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59 関係: 原核生物の細胞骨格、古細菌、上皮成長因子受容体、乳酸菌、化膿レンサ球菌、マラカイトグリーン、ネオリケッチア属、ハロコックス属、メタノカルドコックス・ヤンナスキイ、メタノコックス綱、メタノスパエラ属、メタノサルキナ属、モラクセラ、ランプロペディア属、ランプロシスティス属、ラクトコッカス属、レンサ球菌、ヘリコバクター・ピロリ、ブドウ球菌、プロントジル、ピュロロブス・フマリイ、ピュロディクティウム科、ピュロコックス属、ピュロコックス・ヤヤノシイ、ピクロフィルス属、テルモプラズマ属、テルモコックス属、テルモコックス綱、デイノコックス・テルムス門、デスルフロコックス目、デスルフォコッカス属、デスルフォサルシナ属、ニトロコッカス属、ニトロソコッカス属、アルカエオグロブス綱、アエロピュルム・ペルニクス、アキディロブス目、イグニコックス属、エンテロコッカス属、エールリキア属、グラム陰性菌、グラム陽性菌、ゲオグロブス属、スルフォロブス目、スピロヘータ、ターシノコッカス・フェニシス、細菌の細胞構造、真正細菌、生物学に関する記事の一覧、高度好塩菌、...、肺炎レンサ球菌、腸球菌、通性嫌気性生物、Strain 121、桿菌、溶連菌感染症、滲出性表皮炎、放線菌、急性前立腺炎。 インデックスを展開 (9 もっと) »
原核生物の細胞骨格
原核生物の細胞骨格（げんかくせいぶつのさいぼうこっかく）とは、原核生物に存在する、繊維性の生体構造を指す。かつては原核生物には細胞骨格はないと考えられていたが、近年の細胞内微細構造の視覚化技術や構造決定技法の進展によって、存在が明らかになってきた。さらに、真核生物に存在する主要な細胞骨格タンパク質のすべてについて、それらに対応するものが原核生物でも発見されている。細胞骨格は様々な原核生物において、細胞分裂、防御、形態や細胞極性の決定において主要な役割を果たしている。.
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古細菌
古細菌（こさいきん、アーキア、ラテン語:archaea/アルカエア、単数形:archaeum, archaeon）は、生物の分類の一つで、''sn''-グリセロール1-リン酸のイソプレノイドエーテル（他生物はsn-グリセロール3-リン酸の脂肪酸エステル）より構成される細胞膜に特徴付けられる生物群、またはそこに含まれる生物のことである。古"細菌"と名付けられてはいるが、細菌（バクテリア。本記事では明確化のため真正細菌と称する）とは異なる系統に属している。このため、始原菌（しげんきん）や後生細菌（こうせいさいきん）という呼称が提案されたが、現在では細菌や菌などの意味を含まない を音写してアーキアと呼ぶことが多くなっている。 形態はほとんど細菌と同一、細菌の一系統と考えられていた時期もある。しかしrRNAから得られる進化的な近縁性は細菌と真核生物の間ほども離れており、現在の生物分類上では独立したドメインまたは界が与えられることが多い。一般には、メタン菌・高度好塩菌・好熱好酸菌・超好熱菌など、極限環境に生息する生物として認知されている。.
上皮成長因子受容体
上皮成長因子受容体（じょうひせいちょういんしじゅようたい、Epidermal Growth Factor Receptor; EGFR）は、細胞の増殖や成長を制御する上皮成長因子 (EGF) を認識し、シグナル伝達を行う受容体である。チロシンキナーゼ型受容体で、細胞膜を貫通して存在する分子量170 kDa（キロダルトン）の糖タンパクである。HER1、ErbB1とも呼ばれる。 EGFRの発現は上皮系、間葉系、神経系起源の多様な細胞でみられる。細胞膜上にあるこの受容体に上皮成長因子 (EGF) が結合すると、受容体は活性化し、細胞を分化、増殖させる。正常組織において細胞の分化、発達、増殖、維持の調節に重要な役割を演じているが、このEGFRに遺伝子増幅や遺伝子変異、構造変化が起きると、発癌、および癌の増殖、浸潤、転移などに関与するようになる。 MAPK経路（緑）、JAK-STAT経路（ピンク）、PI3K-AKT経路（黄）などの細胞内経路が活性化して核内にシグナルを伝達する。その結果、細胞増殖、アポトーシス抑制、血管新生、浸潤・転移などがおこる。.
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乳酸菌
''Enterococcus faecalis'' ''Lactobacillus'' sp. ''Streptococcus mutans'' 乳酸菌（にゅうさんきん）は、代謝により乳酸を産生する細菌類の総称。生育の為には糖類、アミノ酸、ビタミンB群、ミネラル(Mn, Mg, Fe等の金属)が必要な細菌類岡田早苗、 乳酸菌研究集談会誌 Vol.1 (1990-1991) No.2 p.41-47, 。ヨーグルト、乳酸菌飲料、漬け物など食品の発酵に寄与する。一部の乳酸菌は腸などの消化管（腸内細菌）や膣の内に常在して、他の微生物と共生あるいは拮抗することによって腸内環境の恒常性維持に役立っていると考えられている。.
化膿レンサ球菌
化膿レンサ球菌（かのうレンサきゅうきん、Streptococcus pyogenes）とは、レンサ球菌属に属する真正細菌の一種。血液寒天培地上で培養するとβ溶血性を示し、またレンサ球菌の鑑別に用いられるランスフィールド抗原分類ではA群に属する。この性質から、A群β溶血性レンサ球菌（えーぐんべーたようけつせいれんさきゅうきん）とも呼ばれ、臨床医学分野ではこの名称が用いられることが多い。A群溶レン菌、あるいは単に溶レン菌（溶連菌）、またGAS（Group A Streptococci）という略語が用いられることもある（#名称の節を参照）。 健康なヒトの咽頭や消化管、表皮にも生息する常在細菌の一種であるが、GAS感染症（溶レン菌感染症）と呼ばれる各種の化膿性疾患や、産生する毒素による全身性疾患、あるいは感染後に一種の合併症として起きる免疫性疾患など、多様な疾患の原因になる。ごくありふれた病原菌・常在菌の一種であるものの、場合によっては劇症型レンサ球菌感染症（壊死性筋膜炎など）と呼ばれる、進行の早い致死性疾患の原因となることがあり、俗に人食いバクテリアと称されることがある細菌の一種である（人食いバクテリアと呼ばれるものには、他にグラム陰性桿菌のビブリオ・バルニフィカス Vibrio vulnificusがある）。.
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マラカイトグリーン
マラカイトグリーン は青緑色の塩基性有機色素である。CAS登録番号は。 名称はマラカイト（孔雀石 CuCO3･Cu(OH)2）に色調が似ていることによる。主にシュウ酸塩や塩酸塩として流通している。.
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ネオリケッチア属
ネオリケッチア属はグラム陰性の非運動性細胞内寄生性球菌。アナプラズマ科に属し、基準種はネオリケッチア・ヘルミンテカ。ネオリケッチア・センネツ及びネオリケッチア・リスチシはかつてエールリキア属であったが遺伝子の系統分析によりネオリケッチア属に移された。属名は新しいリケッチア属を意味する。 脊椎動物に感染して病原性を示す。ネオリケッチア・センネツはヒトの腺熱リケッチア症、ネオリケッチア・ヘルミンテカはイヌ科の鮭中毒、ネオリケッチア・リスチシはウマのポトマック熱の病原菌である。.
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ハロコックス属
ハロコックス属 (Halococcus) は中性塩湖など高濃度の塩化ナトリウムを含む環境に生息する高度好塩菌の一属である。学名は、高濃度の塩を好むこと、球形をしていることから、ギリシャ語のhalos「塩あるいは海」+ coccus「木の実」に由来して名付けられた。.
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メタノカルドコックス・ヤンナスキイ
メタノカルドコックス・ヤンナスキイ（Methanocaldococcus jannaschii）は、ユリアーキオータに属す海洋性、超好熱性のメタン菌である。古細菌として全ゲノムが初めて解析された種として知られる。旧名は"Methanococcus jannaschii"。2002年に新設されたMethanocaldococcus属に移動された際、この属のタイプ種に指定された。学名の種形容語は熱水噴出孔周辺の生物の研究で知られるHolger Jannaschに献名されたものである。 1983年、ウッズホール海洋研究所によって東太平洋の水深2,600mにある熱水噴出孔から発見された。やや不規則な形をした鞭毛をもつ球菌で、若干酸性に寄せた硫黄を添加した海水中でギ酸塩または水素-二酸化炭素を基質として増殖する。増殖は1世代あたり25分であり、メタン菌としては最も早いという特徴がある。増殖温度は48-86、最適増殖温度は85の超好熱菌である。.
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メタノコックス綱
メタノコックス綱(Methanococci)は主に海洋に分布するメタン生成古細菌の1綱である。 グラム陰性で運動性を持つ球菌であり、水素と二酸化炭素、またはギ酸を資化して増殖する。細胞表面は単純タンパク質性の薄い細胞壁（S層）に包まれているが、機械的強度が弱く純水や界面活性剤に接触すると容易に溶菌する。メタノコックス科は常温性（または弱い好熱性）で海洋沈殿物などの広い嫌気条件、メタノカルドコックス科は超好熱性で深海の熱水噴出孔などに生息する。GC含量が低く（一般に40%以下）、これにより同じグラム陰性のメタン菌メタノミクロビウム綱との区別が可能である。 メタノコックス綱の仲間では''Methanocaldococcus jannaschii''が最も研究が進んでおり、古細菌として初めて全ゲノムの配列が解読された。古細菌はDNA複製、転写、翻訳などに真核生物に似たところがあると言われていたが、これによりゲノムレベルで類似していることが実証された。至適条件での世代時間が26分とメタン菌の仲間では2番目に速いため、この他様々な研究に使用されている。 メタノコックス綱はユリアーキオータ門の綱の1つで、系統解析からはメタノバクテリウム綱やメタノピュルス綱に近縁なことが示されている。下位分類はメタノコックス目以下1目2科4属が設定されている。.
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メタノスパエラ属
メタノスパエラ属（メタノスファエラ属、-ぞく、Methanosphaera）は、メタノバクテリウム科に属すメタン菌の一属である。主に哺乳類の大腸にみられ、1985年にヒトから分離、報告された。 腸内環境によく適応しており、増殖条件は常温（37℃程度）、中性の強い嫌気環境である。大腸では''Bacteroides''などの真正細菌の活動により、有機物が酢酸、水素、二酸化炭素、メタノールなどに分解されるため、これらを基質に増殖している。 外観は1μm程度の球菌。大半が桿菌のメタノバクテリウム綱の中では例外的である。シュードムレインより構成される細胞壁を持ち、グラム染色では陽性を示す。一般的に鞭毛を持たず、運動能力はない。細胞壁と鞭毛の有無は他のメタノバクテリウム綱と類似している。 栄養的には、水素-二酸化炭素や蟻酸をメタン生成の基質に用いるメタノバクテリウム綱他属とは異なり、この系を欠いており、代わりにメタノミクロビウム綱の一部菌種と同様にメタノールを水素で還元してメタン生成とプロトン濃度勾配の形成（ATP合成）を行う。この他、増殖に炭素源として酢酸と二酸化炭素を要求するが、これらをメタン生成の基質として用いることはできない。 2006年にMethanosphaera stadtmanaeについて全ゲノムの解読が報告された。ゲノムサイズは176万7403bp、ORF1534箇所。GC含率は28%と異常に低く、古細菌の中で最も低い。.
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メタノサルキナ属
メタノサルキナ属（Methanosarcina、メタノサルシナ）は、多様な淡水域・哺乳類の消化器官に分布するメタン生成古細菌である。水素のほか有機酸やアルコールなどもメタン生成の基質として用いることができる。メタノサルキナの発見は1930年代にまで遡り、メタン菌の中でも最も古い部類に入る。 形態は球菌が基本で、それらが多数集まったサルキナ様の群体を形成する種も多い。個々の細胞を包むS層の外側に、動物組織に存在するコンドロイチンに似たメタノコンドロイチンを持ち群体を形成する。属名はこの形態に由来しており、ラテン語でメタン+Sarcina（サルキナ、包み）を意味している。 栄養的には通性独立栄養または従属栄養的に増殖する。メタノサルキナはメタン菌の中でも特に多様な物質をメタン生成の基質に利用することが可能であり、水素-二酸化炭素系のほかに、ギ酸、酢酸、メタノール、メチルチオール、メチルアミン、一酸化炭素などを利用することができる。酢酸を基質に反芻動物の胃やメタン発酵装置でしばしば優占する。人間の大腸からも分離されている。 ゲノムサイズは記載されている古細菌の中では最大である。Methanosarcina acetivorans C2Aのゲノムサイズは575万1492bp、ORFは4540箇所であり、解析時は全原核生物の中でも4番目に大きいものであった。他にM.
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モラクセラ
モラクセラ属 は、シュードモナス目に分類される真正細菌の属。グラム陰性球菌であり、ヒトや動物の口腔・上気道・性器の粘膜における常在菌である。 呼吸器感染症ではモラクセラ・カタラーリス が主である。成人市中肺炎の起炎菌としてはしばしば検出される。β-ラクタマーゼ産生菌がほとんどであり、治療に際しては抗生物質の選択に留意する必要がある。アモキシシリン/クラブラン酸合剤、ST合剤、経口第2世代又は第3世代セフェム系、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、フルオロキノロン系が推奨される。 は洗濯物の部屋干しの際に発生する悪臭の原因菌であることが同定された。この菌は、増殖する際に雑巾のような悪臭を発生する4-メチル-3-ヘキセン酸という物質を作る。.
ランプロペディア属
ランプロペディア属はコマモナス科に属するグラム陰性非芽胞形成偏性好気性球菌の一属で、鞭毛は持たない。複数の細胞が4から8列程度縦横につながって正方形の平面を形成する。基準種のランプロペジア・ヒアリナのみが知られている。名前は光る平原を意味する。GC比は61。 淡水中に生息するほか、動物の腸内からも発見されている。オキシダーゼ陽性。糖類は利用できず、クエン酸やコハク酸などクエン酸回路に含まれる有機酸を利用する。また、生育にはビオチン及びチアミンを必要とする。.
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ランプロシスティス属
ランプロシスティス属はクロマチウム属に属するグラム陰性の非芽胞形成嫌気性光合成球菌の一属。鞭毛を持ち運動性がある。また、細胞内には気泡がある。基準種はランプロシスティス・ロゼオペルシシナ。属名は光る袋を意味する。GC比は63から64。 水中に生息し、バクテリオクロロフィルaやカロテノイドといった色素を生産する。紅色硫黄細菌に分類され、増殖に硫化物とビタミンB12を要求する。細胞内には利用した硫化物が酸化して生じた硫黄粒がみられる。.
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ラクトコッカス属
ラクトコッカス属（ラクトコッカスぞく、Lactococcus）とはホモ乳酸菌の一群で、ストレプトコッカス科に属すグラム陽性菌の1属。狭義の乳酸球菌。球菌で芽胞を形成せず、運動性を持たない。ヨーグルトやチーズ等の乳酸発酵食品に多く含まれる。特に基準種であるLactococcus lactisが重要。pHや塩濃度の変動に強く、自然界に広く存在する。.
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レンサ球菌
レンサ球菌（レンサきゅうきん、連鎖球菌）とは、レンサ球菌属（Streptococcus 属）に属するグラム陽性球菌である真正細菌の総称。 一つ一つの球菌が規則的に、直鎖状に配列して増殖し、光学顕微鏡下で観察すると「連なった鎖」のように見えるため、もう一つのグラム陽性球菌のグループであるブドウ球菌（ブドウの房状に配列する）との対比から「レンサ（連鎖）球菌」と名付けられた。属名の Streptococcus は、ギリシャ語で「よじる」を意味する στρέφω から派生した στρεπτός （streptos: 曲げやすい、柔軟な）と、球菌を意味する coccus （元はラテン語で「（穀物の）粒」や「木の実」の意）に由来し、曲がりやすい紐のような配列をする球菌を意味する。また旧来は漢字表記の「連鎖球菌」が用いられていたが、2005年現在では仮名交じりの「レンサ球菌」の表記が、微生物学や医学の分野では優勢である。 元来の「レンサ球菌」(streptococcus) とは、細菌が発見されて間もない、分類法が整理されていない頃に細菌の形態および配列から名付けられた名称である。その後の分類によって、当初レンサ球菌属として分類されていたグループから腸球菌 (Enterococcus) が独立した科 (Enterococcaceae) として分類された。またレンサ球菌属として分類されてきた中にも、肺炎球菌 (S. pneumoniae) のように連鎖状を示さない双球菌も含まれている。ここでは、レンサ球菌属に属する細菌全般 (Streptococcus sp.) を解説する。形態上の分類に基づく古典的なレンサ球菌については球菌の項を参照。.
ヘリコバクター・ピロリ
ヘリコバクター・ピロリ (Helicobacter pylori) とは、ヒトなどの胃に生息するらせん型のグラム陰性微好気性細菌である。単にピロリ菌（ピロリきん）と呼ばれることもある。ヘリコバクテル・ピロリと表記されることもある。1983年にオーストラリアのロビン・ウォレンとバリー・マーシャルにより発見された。 胃の内部は胃液に含まれる塩酸によって強酸性であるため、従来は細菌が生息できない環境だと考えられていた。しかし、ヘリコバクター・ピロリはウレアーゼと呼ばれる酵素を産生しており、この酵素で胃粘液中の尿素をアンモニアと二酸化炭素に分解し、生じたアンモニアで、局所的に胃酸を中和することによって胃へ定着（感染）している。この菌の発見により動物の胃に適応して生息する細菌が存在することが明らかにされた。 ヘリコバクター・ピロリの感染は、慢性胃炎、胃潰瘍や十二指腸潰瘍のみならず、胃癌や MALTリンパ腫やびまん性大細胞型B細胞性リンパ腫などの発生に繋がることが報告されているほか、特発性血小板減少性紫斑病、小児の鉄欠乏性貧血、慢性蕁麻疹などの胃外性疾患の原因となることが明らかとなっている。細菌の中でヒト悪性腫瘍の原因となり得ることが明らかになっている病原体のひとつである。ピロリ菌検査で陰性でも胃炎など胃疾患が続く場合は、ヘリコバクター・ハイルマニイの感染が疑われることがある。.
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ブドウ球菌
ブドウ球菌（ブドウきゅうきん）とは、ブドウ球菌属(Staphylococcus属)に属するグラム陽性球菌である真正細菌の総称。 一つ一つの球菌が不規則に配列した集合体（クラスター）を作りながら増殖し、光学顕微鏡下で観察すると「ブドウの房」のように見えるため、もう一つのグラム陽性球菌のグループである連鎖球菌（直鎖状に配列する）との対比から「ブドウ球菌」と名付けられた。属名のStaphyloccocusも、ラテン語で「ブドウの房」を意味するstaphylo-と、球菌を意味するcoccus（元は「（穀物の）粒」や「木の実」の意）に由来する。 元来「ブドウ球菌」とは、細菌が発見されて間もない、分類法が整理されていない頃に細菌の形態および配列から名付けられた名称である。このためStaphylococcus属以外でも、クラスターを形成することがあるMicrococcus属などを含めて広義に「ブドウ球菌」 (staphylococcus) と呼ばれていた。本項目では、ブドウ球菌属に属する細菌全般(Staphylococcus sp.)を解説する。.
プロントジル
プロントジル（Prontosil、別名：Sulfonamidochrysoïdine等）は合成抗菌薬の一つで、最初に開発されたサルファ剤である。1932年ドイツのIGファルベン社で発見された。グラム陽性球菌には比較的広く有効であるが、腸内細菌には無効である。プロントジルを元に続々とサルファ剤が開発され、医学を一変させた。ゲルハルト・ドーマクはプロントジルの発見に対し、1947年ノーベル生理学・医学賞を受賞した。.
ピュロロブス・フマリイ
ピュロロブス・フマリイ（Pyrolobus fumarii、ピロ- 、パイロロバス・フマリ）は、ピュロディクティウム科に属する古細菌の一属。正式に発表されているクレンアーキオータの中では最も好熱性が強く、1997年から2003年までの間最も高温で増殖が可能な生物として知られていた。 学名は、Pyro-（ピュロ。ギリシャ語が由来で「炎」）lobus（ロブス。ラテン語で「丸・耳たぶ、葉よう」）+ fumarii（フーマーリイー。ラテン語で「煙突の」）である。属名は形態と生育温度、種形容語はブラックスモーカーから発見されたことに由来する。.
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ピュロディクティウム科
ピュロディクティウム科（Pyrodictiaceae ）は、デスルフロコックス目に属する超好熱性のクレン古細菌である。極めて好熱性が強いことで知られるBurggraf S, Huber H and Stetter KO Reclassification of the crenarchaeal orders and families in accordance with 16S rRNA sequence data.
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ピュロコックス属
Pyrococcus（ピュロコックス属、パイロコッカス属、ピロコックス属）は熱水噴出孔や油田鉱床などに生息する超好熱古細菌。ユリアーキオータの中では''Methanopyrus kandleri''に次いで好熱性が強く、全種が90℃以上に至適生育温度を持つ。最高増殖温度はPyrococcus yayanosiiの108である。比較的増殖速度が早いこともあって、よく研究の進んでいる超好熱菌の一つである。 属名は球菌であること、非常に強い好熱性を持つことに由来し、ギリシャ語で炎(Pyr-o-)+ 球菌(-coccus)を意味する。.
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ピュロコックス・ヤヤノシイ
ピュロコックス・ヤヤノシイ（Pyrococcus yayanosii）は、偏性嫌気性、絶対好圧性の超好熱古細菌である。学名の種形容語は好圧菌の研究に功績のあったAristides Yayanosへの献名である。 形態、栄養要求性など、増殖圧力以外の特徴は典型的な''Pyrococcus''であるBirrien JL, Zeng X, Jebbar M, Cambon-Bonavita MA, Quérellou J, Oger P, Bienvenu N, Xiao X, Prieur D. Pyrococcus yayanosii sp.
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ピクロフィルス属
Picrophilus（ピクロフィルス属）は、テルモプラズマ目ピクロフィルス科に属す古細菌の一属。既知のものとしては最も好酸性の強い生物である。学名はギリシア語で酸/苦い（πικρό）+愛する（φιλος）のラテン語形。 1995年に北海道の噴気孔で発見された。生育が可能なpHはマイナス0.06（培養培地に1.2 M相当の硫酸を添加）に達し、近縁の古細菌Thermoplasma acidophilum（限界生育pH0.5）や真核藻類のイデユコゴメ（pH0.24）などを上回り、既知のものとしては全生物中最も好酸性が強い生物である。生育至適pHも0.7という極端な数値を示している。pH4以上では細胞膜を維持できないほど強酸下の環境に適応している。 形状は1-1.5μほどの球菌、細胞表面にはS層（細胞壁）が存在し、他のテルモプラズマ綱（細胞壁を持たない）とは異なっている。鞭毛は持たない。栄養的には完全な偏性好気性偏性従属栄養生物であり、好気条件下でアミノ酸などを酸化して増殖する。 ゲノムは2004年に解読が終了（P.
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テルモプラズマ属
Thermoplasma（テルモプラズマ属、サーモプラズマ属）は、陸上の温泉などに生息する好熱、好酸、通性嫌気性の古細菌の一属。古細菌のモデル生物の一つで、細胞壁を欠くなどの特徴で知られる。学名はギリシア語で「熱(θέρμη)」+「形作られたもの(Πλάσμα)」という意味である。 単離は好熱古細菌の中では最も早く、1960年代後半にインディアナ州の炭鉱のボタ山から発見された。1980年代になると各地の温泉などからも単離され始め、日本でも温泉からの報告例がある。.
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テルモコックス属
テルモコックス属（Thermococcus、サーモコッカス、サーモカカス）はユリアーキオータに属す超好熱性の古細菌である。同じテルモコックス科に属する''Pyrococcus''よりもやや好熱性は低いが、幅広い温度、pHで生息が可能。Thermococcus celerを初めとして古細菌最多の27種が属す。 深海や浅瀬の熱水域によく生育している。理由は不明だが油田鉱床から分離されることもある。生育可能温度は40-103℃と幅広く、pHも3.5-10.5と広い。Thermococcus barophilusの増殖温度は48℃-100℃とかなり広く、最も生育可能温度に幅がある生物と思われる。 栄養学的には偏性嫌気性の偏性従属栄養生物で、多糖類（マルトース他）やアミノ酸を発酵している。この際生成する水素が増殖を阻害するため、硫黄などを利用して硫化水素として除去している。硫黄がなければ強い増殖阻害が起こり、種によっては増殖が停止する。窒素酸化物や鉄化合物を還元剤として利用する種もいる。 形態的には1-2μmほどの直径を持つ球菌で、細胞壁はS-レイヤーより構成される。多数の鞭毛を持つ場合が多い。 進化的にはユリアーキオータの基部付近で分岐していると考えられており、古細菌の原始的な性格を残していると思われる。''Thermoplasma''の様にいくつか細胞壁を欠き、多数の細胞が集合した融合体を形成するものも知られている。T.
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テルモコックス綱
テルモコックス綱（Thermococci、サーモコッカス綱）は、ユーリ古細菌に属す綱の1つで、海洋熱水域に広く生育する超好熱菌のグループである。 深海の熱水噴出孔から良く単離される生物の一つ。油田鉱床、浅瀬の熱水域からの単離例もある。一方で陸上の熱泉からの分離例はない。海底火山が噴火した際に周囲の海水から高濃度で検出されたことがあり、分布の中心は熱水噴出孔周辺の地下とみられている。 全種が超好熱性、偏性嫌気性の従属栄養生物であり、熱水域でペプチドや多糖類を分解して生活している。水素により強い増殖阻害を受けることから、代謝の結果生じる水素を硫黄と反応させ、硫化水素として除去している。このため単体硫黄や硫化金属が多量に存在する環境をよく好む。一般にサイズ1-2μmのあまり特徴のない不定型の球菌として観察される。殆どの種が多極の鞭毛を有している。細胞壁はS層から構成される（細胞壁を欠損する種もあり）。その他の性質は典型的な古細菌と同じである。 進化的にはユーリ古細菌の基部付近から分岐したと考えられている。ユーリ古細菌における系統関係の一例を示す。.
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デイノコックス・テルムス門
デイノコックス・テルムス門(Deinococcus-Thermus、デイノコッカス-サーマス)は、強い放射線耐性菌と好熱性細菌を含む真正細菌の小型の門である。デイノコックス門(Deinococci)とされることもある。 一般に好気、従属栄養性。最終電子受容体に酸素以外の物質を利用できる種もいるが、酵母エキスやペプトン、グルコースを主体とした培地で好気的に培養が可能な場合が多い。細胞形状は一般的な球菌又は桿菌で、しばしばコロニーはカロテノイドによる着色が見られる。 基本的にはグラム陰性であるが、一部の属は細胞壁に厚いペプチドグリカン層を持つためグラム陽性に染色される。しかしグラム陽性のものであっても細胞壁の構造自体はグラム陰性菌に類似しており、タイコ酸を欠きペプチドグリカン層の外側に外膜を持っている。 小型の門であるが特異な性質を持つこともあり、現在20種の全ゲノムが解析されている。.
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デスルフロコックス目
デスルフロコックス目（-もく、Desulfurococcales、デスルフロコッカス目）は、クレンアーキオータ門テルモプロテウス綱に属す古細菌の目である。極めて好熱性が強いことが特徴で、105を越える温度で増殖する種を多数含む。.
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デスルフォコッカス属
デスルフォコッカス属はグラム陰性の非芽胞形成偏性嫌気性球菌。非運動性でGC含量は57。硫酸塩を硫化水素に還元する硫酸還元菌に分類される。基準種はデスルフォコッカス・ムルチボランス。 硫酸塩を含む水中に生息する。デスルフォビリジンを有し有機酸やアルコールを炭素源として利用して完全に酸化することができる。.
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デスルフォサルシナ属
デスルフォサルシナ属(デスルフォサルチナ属、デスルフォサルキナ属)はグラム陰性の非芽胞形成偏性嫌気性球菌。デスルフォバクター科に属し、細胞分裂後もいくつかの細胞が凝集して生育する。硫酸塩を硫化水素に還元する硫酸還元菌の一種で、名称は硫酸を還元するサルシナ型の細菌を意味する。基準種はデスルフォサルシナ・バリアビリス。 海水や汽水中に生息する。デスルフォビリジンは有さない。脂肪酸を炭素源として利用して完全に酸化する完全酸化型である。.
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ニトロコッカス属
ニトロコッカス属はグラム陰性の非芽胞形成好気性球菌。極鞭毛を持ち運動性のある種がある。エクトチオロドスピラ科に属し、2015年現在は基準種のニトロコッカス・モビリスのみが知られている。属名は窒素の球菌を意味する。GC比は約60。 海水中に生息し、好塩性で化学合成独立栄養の硝酸菌の一属。かつては他の硝酸菌と同様にニトロバクター属とされていたが、16S rRNA系統解析により移された。.
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ニトロソコッカス属
ニトロソコッカス属はクロマチウム科に属するグラム陰性の非芽胞形成好気性球菌。鞭毛を持って運動する種がある。基準種はニトロコッカス・ニトロスス。属名は亜硝酸の球菌を意味する。GC比は約60。 海水中や土壌に生息する好塩性で化学合成独立栄養の亜硝酸菌の一属で、アンモニアを酸化して亜硝酸を生産する。かつては他の亜硝酸菌と同様にニトロバクター属であったが、16S rRNA系統解析により移された。.
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アルカエオグロブス綱
アルカエオグロブス綱（-こう、Archaeoglobi。アーケオグロバス綱）は、古細菌ユリアーキオータ門に属す超好熱菌の1綱である。 2009年現在、''Archaeoglobus''、''Ferroglobus''、''Geoglobus''の1目1科3属が知られている。典型的な古細菌と同じように、いずれも形態は1μm前後の不定型の球菌で、多数の鞭毛を備えており運動能力を持つ。表層はS層と呼ばれる糖たんぱく複合体の細胞壁によって覆われている。3属とも属名に-globusが付いているが、これはラテン語で球を意味しており、その丸い形態に因んだものである。 分布は地上では限られている。至適増殖温度は85前後、生育温度は最低でも60と高いため、深海の熱水噴出口など嫌気性の熱水環境に分布している。深い油田中からも分離されるため、地下生物圏の一部を構成している可能性もある。これらの環境でアルカエオグロブス綱に属す生物は、有機物や水素、硫化水素、第一鉄などを硫酸塩、硝酸塩、第二鉄などで嫌気的に酸化することによって増殖する。系統的にメタン菌に近く、一部の種は非常に微弱ながらもメタンを生成する。.
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アエロピュルム・ペルニクス
アエロピュルム・ペルニクス（アエロピルム- 、エーロパイラム・パーニックス、Aeropyrum pernix）は浅海の熱水噴出孔に生息する古細菌の一種で、2008年現在知られている生物の中では最も高温で増殖が可能な偏性好気性生物（増殖に酸素を要求する生物）である。属名はギリシャ語をラテン語化したもので、空気(Aero)+ 炎(Pyr)。種形容語は、顕微鏡で観察したこところ活発に動いていたことから、ラテン語で「敏捷な」「素早く動く」を意味するpernixと名づけられた。 1996年6月に鹿児島県十島村・小宝島の水深20mの浅海から分離された。鞭毛を持たない（線毛を持つ）直径0.8-1.0μmの不規則な形をした球菌で、好気条件下で従属栄養的に増殖する。至適生育温度は90-95（生育可能範囲は70-100）、至適pHは7(同pH5-9)、至適塩濃度は3.5%（同1.8-7.0%）。世代時間は200分とそれ程速くないが、培養終了時の菌収量は比較的多く、好気条件で簡便に培養でき、有毒なガスも出さないため研究材料としては使いやすい。現在、デスルフロコックス科に所属しているが、Aeropyrum以外は全て偏性嫌気性であり、系統的にやや離れているとする説もある。2004年には小笠原諸島の水曜海山水深1385mにある深海熱水噴出孔から近縁種Aeropyrum caminiが発見されている。 1999年には全ゲノム配列が日本で解読された（Aeropyrum pernix K1株.
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アキディロブス目
アキディロブス目（-もく、アシディロバス目、Acidilobales) は、クレンアーキオータ門テルモプロテウス綱に属す古細菌の目である。タイプ指定はAcidilobus（Acidus（アキドゥス/酸っぱい）+lobus（ロブス/丸、葉よう（希））。Acidilobusの記載以前は、"Caldisphaerales"とも呼称された。 形態は1-2μmほどのやや不規則な球菌。主に陸上にある弱酸性の熱水系に分布する。増殖範囲は50-90、pH2-6程度で、これまでに単離された主な場所は、カムチャツカ半島やフィリピン、日本の温泉などが中心となっている。デンプンなどの炭化水素、タンパク質を嫌気的に醗酵して増殖する。 系統的にはデスルフロコックス目に近縁である。.
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イグニコックス属
イグニコックス（Ignicoccus、イグニコッカス、イグニカカス）は、偏性嫌気性グラム陰性不定形球菌の超好熱古細菌である。学名Ignicoccusは、ラテン語で「炎」を意味するイグニス(ignis)と、球菌を意味するコックス(Coccus)（ギリシャ語で「木の実」を意味するκόκκοςより派生）に由来する。 2000年にアイスランド北部のコルベインセイ海嶺（大西洋中央海嶺）からI.
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エンテロコッカス属
ンテロコッカス属（Enterococcus）は、フィルミクテス門に属する乳酸菌の大きな属であり、腸球菌に含まれる。エンテロコッカス属はグラム陽性の球菌であり、しばしば双球菌（diplococcus ）または短い連鎖の形状を示し、外見のみで連鎖球菌と区別することは困難である。ヒトの腸内では、E. faecalis（90-95％）とE. faecium（5-10％）の2種が腸内で一般的に片利共生している。感染を起こすまれな種は、E.
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エールリキア属
ールリキア属(エールリヒア属)はアナプラズマ科に属するグラム陰性の非運動性球菌。アナプラズマ科に属する。基準種はエールリキア・カニス。名称はドイツの生物学者パウル・エールリヒに因む。GC比は57から63。 動物に寄生し、白血球に感染してヒトやイヌなどのエールリキア症やウマのポトマック熱の原因となる。抗生物質ドキシサイクリンの作用を受ける。.
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グラム陰性菌
ラム陰性菌（グラムいんせいきん、gram-negative bacteria）とはグラム染色においてクリスタルバイオレットによる染色が脱色される細菌の総称。グラム陽性菌ではクリスタルバイオレットは脱色されない。グラム染色試験では対比染色として通常はサフラニンがクリスタルバイオレットの後に加えられ、全てのグラム陰性菌は赤あるいは桃色に染色される。 かつてグラム陰性の真正細菌には、グラキリクテス（Gracilicutes）というラテン語の分類名が与えられ、門相当として扱われた。命名はグラム陰性菌の薄い細胞壁にちなんでおり、ラテン語のグラキリス（gracilis: 細い、貧弱な）とクティス（cutis: 皮膚）の合成語であった。.
グラム陽性菌
ラム陽性菌（グラムようせいきん、）とは、グラム染色により紺青色あるいは紫色に染色される細菌の総称。これに対して赤色あるいは桃色を呈すものをグラム陰性菌と呼ぶ。大まかにいえば、フィルミクテス門と放線菌門がグラム陽性菌に属している。 かつてグラム陽性の真正細菌は、フィルミクテス門Firmicutesに一括してまとめられた時期がある。命名はグラム陽性菌の厚い細胞壁にちなんでおり、ラテン語のFirmisフィルミス（強固な）とcutisクティス（皮膚）の合成語であった。ここには、現在のフィルミクテス門に含まれる低GCグラム陽性細菌の他に、現在は別の門として扱われる放線菌(高GCグラム陽性細菌)やデイノコックスなども含まれていた。.
ゲオグロブス属
ブス属（Geoglobus）は深海熱水噴出孔から発見された超好熱、偏性嫌気性の古細菌の一属である。学名はGeo-（ギリシャ語で「土地、地球」）+ globus（ラテン語で「球」）の意。 ''Archaeoglobus''に近縁な古細菌で、2002年にカリフォルニア湾ゲイマス海盆の熱水噴出孔から発見、記載（Geoglobus ahangari）された。2009年には、大西洋中央海嶺のアシャゼ熱水場の熱水噴出口からもGeoglobus acetivoransが発見されている。 性質は、最終電子受容体としてFe3+を要求することを除けば近縁のArchaeoglobusや''Ferroglobus''と類似する。増殖温度は60-90程度、偏性嫌気性で、中性を好む。先に発見されたGeoglobus ahangariの方がやや好熱性は強い。単独の鞭毛を持つ1-2μm程度の不定形の球菌である。 独立、従属または混合栄養的で、アミノ酸、酢酸、ピルビン酸、長鎖脂肪酸、その他多様な有機物を代謝する。この他水素を酸化して独立栄養的にも増殖が可能である。Fe3+の還元と、長鎖脂肪酸の代謝能は古細菌として最初の報告例となった。.
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スルフォロブス目
ルフォロブス目（-もく、Sulfolobales。サルフォロバス目）は、クレンアーキオータ門テルモプロテウス綱に属す古細菌の目である。 温泉や熱水泉、鉱山などの陸上熱水系から分離される好熱好酸菌の一つ。強酸高熱の環境に特に適応しており、生育に適するのはpH1-5、50-90の極限的な環境である。中にはpH0.35(A. sulfidivorans)や96(A. infernus)で増殖できるものもいる。分布が広く大抵の陸上酸性熱水泉に存在しているが、海洋から分離されることはほとんどない。ほとんどの種が偏性/通性好気性菌である。 好熱好酸性に加え、すべての種が硫黄を何らかの形で利用する。代表的な属である''Sulfolobus''は硫黄がなくても従属栄養的に増殖できるが、自然界では無機硫黄を酸化してCO2を固定する硫黄酸化菌としてふるまっていると思われる。''Acidianus''も同様の代謝を行うが、こちらは水素と硫黄の存在下嫌気性菌としても生育することができる。 形態は1-3μm程度の不定型の球菌で、頻繁に丸い突出部を形成する。グラム陰性でS層と呼ばれる細胞壁を持ち、細胞膜はテトラエーテル脂質一重膜から成る。鞭毛を有し運動性を持つ場合が多い。系統的にはデスルフロコックス目とアキディロブス目を合わせたクレードの姉妹群になると考えられている。.
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スピロヘータ
ピロヘータ（またはスピロケータ、spirochaetaまたはspirochete, spirochetis）とは、らせん状の形態をしたグラム陰性の真正細菌の一グループである。学名の由来は「コイル状の髪」を意味するギリシア語σπειροχαίτηをラテン語に音写したもので、古典ラテン語の発音では「スピーロカエタ」である。 他の典型的な細菌とは異なり、菌体の最外側にエンベロープと呼ばれる被膜構造を持ち、それが細胞体と鞭毛を覆っている。細胞壁が薄くて比較的柔軟であり、鞭毛の働きによって、菌体をくねらせたりコルク抜きのように回転しながら活発に運動する。 自然環境のいたるところに見られる常在菌の一種でもある。一部のスピロヘータはヒトに対して病原性を持つものがあり、梅毒、回帰熱、ライム病などの病原体がこれに該当する。またシロアリや木材食性のゴキブリの消化管に生息するスピロヘータは、腸内細菌として宿主が摂った難分解性の食物から栄養素を摂取したり、エネルギーを産生する役割にかかわっている可能性が指摘されている。.
ターシノコッカス・フェニシス
ターシノコッカス・フェニシス (Tersicoccus phoenicis) とは、アクチノマイセス目マイクロコッカス科に属する放線菌の1種。ターシノコッカス属のタイプ種。.
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細菌の細胞構造
細菌は単純な生物ではあるが、よく発達した細胞構造を持ち、それらは細菌類が持つ特徴的な生物学的構造を代表するものである。この構造の多くは細菌に特異的なもので、古細菌や真核生物では見られない。より大きな生物と比べた細菌の単純さと実験的な扱いの容易さから、細菌の細胞構造については研究が進んでおり、他の生物にも適用できる生化学的原理の多くが明らかにされた。.
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真正細菌
真正細菌（しんせいさいきん、bacterium、複数形 bacteria バクテリア）あるいは単に細菌（さいきん）とは、分類学上のドメインの一つ、あるいはそこに含まれる生物のことである。sn-グリセロール3-リン酸の脂肪酸エステルより構成される細胞膜を持つ原核生物と定義される。古細菌ドメイン、真核生物ドメインとともに、全生物界を三分する。 真核生物と比較した場合、構造は非常に単純である。しかしながら、はるかに多様な代謝系や栄養要求性を示し、生息環境も生物圏と考えられる全ての環境に広がっている。その生物量は膨大である。腸内細菌や発酵細菌、あるいは病原細菌として人との関わりも深い。語源はギリシャ語の「小さな杖」（βακτήριον）に由来している。.
生物学に関する記事の一覧
---- 生物学に関する記事の一覧は、生物学と関係のある記事のリストである。ただし生物学者は生物学者の一覧で扱う。また生物の名前は生物学の研究材料としてある程度有名なもののみ加える。 このリストは必ずしも完全ではなく、本来ここにあるべきなのに載せられていないものや、ふさわしくないのに載せられているものがあれば、適時変更してほしい。また、Portal:生物学の新着項目で取り上げたものはいずれこのリストに追加される。 「⇒」はリダイレクトを、(aimai) は曖昧さ回避のページを示す。並べ方は例えば「バージェス動物群」なら「はしえすとうふつくん」となっている。 リンク先の更新を参照することで、このページからリンクしている記事に加えられた最近の変更を見ることが出来る。Portal:生物学、:Category:生物学も参照のこと。.
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高度好塩菌
度好塩菌（こうどこうえんきん、ハロバクテリア）とは、ユリアーキオータ門ハロバクテリウム綱に属す古細菌の総称。いずれも増殖に高い塩化ナトリウム (NaCl) 濃度を要求する。高度好塩性古細菌、好塩性アーキアやハロアーキア (Haloarchaea) と呼ぶこともある。 しかしながら、近年属種の増加により、NaCl濃度が0.9 Mでも増殖可能な種の報告や、最適増殖NaCl濃度が2.0 M以下であるHaloferax volcanii、Halorubrum sodomense、Halorussus ruberなどが報告されている。 広義の高度好塩菌には、上記に加え、至適増殖NaCl濃度が2.5–5.2M（高度好塩性）の古細菌・真正細菌全てを含む。しかし、これらはいずれもメタン菌や光合成細菌（真正細菌）であり、系統関係上高度好塩菌には含まれず、発見種もわずかである。また近年、新たな系統群としてナノ好塩古細菌（Nanohaloarchaea）が報告された。詳細は好塩菌を参照。.
肺炎レンサ球菌
肺炎レンサ球菌（はいえんレンサきゅうきん、）とは、肺炎などの呼吸器の感染症や全身性感染症を引き起こす細菌。日本の臨床医療現場では肺炎球菌と呼ばれることが多い。また、かつては肺炎双球菌 と呼ばれていた。病原菌であるとともに、遺伝学の発展に大きな影響を与えた実験材料としてもよく知られる。.
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腸球菌
腸球菌(ちょうきゅうきん)とは、主にヒトを含む哺乳類の腸管内に存在する常在菌のうち、球菌の形態をとるものを指す。 外界で増殖しにくく、人畜の糞尿で汚染されていない限り、環境中の水や土壌にはほとんど分布していない。また、大腸菌よりも加熱や冷凍に対する耐性が強く、大腸菌群同様に汚染指標として、食品衛生法の清涼飲料水（ミネラルウォーター）基準などに用いられている。.
通性嫌気性生物
通性嫌気性生物（つうせいけんきせいせいぶつ）は、そのエネルギー獲得のため、酸素が存在する場合には好気的呼吸によってATPを生成するが、酸素がない場合においても発酵によりエネルギーを得られるように代謝を切り替えることのできる生物である。通常は細菌だが、一部真核生物や古細菌も存在する。 通性嫌気性細菌のいくつかの例を挙げると、たとえば、Staphylococcus(ブドウ球菌、グラム陽性球菌）、Corynebacterium（コリネバクテリウム属、グラム陽性桿菌）、Listeria属（リステリア属、グラム陽性桿菌）、大腸菌（エシェリキア属、グラム陰性桿菌）等がある。 真核生物は通常偏性好気性であるが、酵母のように酸素が無い条件で増殖できるものも存在する。 古細菌は偏性嫌気性ないし偏性好気性生物が多いが、''Thermoplasma''、Acidianus、Sulfurisphaeraの3属、及び''Pyrolobus fumarii''、''Pyrobaculum aerophilum''は嫌気呼吸に切り替えることができる。.
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Strain 121
Strain 121は、超好熱性鉄還元古細菌で、2003年から2008年まで生物の生育温度の最高記録を保持していた古細菌である。一般的なオートクレーブ温度である121で増殖が可能と報告された。.
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桿菌
桿菌（かんきん、杆菌）とは、個々の細胞の形状が細長い棒状または円筒状を示す原核生物（（真正）細菌および古細菌）のこと。球菌、らせん菌と併せて、微生物を形態によって分類するときに用いられる慣用的な分類群である。.
溶連菌感染症
溶連菌感染症（ようれんきんかんせんしょう、Streptococcal infection）は、広義にはグラム陽性球菌のうちレンサ球菌属（-en-shortStreptococcus, 複数形は-cocci）によって惹き起こされる感染症すべてを指す。レンサ球菌属のうち特に感染症を起こす頻度が高く、一般によく知られているのは化膿レンサ球菌（-en-shortStreptococcus pyogenes）であるため、通常単に「溶連菌」といえば化膿レンサ球菌の事を指し、「溶連菌感染症」といえば化膿レンサ球菌による感染症のことを指す。 化膿レンサ球菌には他に「A群レンサ球菌」（-en-shortGroup A streptococcus, GAS）という別名もある。.
滲出性表皮炎
滲出性表皮炎（しんしゅつせいひょうひえん、英:exudative epidermitis）とはStaphylococcus hyicus感染を原因とするブタの感染症。Staphylococcus hyicusはグラム陽性の球菌であり、表皮剥脱毒素を産生する。症状は紅斑、滲出物、水疱、痂皮、皮膚剥離を特徴とし、その発病率は10%程度である。滲出物に皮垢や塵埃が付着すると黒褐色となり、煤を被ったように見えることからスス病とも呼ばれる。特徴的な病変は皮膚に限局して認められる。ワクチンはない。.
放線菌
放線菌（ほうせんきん、羅・英: Actinomycetes）は一般に、グラム陽性の真正細菌のうち、細胞が菌糸を形成して細長く増殖する形態的特徴を示すものを指していた。元来、菌糸が放射状に伸びるためこの名があるが、現在の放線菌の定義は16S rRNA遺伝子の塩基配列による分子系統学に基づいているため、桿菌や球菌も放線菌に含められるようになり、もはやこのグループを菌糸形成という形態で特徴づけることは困難である。 学名のActinobacteria（放線菌門）は、ギリシア語で光線、放射を意味するακτίς（アクティース）とバクテリアを合成したもの。また、放線菌類を意味する一般名詞Actinomyceteは、ακτίςに、菌類を意味する接尾語-mycetes（ミュケーテース、語源はギリシア語で菌を意味するμύκες（ミュケース））を合わせたものである。 ''Streptomyces''属など典型的な放線菌では空気中に気菌糸を伸ばし胞子を形成するので、肉眼的には糸状菌のように見える。多くは絶対好気性で土壌中に棲息するが、土壌以外にも様々な自然環境や動植物の病原菌としても棲息している。また病原放線菌として知られる''Actinomyces''属とその関連菌群などのように嫌気性を示す放線菌も一部存在する。放線菌のDNAはそのGC含量が高く（多くは70%前後）、それがこの菌群の大きな特徴である。 分類学的には下記に示す多くの属が放線菌綱に分類されるが、マイクロコッカス目（Order Micrococcales）の各属のように菌糸形態を示さないものは便宜的に放線菌として扱われないこともある。.
急性前立腺炎
急性前立腺炎（きゅうせいぜんりつせんえん）とは、前立腺が細菌に感染して起こり、急激に発症する急性の前立腺炎の事である細井康男 『専門医が解説する前立腺肥大とガンの最新治療』日本書院本社、2012年、p.130。正確には急性細菌性前立腺炎（きゅうせいさいきんせいぜんりつせんえん）とも言われる細井康男 『専門医が解説する前立腺肥大とガンの最新治療』日本書院本社、2012年、p.128。.
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コッカス。
