二(わたなべ けんじ、1969年10月 - )は、日本の化学者(天然物有機化学)。学位は博士(農学)(北海道大学・2000年)。静岡県立大学薬学部教授・大学院薬学研究院教授。 ウィスコンシン大学マディソン校薬学部博士研究員、スタンフォード大学化学部博士研究員、北海道大学大学院農学研究科助手、南カリフォルニア大学薬学部研究助教授、北海道大学大学院理学研究院特任助教、岡山大学異分野融合先端研究コアテニュアトラック助教、静岡県立大学大学院薬学研究科准教授などを歴任した。.

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(+)-ネオメントールデヒドロゲナーゼ

(+)-ネオメントールデヒドロゲナーゼ((+)-neomenthol dehydrogenase)は、以下の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 すなわち2つの基質、(+)-ネオメントールとNADP+から、3つの生成物として(-)-メントール、NADPH、H+へと導く。 この酵素は酸化還元酵素に属し、電子供与体としてCH-OH基に特異的に作用し、NADP+もしくはNAD+を電子受容体とする。この酵素は、モノテルペノイドデヒドロゲナーゼ(monoterpenoid dehydrogenase)とも呼ばれる。そしてモノテルペノイドの生合成に関与している。(-)-メントールデヒドロゲナーゼ((-)-menthol dehydrogenase)と厳密に同定されていない。基質特異性は低く、他のシクロヘキサノールやシクロヘキセノールも基質として受け入れる。.

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(+)-ボルネオールデヒドロゲナーゼ

(+)-ボルネオールデヒドロゲナーゼ((+)-borneol dehydrogenase; )は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 すなわち、2つの基質、(+)-ボルネオールとニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD+)から、3つの生成物として(+)-カンファー、NADHとH+へと導く。 この酵素は酸化還元酵素に属し、電子供与体のCH-OH基に特異的に作用し、NAD+ まはた NADP+を電子受容体とする。NADP+を補酵素とする場合は反応は遅い。この酵素は、ビサイクリックモノテルペノールデヒドロゲナーゼ(bicyclic monoterpenol dehydrogenase)とも呼ばれる。 この酵素は、ボルネオールからcis-サビオール(cis-sabinol)経由でカンファーやツジョンを生じる生合成経路に関与している。.

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(+)-サビノールデヒドロゲナーゼ

(+)-サビノールデヒドロゲナーゼ((+)-sabinol dehydrogenase)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 すなわち、2つの基質(+)-cis-サビノールとニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD+)から、3つの生成物として (+)-サビノン、NADH、H+へと導く。 この酵素の組織名は(+)-cis-サビノール:NAD+ キシドレタクターゼ((+)-cis-sabinol:NAD+ oxidoreductase)で、 (+)-cis-サビノールデヒドロゲナーゼ((+)-cis-sabinol dehydrogenase)とも呼ばれる。 この酵素は酸化還元酵素に属し、特異的にCH-OH基に作用し、NAD+またはNADP+を電子受容体とする。NADP+の場合は反応速度は遅い。(+)-3-ツヨノン((+)-3-thujone)や(-)-3-イソツヨノンの生合成に関与している。.

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(+)-trans-カルベオールデヒドロゲナーゼ

(+)-trans-カルベオールデヒドロゲナーゼ((+)-trans-carveol dehydrogenase)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 すなわち、2つの基質(+)-trans-カルベオール((+)-trans-carveol)とニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD)から、3つの生成物として(+)-(S)-カルボン((+)-(S)-carvone)、H+へと導く。 この酵素は酸化還元酵素に属し、特異的にCH-OH基に作用し、NAD+のみを電子受容体とする。この酵素の組織名は(+)-trans-カルベオール:NAD+オキシドレダクターゼ((+)-trans-carveol:NAD+ oxidoreductase)である。この酵素は、カルベオールデヒドロゲナーゼ(carveol dehydrogenase)とも呼ばれる。この酵素はモノテルペンであるテルペン類やリモネン、ピネンの生合成に関与している。.

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(-)-メントールデヒドロゲナーゼ

(-)-メントールデヒドロゲナーゼ((-)-menthol dehydrogenase; )は、以下の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 すなわち、2つの基質(-)-メントール((-)-menthol)とニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸(NADP+)から、3つの生成物として(-)-メントン((-)-menthone)、還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸(NADPH)と水素イオン(H+)へと導く。 この酵素の組織名は(-)-メントール:NADP+オキシドレダクターゼ((-)-menthol:NADP+ oxidoreductase)である。この酵素は、モノテルペノイドデヒドロゲナーゼ (monoterpenoid dehydrogenase)とも呼ばれる。 この酵素は酸化還元酵素に属し、特異的にCH-OH基に作用し、NADP+またはNAD+を電子受容体とする。この酵素はモノテルペノイドの生合成に関与している。この酵素は(+)-ネオメントールデヒドロゲナーゼ((+)-neomenthol dehydrogenase)との区分は厳密になっていない。また、いくつかのシクロヘキサノール体(cyclohexanols)やシクロヘキセノール体(cyclohexenols)も基質とする。.

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10-ホルミルテトラヒドロ葉酸

10-ホルミルテトラヒドロ葉酸(10-ホルミルテトラヒドロようさん、10-Formyl-tetrahydrofolate、10-CHO-THF)は、テトラヒドロ葉酸の誘導体の一つで、同化作用においてホルミル基の供与体として機能する。プリンの生合成では、初期段階ではホスホリボシルグリシンアミドホルミルトランスフェラーゼの基質として、最終段階ではホスホリボシルアミノイミダゾールカルボキサミドホルミルトランスフェラーゼの基質として重要である。プリン体の生合成で、この物質は下図中3及び9の2個所のホルミル化の反応に関わっている。 また、メチオニル開始tRNA(fMet-tRNA)のホルミル化ではメチオニルホルミルトランスフェラーゼの基質として重要である。.

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2-ヒドロキシ-4-メトキシベンズアルデヒド

2-ヒドロキシ-4-メトキシベンズアルデヒド(2-Hydroxy-4-methoxybenzaldehyde)は、バニリンの異性体である。ウロリチンの1つであるウロリチンM7は、逆電子要請型ディールス・アルダー反応を用いてこの物質から作られる。 キョウチクトウ科の ・ ・ などの植物において、根にこの物質が蓄積されることが確認されている。生合成経路にはフェニルアラニンアンモニアリアーゼが関与している。.

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4-ヒドロキシベンズアルデヒド

4-ヒドロキシベンズアルデヒド(4-hydroxybenzaldehyde)は、3種あるヒドロキシベンズアルデヒドの異性体の一つである。ラン科のオニノヤガラや から発見されている。バニラではバニリンの生合成中間体となっている。 デーキン反応によってヒドロキノンと、対応するカルボン酸に変換される。 代謝酵素として、4-ヒドロキシベンズアルデヒドデヒドロゲナーゼがニンジンから発見されている。.

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5''-ホスホリボスタマイシンホスファターゼ

5-ホスホリボスタマイシンホスファターゼ (5-phosphoribostamycin phosphatase, btrP (gene), neoI (gene)) は、系統名が5-phosphoribostamycin phosphohydrolaseの酵素である。以下の化学反応を触媒する。 この酵素は、リボスタマイシンやネオマイシン、ブチロシンなど数種のアミノシクリトール系抗生物質の生合成に関わっている。.

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6-アミノペニシラン酸

6-アミノペニシラン酸(6-aminopenicillanic acid)とは、(2S,5R,6R)-6-アミノ-3,3-ジメチル-7-オキソ-4-チア-1-アザビシクロ--ヘプタン-2-カルボン酸のことである。.

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7,8-ジヒドロネオプテリン三リン酸

7,8-ジヒドロネオプテリン三リン酸(7,8-dihydroneopterin triphosphate、DHNTP)は、テトラヒドロビオプテリンの生合成における中間体の一つ。 Category:プテリジン Category:リン酸エステル.

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