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69 関係: 加水分解酵素、定量PCR、小腸、化学に関する記事の一覧、ペプチド核酸、バロキサビルマルボキシル、メチル化、リボヌクレアーゼ、リボヌクレアーゼA、リボヌクレアーゼE、リボヌクレアーゼF、リボヌクレアーゼIV、リボヌクレアーゼIX、リボヌクレアーゼα、リボヌクレアーゼM5、リボヌクレアーゼP4、リソソーム、ヌシネルセン、トリスヒドロキシメチルアミノメタン、トレオース核酸、プリン代謝、プリオン、プロテイナーゼK、ヒストン、テロメア、デオキシリボヌクレアーゼ、ホスホジエステラーゼ、アプタマー、イントロン、インテイン、エンテロバクターリボヌクレアーゼ、エキソヌクレアーゼVII、エステラーゼ、クレノウ断片、ゲノム編集、スプライシング、CRISPR、生物学に関する記事の一覧、DNAポリメラーゼ、DNAシークエンシング、DNA複製、EcoRI、遺伝子、遺伝子ドライブ、遺伝子ターゲティング、遺伝子組み換え作物、遺伝的組換え、転写 (生物学)、薬物動態学、脱細胞、...、膵液、腸液、酵素、酵素阻害剤、I型インターフェロン、MALAT1、NUC、Pre-tRNA スプライシング、RNAポリメラーゼ、SiRNA、T7ファージ、Taqポリメラーゼ、Tiプラスミド、枯草菌リボヌクレアーゼ、核崩壊 (生物学)、核酸医薬、核溶解、活性化誘導シチジンデアミナーゼ、5'キャップ。 インデックスを展開 (19 もっと) »
加水分解酵素
加水分解酵素（かすいぶんかいこうそ、hydrolase）とはEC第3群に分類される酵素で、加水分解反応を触媒する酵素である。ヒドロラーゼと呼ばれる。代表的な反応はタンパク質、脂質、多糖〈炭水化物〉をアミノ酸、脂肪酸、ブドウ糖などに消化分解する生化学反応に関与する。あるいはコリンエステラーゼ、環状ヌクレオチドホスホジエステラーゼやプロテインホスファターゼのような生体内のシグナル伝達に関与するものも多い。.
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定量PCR
定量PCR（ていりょうピーシーアール、Quantitative polymerase chain reaction, Q-PCR）は、その産物を迅速に定量できるポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) の改良型である。これは DNA、cDNA または RNA の増幅が行われる前の総量を間接的に測る方法である。そして通常は目的の遺伝子配列が存在するかどうか、何コピー存在するのかを確かめる目的で利用される。3種類の方法があり、これらは難易度と詳細が異なる。他の PCR 同様、DNA試料は DNAポリメラーゼと温度変化によって増幅される。 アガロースゲル電気泳動、SYBRグリーン（二重鎖DNA染色）、蛍光プローブのうちのどれかがよく利用される方法である。後者2つはリアルタイムポリメラーゼ連鎖反応を使いリアルタイムに分析が可能である。.
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小腸
小腸（しょうちょう、英Small intestine）とは、消化器のうち消化管の腸の一部である。小腸では消化と吸収を行う。.
化学に関する記事の一覧
このページの目的は、化学に関係するすべてのウィキペディアの記事の一覧を作ることです。この話題に興味のある方はサイドバーの「リンク先の更新状況」をクリックすることで、変更を見ることが出来ます。 化学の分野一覧と重複することもあるかもしれませんが、化学分野の項目一覧です。化学で検索して出てきたものです。数字、英字、五十音順に配列してあります。濁音・半濁音は無視し同音がある場合は清音→濁音→半濁音の順、長音は無視、拗音・促音は普通に（ゃ→や、っ→つ）変換です。例：グリニャール反応→くりにやるはんのう †印はその内容を内含する記事へのリダイレクトになっています。 註) Portal:化学#新着記事の一部は、ノート:化学に関する記事の一覧/化学周辺に属する記事に分離されています。.
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ペプチド核酸
ペプチド核酸（ペプチドかくさん、英：Peptide Nucleic Acid）は主鎖にペプチド構造を保持した、DNAやRNAに似た構造を持つ分子である。PNAと略される。PNAは自然界には存在せず、完全に人工的に合成された分子であり、生物学や医療の分野で研究が進められている。 DNAとRNAは糖（デオキシリボース、もしくはリボース）を主鎖に持つが、PNAでは糖の代わりにN-(2-アミノエチル)グリシンがアミド結合で結合したものが主鎖となっている。そして核酸塩基に相当するプリン環やピリミジン環が、メチレン基とカルボニル基を介して主鎖に結合している。PNAではペプチドと同様にN末端を左側に、C末端を右側に書く。 PNAにはDNAやRNAに存在するようなリン酸部位の電荷が存在しないため、静電反発の影響が小さくなり、PNA/DNAの2重鎖はDNA/DNAの2重鎖よりも強い結合を形成する。PNA/DNAの2重鎖（チミン6残基のPNA / アデニン6残基のDNA）で融解温度 Tm を測定したところ31であったが、同様の塩基を持つDNA/DNAの2重鎖の融解温度は10℃以下であったことが判明している。DNAの代わりにPNAを用いても、DNA同様に分子認識される。PNA/PNAの2重鎖はPNA/DNAの2重鎖よりも強い結合を有する。 人工ペプチド核酸のオリゴマーは分子生物学分野で研究が進められており、診断分析やアンチセンス療法などへの応用が検討されている。強い結合力を持つためそれほど長い鎖長は必要ないと考えられており、20–25残基で核酸認識が可能だと考えられている。PNAの鎖長を検討する際には、認識の特異性をどれだけ上げられるのかが重要な問題となる。PNA鎖が相補的DNAに結合する際にも正確な分子認識が行われており、ミスマッチ塩基対を含むPNA/DNAの2重鎖は、同様のミスマッチを持つDNA/DNAの2重鎖より不安定になることが知られている。PNA/RNAの2重鎖の場合もPNA/DNAの2重鎖と同様の結合力と特異性を持つ。また生体内に存在する分解酵素であるヌクレアーゼやプロテアーゼに認識されにくいため、酵素に対する分解耐性を持っている。広い範囲のpHで安定に存在するという特徴も持つ。 生命の起源に関して、DNA/RNAが遺伝情報を担っている現在のプロテインワールド以前には、非常に安定に存在し得るPNAが遺伝情報を担っていたという説がある。しかしこの仮説が広く受け入れられているわけではない。.
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バロキサビルマルボキシル
バロキサビルマルボキシル（Baloxavir marboxil）はＡ型・Ｂ型インフルエンザ治療薬。商品名は「ゾフルーザ」。塩野義製薬が開発し、2018年2月23日に製造承認され、同年3月14日に販売が開始された。.
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メチル化
メチル化（メチルか、methylation）は、さまざまな基質にメチル基が置換または結合することを意味する化学用語である。この用語は一般に、化学、生化学、生物科学で使われる。 生化学では、メチル化はとりわけ水素原子とメチル基の置換に用いられる。 生物の機構では、メチル化は酵素によって触媒される。メチル化は重金属の修飾、遺伝子発現の調節、タンパク質の機能調節、RNA代謝に深く関わっている。また、重金属のメチル化は生物機構の外部でも起こることができる。さらに、メチル化は組織標本の染色におけるアーティファクトを減らすのに用いることができる。.
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リボヌクレアーゼ
リボヌクレアーゼ(ribonuclease, RNase)はリボ核酸を分解してオリゴヌクレオチドあるいはモノヌクレオチドにする反応を触媒する酵素。ヌクレアーゼの一種で、RNase(RNアーゼまたはRNエース)とも呼ばれる。 あらゆる生物に遍く存在する酵素で、内部からRNAを分解するエンドリボヌクレアーゼ、外側から分解していくエキソリボヌクレアーゼの2種に分類される。塩基を識別して分解を行う基質特異性の高いものもあり、種類は多様である。主なものとして塩基の種類を問わないリボヌクレアーゼT2()やピリミジン塩基のある部分だけ切断するリボヌクレアーゼA()、グアニンの部分のみを分解するリボヌクレアーゼT1()などがあげられる。mRNAなどの必要なRNAはリボヌクレアーゼインヒビターと呼ばれるペプチドによってリボヌクレアーゼによる分解をまぬがれている。 リボヌクレアーゼは一次構造が最初に特定された酵素として歴史に残っており、これを決定した三人の化学者はノーベル化学賞を受賞している。.
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リボヌクレアーゼA
リボヌクレアーゼA（Ribonuclease A）は、一本鎖RNAを切断するエンドヌクレアーゼの1つである。RNAアーゼA（RNase A）とも言う。子牛の膵臓のRNAアーゼAは、古典的なタンパク質科学のモデル系として用いられた。.
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リボヌクレアーゼE
リボヌクレアーゼE(Ribonuclease E、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 この酵素は細菌の持つリボヌクレアーゼで、リボソームRNA（9Sから5SrRNA）の処理に関与する。.
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リボヌクレアーゼF
リボヌクレアーゼF(Ribonuclease F、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。.
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リボヌクレアーゼIV
リボヌクレアーゼIV(Ribonuclease IV、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 この酵素は、平均鎖長が10のオリゴヌクレオチドを作る。.
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リボヌクレアーゼIX
リボヌクレアーゼIX(Ribonuclease IX、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 この酵素は、ポリ(U)及びポリ(C)に対して作用する。.
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リボヌクレアーゼα
リボヌクレアーゼα(Ribonuclease alpha、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 この酵素は、O-メチル化RNAに特異的に作用する。.
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リボヌクレアーゼM5
リボヌクレアーゼM5(Ribonuclease M5、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 この酵素は、枯草菌の5S-rRNA前駆体を5S-rRNAに変換する。.
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リボヌクレアーゼP4
リボヌクレアーゼP4(Ribonuclease P4、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。.
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リソソーム
典型的な動物細胞の模式図: (1) 核小体（仁）、(2) 細胞核、(3) リボソーム、(4) 小胞、(5) 粗面小胞体、(6) ゴルジ体、(7) 微小管、(8) 滑面小胞体、(9) ミトコンドリア、(10) 液胞、(11) 細胞質基質、(12) '''リソソーム'''、(13) 中心体 リソソーム（lysosome; ライソソーム）は、真核生物が持つ細胞小器官の一つである。リソゾーム、ライソソーム、ライソゾームまたは水解小体（すいかいしょうたい）とも呼ばれる。語源は、“lysis(分解)”+“some(〜体)”に由来する。生体膜につつまれた構造体で細胞内消化の場である。内部に加水分解酵素を持ち、エンドサイトーシスやオートファジーによって膜内に取り込まれた生体高分子はここで加水分解される。分解された物体のうち有用なものは、細胞質に吸収される。不用物はエキソサイトーシスによって細胞外に廃棄されるか、残余小体（residual body）として細胞内に留まる。単細胞生物においては、リソソームが消化器として働いている。また植物細胞では液胞がリソソームに相当する細胞内器官である。.
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ヌシネルセン
ヌシネルセン（Nusinersen、国際一般名）は、脊髄性筋萎縮症の治療に用いられる薬品である。2016年12月、この病気の初めての承認薬となり、スピンラザ (Spinraza)の商標で発売された。日本では2017年7月3日製造販売承認を得た。.
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トリスヒドロキシメチルアミノメタン
トリスヒドロキシメチルアミノメタン（tris(hydroxymethyl)aminomethane、THAM）は緩衝剤の一つで、通常はトリス（Tris）と省略して呼ばれている。分子生物学や核酸関連の生化学で用いられる各種の緩衝液の成分として広く使われている。医薬品としてはトロメタモール（Trometamol）と呼ばれ、注射薬への添加物やアシドーシス治療剤として用いられている。.
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トレオース核酸
トレオース核酸(Threose nucleic acid、TNA)は、アルバート・エッシェンモーザーが作成した人工の核酸ポリマーである。TNAは、ホスホジエステル結合で繋がれたトレオース糖の繰り返し構造からなる骨格を持つ。DNAやRNAと同様に、TNAもヌクレオチド配列の中に遺伝情報を蓄えることができる。TNAは天然には生成せず、実験室内で作られる。一部の人からは、TNAは、RNAに至る進化の過程上にあったと信じられている。 TNAポリマーは、ヌクレアーゼ分解に対して耐性を持つため、合成生物学において大きな興味を持たれている。この性質と、試験管内でダーウィン進化を経験できる性質から、TNAは、生物学的に安定な分子になり得る。 TNAは、ワトソン・クリック型の塩基対を形成して、A型のRNA螺旋構造と類似する二本鎖に自己集合する。また、TNAは、DNA及びRNAとも相補的な塩基対を形成し、天然の遺伝ポリマーとも情報を共有することができる。これらの性質及び化学的な単純性から、TNAは、遺伝物質としてRNAに先立つものであると提案されている。 TNAポリマーを実験室内で複製させることができるポリメラーゼは同定されている。TNAは、RNA複製を模倣した過程により行われる。これらのシステムでは、TNAはDNAに逆転写され、ポリメラーゼ連鎖反応で増幅し、その後、TNAに再転写される。 TNA複製をin vitro選別と組み合わせることで、ヒトのトロンビンと結合するアプタマーが生産される。この例は、TNAが、生命の特徴である遺伝と進化を担うことができることを意味する。TNAは、高いアフィニティと特異性で特定の標的と結合しうる複雑な形に折り畳まれることができる。初期の生命を維持するのに必要な機能を持つTNA酵素への進化も可能だったかもしれない。.
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プリン代謝
プリン代謝（プリンたいしゃ）とは、生物に含まれているプリン塩基の合成および分解の代謝経路である。.
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プリオン
プリオン（; IPA: ）は、タンパク質から成る感染性因子である。一般的用法としてプリオンとは理論上の感染単位を意味する。科学的表記でPrPCは多くの組織に認められる内因型のプリオンタンパク質（PrP）を指し、他方、PrPSCは神経変性を惹起するアミロイド斑形成の原因となるミスフォールド型のPrPを指す。プリオン（prion）の語は、「タンパク質性の」を意味するproteinaceousと「感染性の」を意味するinfectious の頭文字に加えて、ビリオン（virion）との類似から派生して造られた合成語である。 現時点でこの性質を有する既知因子は、いずれもタンパク質の誤って折りたたまれた（ミスフォールドした）状態を伝達することにより増殖する。ただし、タンパク質そのものが自己複製することはなく、この過程は宿主生物内のポリペプチドの存在に依存している。プリオンタンパク質のミスフォールド型は、ウシのウシ海綿状脳症（BSE、狂牛病）や、ヒトのクロイツフェルト＝ヤコブ病（CJD）といった種々の哺乳類に見られる多くの疾患に関与することが判っている。既知の全プリオン病は脳などの神経組織の構造に影響を及ぼし、現時点でこれらは全て治療法未発見の致死的疾患である。 プリオンは仮説によれば、異常にリフォールドしたタンパク質の構造が、正常型構造を有するタンパク質分子を自身と同じ異常型構造に変換する能力を持つことで伝播、感染するとされる。既知の全プリオンはアミロイドと呼ばれる構造体の形成を誘導する。アミロイドとは、タンパク質が重合することで密集したβシートから成る凝集体である。この変形構造は極めて安定で、感染組織に蓄積することにより組織損傷や細胞死を引き起こす。プリオンはこの安定性により化学的変性剤や物理的変性剤による変性処理に耐性を持ち、除去や封じ込めは難しい。 プリオンの様式を示すタンパク質は菌類でもいくつか発見されているが、哺乳類プリオンの理解を助けるモデルとなることから、その重要性が注目されている。しかし、菌類のプリオンは宿主内で疾患につながるとは考えられておらず、むしろタンパク質による一種の遺伝的形質を介して進化の過程で有利に働くのではないかと言われている。.
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プロテイナーゼK
プロテイナーゼK（）は、広い切断特異性を持つセリンプロテアーゼの一種である。1974年に、菌類Engyodontium album（旧名：Tritirachium album）の抽出液から発見された。天然のケラチン（keratin、髪の毛）を消化する能力を有するので、「プロテイナーゼK」と名付けられた。主要な切断部位は、脂肪族アミノ酸や芳香族アミノ酸のカルボキシル基側のペプチド結合である。その基質特異性の広さから、広く用いられている。別名として、プロテアーゼK（）またはエンドペプチダーゼK（）とも呼ばれる。 分子生物学の分野においてプロテイナーゼKは、タンパク質を消化することにより核酸の調合液から汚染物を除去するために広く用いられている。核酸調合液にプロテイナーゼKを加えると、核酸を分解するヌクレアーゼを即座に不活化することができる。これを行わないと、核酸の精製中にヌクレアーゼが核酸であるDNAやRNAを分解してしまう。プロテイナーゼKはこの応用によく適している。この理由は、プロテイナーゼKはドデシル硫酸ナトリウム（SDS）や尿素などの変性剤、EDTAやスルフヒドリル試薬などのキレート剤、さらにはトリプシン阻害薬やキモトリプシン阻害薬の存在下でもプロテアーゼとしての活性を失うことがないことによる。プロテイナーゼKは4～12という広い範囲のpHで安定であり、その最適pHは7.5～12である。 プロテイナーゼKの天然タンパク質に対する酵素活性は、SDSなどの変性剤により促進される。これとは対照的に、ペプチド基質を用いて酵素活性を計測してみると、プロテイナーゼKの活性は変性剤により阻害される。一見矛盾したこの2つの現象は、基質となるタンパク質が変性剤により変性したためプロテイナーゼKの活性部位に届きやすくなった、として説明されている。.
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ヒストン
ヒストン（histone）は、真核生物のクロマチン（染色体）を構成する主要なタンパク質である。.
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テロメア
テロメア (telomere) は真核生物の染色体の末端部にある構造。染色体末端を保護する役目をもつ。telomere はギリシア語で「末端」を意味する τέλος (telos) と「部分」を意味する μέρος (meros) から作られた語である。末端小粒（まったんしょうりゅう）とも訳される。 染色体（左）とテロメア（右・拡大）：詳細は本文を参照.
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デオキシリボヌクレアーゼ
デオキシリボヌクレアーゼ (deoxyribonuclease, DNase) はデオキシリボ核酸のホスホジエステル結合を切断してオリゴヌクレオチドないしモノヌクレオチドに分解する一群の酵素の総称。DNase（ディーエヌアーゼ、またはディーエヌエース）とも呼ばれる。 末端から分解してゆくエキソヌクレオチダーゼと内部から分解してゆくエンドヌクレアーゼに大別されるほか、3'側のホスホジエステル結合を分解するものと5'側から分解するものに分けられる。前者にはデオキシリボヌクレアーゼI（DNアーゼI、EC 3.1.21.1）などが、後者にはデオキシリボヌクレアーゼII（DNアーゼII, EC 3.1.22.1）などがある。また、特異な例として2本鎖DNAは分解しないが1本鎖DNAを分解するものも存在する。殆どあらゆる生物に存在し、DNAの代謝等に関わっている。.
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ホスホジエステラーゼ
ホスホジエステラーゼ (Phosphodiesterase, PDE) とは、広義にはリン酸ジエステル結合（1分子のリン酸が2個の水酸基と結合した構造）の一方の結合を加水分解する酵素である。 これにはホスホリパーゼC・Dのようなリン脂質を分解するものや、核酸を分解するヌクレアーゼなども含まれる。 しかし一般には、cAMPやcGMPの環状リン酸ジエステルを加水分解する酵素（環状ヌクレオチドホスホジエステラーゼ）を特にホスホジエステラーゼと呼ぶ。 cAMPやcGMPはセカンドメッセンジャーであり、PDEはその酵素活性のバランスによってその濃度を調節し、シグナル伝達に重要な役割を担っている。 哺乳類においてPDEのスーパーファミリーは11種類あり、基質特異性などが異なる。.
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アプタマー
アプタマー（Aptamer）とは、特定の分子と特異的に結合する核酸分子やペプチドである。通常ランダム配列の巨大ライブラリ中から選び出してくるが、自然界にも存在しておりリボスイッチとして知られている。基礎から薬剤探索などの応用まで幅広く研究されている。リボザイムと複合化したアプタマーも存在しており、ターゲット分子存在下で自己開裂するものが知られている。 大きく分けると核酸（DNA・RNA）アプタマー、ペプチドアプタマーの2種に分類される。.
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イントロン
イントロン（intron）は、転写はされるが最終的に機能する転写産物からスプライシング反応によって除去される塩基配列。つまり、アミノ酸配列には翻訳されない。スプライシングによって除去されず、最終的にアミノ酸配列に翻訳される部位をエキソンと呼ぶ。 イントロンは一見無駄に見えるが、選択的スプライシングや、エキソンシャッフリングを可能にし、また、mRNAを核から運び出す過程や、翻訳効率などに関わっていることがわかってきた。.
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インテイン
インテインを含むタンパク質スプライシングの機構。N-エクステインは赤色、インテインは黒色、C-エクステインは青色で示されている。Xは酸素原子あるいは硫黄原子を表わす。 インテイン（Intein）とはタンパク質分子の一部分で、自動的に切除され、残った部分（エクステイン）がペプチド結合で再結合される（「タンパク質スプライシング」）ようなものをいう。"タンパク質イントロンprotein intron"という呼び方もされる（遺伝子中のイントロンではない）。報告されているインテインのほとんどはエンドヌクレアーゼ（ホーミングエンドヌクレアーゼHoming endonucleaseと呼ばれる）のドメインを含み、これはインテインの伝播に関わっている。実際多くの遺伝子がインテインをコードする部分を含んでいるがそれらは互いに関係なく挿入位置も異なる。このような理由からインテイン（正確にいえば遺伝子のインテインをコードする部分）は利己的遺伝要素（あるいは寄生的遺伝要素）とされる。インテインによるタンパク質スプライシングはmRNAが翻訳されてタンパク質になった後に起こるものである。このタンパク質前駆体は3つの部分 - N-末端側エクステイン、インテイン、C-末端側エクステイン - からなる。このスプライシングによってできたタンパク質分子もエクステイン（Extein）と呼ばれる。 最初のインテインは1987年に発見され、それ以後インテインはすべての3つの生物界（真核生物、真正細菌、古細菌）に見出されている。スプライシングのメカニズムはタンパク質を化学的に連結する化学ライゲーション法（ちょうどインテインが発見された頃開発された）に類似している。.
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エンテロバクターリボヌクレアーゼ
ンテロバクターリボヌクレアーゼ(Enterobacter ribonuclease、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 この酵素は、CpAの位置で選択的に切断する。.
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エキソヌクレアーゼVII
ヌクレアーゼVII(Exonuclease VII、)は、細菌の持つエキソヌクレアーゼである。大きいもの1つと小さいもの4つからなる2種類の非相同サブユニットから構成される。エキソヌクレアーゼVIIは、核酸を3'から5'方向と5'から3'方向の両方向にエキソ型切断し、5'-ホスホモノ核酸を生成する。大きな方のサブユニットは、N末端に、核酸に結合するOBフォールドドメインを持つ。.
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エステラーゼ
テラーゼ（Esterase）は、エステルを水との化学反応で酸とアルコールに分解する加水分解酵素である。 基質特異性やタンパク質構造、生理学的機能に応じて、広い範囲の様々なエステラーゼが存在する。.
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クレノウ断片
レノウ断片（左）とDNAポリメラーゼI（右）の構造の比較。 クレノウ断片（クレノウだんぺん、Klenow fragment）は、大腸菌のDNAポリメラーゼIをタンパク質分解酵素で部分分解して得られる断片のうち、大きな方の断片である。DNAポリメラーゼIが持つ3種の活性（DNAポリメラーゼ、5'→3'エキソヌクレアーゼ、3'→5'エキソヌクレアーゼ）のうち、5'→3'エキソヌクレアーゼ活性が失われている。名は1970年にデンマークの生化学者ハンス・クレノウが報告した ことにちなんでおり、クレノウフラグメント、クレノウ酵素とも呼ばれる。.
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ゲノム編集
ノム編集（ゲノムへんしゅう、）とは、部位特異的なヌクレアーゼを利用して、思い通りに標的遺伝子を改変する技術である。ヌクレアーゼとしては、2005年以降に開発・発見された、ZFN（ズィーエフエヌ、または、ジンクフィンガーヌクレアーゼ）、TALEN（タレン）、CRISPR/Cas9（クリスパー・キャスナイン）を中心としている。従来の遺伝子工学、遺伝子治療と比較して、非常に応用範囲が広い。.
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スプライシング
プライシング (splicing) は、細長い物をつなぐ様子を表す言葉。.
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CRISPR
CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat; クリスパー)は数十塩基対の短い反復配列を含み、原核生物における一種の獲得免疫系として働く座位である。配列決定された原核生物のうち真正細菌の4割と古細菌の9割に見出されており、プラスミドやファージといった外来の遺伝性因子に対する抵抗性に寄与している 。.
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生物学に関する記事の一覧
---- 生物学に関する記事の一覧は、生物学と関係のある記事のリストである。ただし生物学者は生物学者の一覧で扱う。また生物の名前は生物学の研究材料としてある程度有名なもののみ加える。 このリストは必ずしも完全ではなく、本来ここにあるべきなのに載せられていないものや、ふさわしくないのに載せられているものがあれば、適時変更してほしい。また、Portal:生物学の新着項目で取り上げたものはいずれこのリストに追加される。 「⇒」はリダイレクトを、(aimai) は曖昧さ回避のページを示す。並べ方は例えば「バージェス動物群」なら「はしえすとうふつくん」となっている。 リンク先の更新を参照することで、このページからリンクしている記事に加えられた最近の変更を見ることが出来る。Portal:生物学、:Category:生物学も参照のこと。.
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DNAポリメラーゼ
DNA ポリメラーゼ (DNA polymerase; -ポリメレース) は1本鎖の核酸を鋳型として、それに相補的な塩基配列を持つ DNA 鎖を合成する酵素の総称。一部のウイルスを除くすべての生物に幅広く存在する。DNA を鋳型としてDNA を合成する DNA 依存性 DNA ポリメラーゼ(EC 2.7.7.7)と、RNA を鋳型として DNA を合成する RNA 依存性 DNA ポリメラーゼ(EC 2.7.7.49)の、2つのタイプに分けられる。前者はDNA複製やDNA修復において中核的な役割を担う酵素である。一方後者はセントラルドグマの範疇から逸脱する位置にある酵素で、逆転写酵素やテロメラーゼを含む。.
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DNAシークエンシング
DNAシークエンシング (DNA sequencing) とは、DNAを構成するヌクレオチドの結合順序（塩基配列）を決定することである。DNAは生物の遺伝情報のほとんど全てを担う分子であり、基本的には塩基配列の形で符号化されているため、DNAシークエンシングは遺伝情報を解析するための基本手段となっている。手法としては1977年に開発されたサンガー法が改良を加えながら用いられているが、最近新しい方法も開発されており中には実用化されているものもある。 DNAの塩基配列には生命体に必要な情報が符号化されているので、配列決定はミクロなレベルの生物学の基盤となっており、分類学や生態学のようなマクロな生物学でも盛んに応用されている。また医学面でも遺伝病や感染症の診断や治療法の開発などに役立っている。ウォルター・ギルバートとフレデリック・サンガーは、DNAシークエンシングの手法を開発した功績により1980年のノーベル化学賞を受賞している。.
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DNA複製
'''図1 DNA複製の模式図'''.青色の二本の帯が鋳型鎖(Template Strands)。2本が平行に並んでいる上部は二重らせん、斜めになって非平行になっている下部は二重らせんが解けて一本鎖となった領域である。上部と下部の境目が複製フォーク (Replication Fork) であり、二重らせん領域は時間とともに解けられていくので複製フォークは図の上側へと進行していく。下部の2本の一本鎖はそれぞれ異なる様式でDNAポリメラーゼ（DNA Polymerase、緑色）により複製され、上から見て5'から3'の左の鋳型鎖ではDNAポリメラーゼが複製フォークと同じ方向に進行し、一本のリーディング鎖 (Leading Strand) が合成される。上から見て3'から5'の右の鋳型鎖ではDNAポリメラーゼが複製フォークと逆の方向に進み、途切れ途切れにいくつもの岡崎フラグメント (Okazaki Fragments) が合成されていく。伸長が終わった岡崎フラグメントはDNAリガーゼ（DNA Ligase、ピンク）によりつなぎ合わせられ、ラギング鎖 (Lagging Strand) となる。 DNA複製（ディーエヌエイふくせい、DNA replication）は、細胞分裂における核分裂の前に、DNAが複製されてその数が2倍となる過程である。生物学ではしばしば複製 (replication) と略される。セントラルドグマの一員とされる。複製される一本鎖DNAを親鎖 (parent strand)、DNA複製によって新しく合成された一本鎖DNAを娘鎖 (daughter strand) という。また、DNA複製により生じた染色体の個々を姉妹染色分体 (sister chromatid) という。.
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EcoRI
EcoRIの構造 EcoRI（えこあーるわん）は、II型の制限酵素の一種で、制限酵素としては最も代表的なものである。.
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遺伝子
遺伝子（いでんし）は、ほとんどの生物においてDNAを担体とし、その塩基配列にコードされる遺伝情報である。ただし、RNAウイルスではRNA配列にコードされている。.
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遺伝子ドライブ
遺伝子ドライブ（）とは、特定の遺伝子あるいは遺伝子群が偏って遺伝する現象である。遺伝子ドライブは様々なメカニズムを介して生じる可能性があり、結果としてその個体群における特定遺伝子の保有率は増大する。一定範囲の個体群、または生物種全体を遺伝的に改変する有効な手段として、人為的な遺伝子ドライブが提案されている。 遺伝子ドライブの応用には、病原体を運搬する昆虫(特にマラリア、デング熱、ジカ熱を媒介する蚊)の拡散防止、外来種の制御、除草剤や農薬抵抗性の除去が含まれる。病原媒介者の生殖能力を低下させることでその個体群の壊滅を引き起こすというように、この技術は遺伝子の追加、破壊、または改変に利用することができる。 いくつかの分子メカニズムが遺伝子ドライブを媒介することができる。遺伝子ドライブのメカニズムは自然起源であり、対立遺伝子が通常の50％よりも大きな伝達機会をもたらす分子メカニズムを進化させた際に発生した。実験室内個体群向けのゲノム編集技術として、類似の特性を有する合成遺伝子モジュールが開発されている。当記事ではエンドヌクレアーゼベースの遺伝子ドライブ、つまり最も汎用的かつ活発な発展の最中にある人為的遺伝子ドライブ用の分子バックエンドに焦点を当てる。遺伝子ドライブは有性生殖を行う種でのみ機能するため、ウイルスや細菌の集団を操作するために使用することはできない。 目的の遺伝子を人為的に偏らせて遺伝させる手段であるため、遺伝子ドライブはバイオテクノロジーにおける転換点となる。遺伝子ドライブ改変された生物を自然環境下に放つことの潜在的影響は、それらの発生や管理に関する生命倫理上の重大な懸念をもたらす。.
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遺伝子ターゲティング
遺伝子ターゲティング（ジーンターゲティング、gene targeting；また相同組換えによる塩基置換戦略）は、内在性の遺伝子の改変に相同組換えを用いる遺伝子工学的手法である。この方法は遺伝子の削除、エキソンの除去、遺伝子の導入、点変異の導入などに用いることができる。遺伝子ターゲティングの効果には恒久的なものと、限定的なものとがあり得る。限定的な効果とは、標的となる生物の特定の成長段階や生涯の中の特定時期、また特定の組織における効果などを指す。遺伝子ターゲティングでは対象となる遺伝子に応じて個別にベクターを作成する必要がある一方で、転写活性や遺伝子サイズに関わらずどんな遺伝子にも応用可能である。.
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遺伝子組み換え作物
遺伝子組換え作物（いでんしくみかえさくもつ）は、遺伝子組換え技術を用いて遺伝的性質の改変が行われた作物である。 日本語では、いくつかの表記が混在している。「遺伝子組換作物反対派」は遺伝子組み換え作物、厚生労働省などが遺伝子組換え作物、食品衛生法では組換えDNA技術応用作物、農林水産省では遺伝子組換え農産物などの表記を使うことが多い。 英語の からGM作物、GMOとも呼ばれることがある。なお、GMOは通常はトランスジェニック動物なども含む遺伝子組換え生物を指し、作物に限らない。 GMO生産マップ（2005年）。オレンジ色の5カ国はGMOの95%を生産している。オレンジ色の斜線の国々はGMOを生産している。オレンジの点の国々は屋外での実験が許可されている。.
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遺伝的組換え
遺伝的組換え（いでんてきくみかえ）は、狭義には、生物自身が遺伝子をコードするDNA鎖を途中で組み変える現象を差す。英語のRecombinationに相当する言葉として用いられる。広義には人工的な遺伝子組み換えも遺伝的組換えと記述される。.
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転写 (生物学)
転写中のDNAとRNAの電子顕微鏡写真。DNAの周りに薄く広がるのが合成途中のRNA（多数のRNAが同時に転写されているため帯状に見える）。RNAポリメラーゼはDNA上をBeginからEndにかけて移動しながらDNAの情報をRNAに写し取っていく。Beginではまだ転写が開始された直後なため個々のRNA鎖が短く、帯の幅が狭く見えるが、End付近では転写がかなり進行しているため個々のRNA鎖が長く（帯の幅が広く）なっている 転写（てんしゃ、Transcription）とは、一般に染色体またはオルガネラのDNAの塩基配列(遺伝子)を元に、RNA(転写産物transcription product)が合成されることをいう。遺伝子が機能するための過程（遺伝子発現）の一つであり、セントラルドグマの最初の段階にあたる。.
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薬物動態学
薬物動態学（やくぶつどうたいがく、pharmacokinetics）は、生体に投与した薬物の体内動態とその解析方法について研究する学問である。.
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脱細胞
脱細胞 (だつさいぼう、Decellularization) とは、組織から細胞を除去する処理である。生物由来の人工臓器作成時にしばしば用いられる。 この処理により得られる実質は、通常の臓器移植で生じる拒絶反応を抑えるなどの治療上有益な点を持つ。.
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膵液
膵液（すいえき）は、膵臓で分泌される体液（消化液）である。三大栄養素の全てを消化できる。 食後、膵管から十二指腸へと出る。.
腸液
腸液（ちょうえき）は、小腸の空腸で分泌されるアルカリ性の体液（消化液）である。 消化の最終確認をする消化液である。消化できる栄養素は解釈によって異なるが、主なはたらきは、蛋白質をアミノ酸に変えるものである。排便時、または肛門・直腸内に異物が侵入した場合、そのダメージを和らげるために分泌されることが多い。 かつては、腸液に炭水化物をブドウ糖に分解する酵素が含まれていると考えられていたが、炭水化物は膵液で二糖類のマルトースまで分解され、最終的に小腸の上皮細胞に存在するマルターゼ、スクラーゼ、イソマルターゼ、ラクターゼ、トレハラーゼなどの二糖類水解酵素により単糖類のグルコース、フルクトース、ガラクトースなどにまで分解されて初めて腸管からの吸収が可能となる。.
酵素
核酸塩基代謝に関与するプリンヌクレオシドフォスフォリラーゼの構造（リボン図）研究者は基質特異性を考察するときに酵素構造を抽象化したリボン図を利用する。 酵素（こうそ、enzyme）とは、生体で起こる化学反応に対して触媒として機能する分子である。酵素によって触媒される反応を“酵素的”反応という。このことについて酵素の構造や反応機構を研究する古典的な学問領域が、酵素学 （こうそがく、enzymology）である。.
酵素阻害剤
酵素阻害剤（こうそそがいざい）とは、酵素分子に結合してその活性を低下または消失させる物質のことである。酵素阻害剤は一般に生理活性物質であり、毒性を示すものもあるが、病原体を殺したり、体内の代謝やシグナル伝達などを正常化したりするために医薬品として利用されるものも多い。また殺虫剤や農薬などに利用される種類もある。 酵素に結合する物質すべてが酵素阻害剤というわけではなく、逆に活性を上昇させるもの（酵素活性化剤）もある。 酵素阻害剤の作用には、酵素の基質が活性中心に入って反応が始まるのを阻止するもの、あるいは酵素による反応の触媒作用を阻害するものがある。また酵素に可逆的に結合するもの（濃度が下がれは解離する）と、酵素分子の特定部分と共有結合を形成して不可逆的に結合するものとに分けられる。さらに阻害剤が酵素分子単独、酵素・基質複合体、またその両方に結合するかなどによっても分類される。 生体内にある物質が酵素阻害物質になることもある。例えば、代謝経路の途中にある酵素では、下流の代謝産物により阻害されるものがあり（フィードバック阻害）、これは代謝を調節する機構として働いている。さらに、生物体内にあって生理的機能を持つ酵素阻害タンパク質もある。これらはプロテアーゼやヌクレアーゼなど、生物自身に害を及ぼしうる酵素を厳密に制御する機能を持つものが多い。 酵素阻害剤には、基質と同様に酵素に対する特異性がある場合が多い。一般に医薬品としての阻害剤では、特異性の高い方が毒性・副作用が少ないとされる。また抗菌薬や殺虫剤に求められる選択毒性を出すためにも高い特異性が必要である。.
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I型インターフェロン
I型インターフェロン（いちがた―）（英：type I interferon）とは、インターフェロンファミリーのうち、インターフェロンα（IFN-α）とインターフェロンβ（INF-β）などを含めた総称で、ウイルス感染で誘導される抗ウイルス系のサイトカインである。「I型」という名前は、免疫系の細胞によって分泌されマクロファージを活性化するII型インターフェロン（INF-γ）などと区別するための呼称であるが、一般に「インターフェロン」というとI型インターフェロンのことを指す。インターフェロン自体は、あるウイルスを感染させた細胞に別のウイルスを感染させると、後から感染させたウイルスの増殖が抑えられる「ウイルス干渉」と呼ばれる現象における干渉物質として見つかったものである。.
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MALAT1
MALAT1（metastasis associated in lung adenocarcinoma transcript-1）またはNEAT2は2003年に転移性肺癌で高発現しているRNAとして発見された8,000塩基長程度の非常に発現の多い長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）である。その後、がん細胞だけではなく様々な正常組織でも発現することが明らかにされている。神経系などにおいてはRNAポリメラーゼⅡによって転写される遺伝子の中では最も発現量を示す遺伝子である。またMALAT1は哺乳類で広く保存されていることが知られている。チンパンジー、アカゲザル、マウスではオルソログが見つかっている。.
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NUC
NUC, nuc.
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Pre-tRNA スプライシング
pre-tRNAスプライシングは、tRNA前駆体の受けるスプライシング反応である。広範囲な生物種に認められる。反応基質がpre-tRNAであることからpre-tRNAスプライシングと呼ばれるが、それを支配するいくつかの異なった機構が存在すると考えられている。.
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RNAポリメラーゼ
RNAポリメラーゼ (RNA polymerase) とは、リボヌクレオチドを重合させてRNAを合成する酵素。DNAの鋳型鎖（一本鎖）の塩基配列を読み取って相補的なRNAを合成する反応(転写)を触媒する中心となる酵素をDNA依存性RNAポリメラーゼという（単に「RNAポリメラーゼ」とも呼ぶ）。「ポリメラーゼ」は、より英語発音に近い「ポリメレース」と呼ばれることも多い。 真核生物では、DNAを鋳型にしてmRNAやsnRNA遺伝子の多くを転写するRNAポリメラーゼIIがよく知られる。このほかに35S rRNA前駆体を転写するRNAポリメラーゼI、tRNAとU6 snRNA、5S rRNA前駆体等を転写するRNA ポリメラーゼIIIなどがあり、上記三種は DNA依存性RNAポリメラーゼと呼ばれる。また、RNAを鋳型にRNA を合成するRNA依存性RNAポリメラーゼもあり、多くのRNAウイルスで重要な機能を果たす以外に、microRNAの増幅過程にも利用される。 鋳型を必要としない物もあり、初めて発見されたRNA ポリメラーゼであるポリヌクレオチドホスホリラーゼ（ポリヌクレオチドフォスフォリレース、ポリニュークリオタイドフォスフォリレース）もそのひとつとしてあげられる。この酵素は実際には細菌の細胞内でヌクレアーゼとして働くが、試験管内ではRNA を合成することができる。これを利用して一種類のヌクレオチドからなるRNAを合成し、それから翻訳されるタンパク質を調べることで初めて遺伝暗号の決定が行われた。真核生物のもつpoly(A)ポリメラーゼも同様に鋳型を必要とせず、Pol II転写産物の3'末端にpoly(A)鎖を付加することで転写後の遺伝子発現制御機構の一端を担っている。 真核生物の転写装置（RNAポリメラーゼ）は、Pol I、Pol II、Pol IIIの3種がある。それぞれ10種類以上ものサブユニットから構成される（基本的には12種）。また、古細菌のRNAポリメラーゼもサブユニット数が多く、9-14種のサブユニットから構成されている。ユリアーキオータではいくつかのサブユニットが省かれているが、一部のクレンアーキオータには真核生物の12種類のサブユニットが全て保存されており、真核生物の持つ3種のRNAポリメラーゼの祖先型と考えられている。古細菌のRNAポリメラーゼは、Aサブユニットが2つに分かれている特徴がある。 一方で、真正細菌のRNAポリメラーゼは全体的に真核生物や古細菌のものより単純な構成である。ααββ'ωの4種5サブユニットからなるコアエンザイムに、σが会合したホロエンザイムと呼ばれる形態で正常なプロモーターを認識する。シグマ因子は遺伝子上流のプロモーター配列を認識して転写を開始する役割を担っている。.
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SiRNA
siRNAによるRNA干渉。 siRNA（small interfering RNA）とは21-23塩基対から成る低分子二本鎖RNAである。siRNAはRNA干渉（RNAi）と呼ばれる現象に関与しており、伝令RNA（mRNA）の破壊によって配列特異的に遺伝子の発現を抑制する。この現象はウイルス感染などに対する生体防御機構の一環として進化してきたと考えられている。siRNAは線虫や植物における転写後の遺伝子サイレンシング機構（PTGS）として存在することが報告されていたが、その後合成のsiRNAがヒトの細胞においてRNA干渉を引き起こすことが分かり、siRNAを用いたRNA干渉は遺伝子をノックダウンする方法として生物学および医薬分野の基礎研究に応用されていると共に、臨床への応用も期待されている。.
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T7ファージ
T7ファージ（バクテリオファージT7、T7、英:Bacteriophage T7）はポドウイルス科に属し、二本鎖DNAをゲノムとして持ち、大腸菌を宿主とするバクテリオファージの種である。溶源化せずに必ず溶菌サイクルを送ると考えられている。T7ファージの持つRNAポリメラーゼは転写速度が速く、T7プロモーターに対し高い特異性を示すという特徴を持ち、タンパク質発現系などに応用されている。.
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Taqポリメラーゼ
Taqポリメラーゼの構造 Taqポリメラーゼ (Taq polymerase) とは、好熱菌 Thermus aquaticus が産生するDNAポリメラーゼ（EC.2.7.7.7）である。90℃以上の高温でも比較的安定である（DNAポリメラーゼ活性は低下する）ため、PCRに利用されている。ちなみに、この酵素の名前は、産生菌の属名の頭文字と種小名の頭二文字 に由来する。 Taqポリメラーゼは熱水噴出孔に生息している から同定されたポリメラーゼである。このポリメラーゼはPCRのような熱を加える実験系に置いても構造が安定であり、変性状態になりにくい。.
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Tiプラスミド
Tiプラスミドの構造 Tiプラスミド(Ti plasmid)または腫瘍誘発プラスミド(tumor inducing plasmid)は、アグロバクテリウム属のA.
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枯草菌リボヌクレアーゼ
枯草菌リボヌクレアーゼ(Bacillus subtilis ribonuclease、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。.
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核崩壊 (生物学)
細胞生物学における核崩壊（かくほうかい、Karyorrhexis、ギリシア語のκάρυον karyon〔仁、種、核〕とῥῆξις rhexis〔破裂〕由来; カリオレキシス）は、死にかけている細胞の核の破壊的断片化であり、それによってクロマチンは細胞質のあらゆる場所に不規則に分布する。核崩壊の前には大抵核濃縮（pyknosis）が起こる。核崩壊はプログラムされた細胞死（アポトーシス）、老化、壊死（ネクローシス）のいずれの結果としても起こりうる。 アポトーシスでは、DNAの切断はCa2+およびMg2+依存性エンドヌクレアーゼによって行われる。.
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核酸医薬
核酸医薬（oligonucleotide therapeutics）とは天然型ヌクレオチドまたは化学修飾型ヌクレオチドを基本骨格とする薬物であり、遺伝子発現を介さずに直接生体に作用し、化学合成により製造されることを特徴とする。代表的な核酸医薬にはアンチセンスオリゴヌクレオチド、RNAi、アプタマー、デコイなどがあげられる。核酸医薬は化学合成により製造された核酸が遺伝子発現を介さずに直接生体に作用するのに対して、遺伝子治療薬は特定のDNA遺伝子から遺伝子発現させ、何らかの機能をもつ蛋白質を産出させる点が異なる。核酸医薬は高い特異性に加えてmRNAやnon-coding RNAなど従来の医薬品では狙えない細胞内の標的分子を創薬ターゲットにすることが可能であり、一度プラットフォームが完成すれば比較的短時間で規格化しやすいという特徴がある。そのため核酸医薬は低分子医薬、抗体医薬に次ぐ次世代医薬であり癌や遺伝性疾患に対する革新的医薬品としての発展が期待されている。.
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核溶解
核溶解（かくようかい、karyolysis、ギリシア語のκάρυον karyon〔仁、種、核〕とλύσις lysis〔λύειν lyein、分かれる〕由来）は、エンドヌクレアーゼによる酵素的分解ために起こる死にかけている細胞のクロマチンの完全な分解である。全細胞は核溶解の後は最終的にエオシンによって一様に染色される。核溶解は大抵核崩壊と関連しておりネクローシスの結果として主に起こる。それに対してアポトーシスでは核崩壊後に核は大抵「アポトーシス小体」へと分解する。 散在性の移行細胞の細胞質の崩壊、核の濃縮、核の溶解は健康な人の尿中でも悪性細胞を含む尿中でも見られる。部分的に保存された細胞質のタグを持つ細胞はPapanicolaouによって最初に記述され、コメット細胞またはデコイ細胞と呼ばれることがある。この細胞は悪性腫瘍の特徴の一部を有していることがあり、したがって何であるかを認識することは重要である。.
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活性化誘導シチジンデアミナーゼ
活性化誘導シチジンデアミナーゼ（かっせいかゆうどうシチジンデアミナーゼ、Activation-Induced (Cytidine) Deaminase、AID）は、DNA中のシチジン基からアミノ基を取り除く（脱アミノ）、24 kDaの酵素である。 AIDは現在、二次抗体多様化のマスター制御因子であると考えられている。AIDがその開始に関与しているのは、3つに分かれた免疫グロブリン(Ig)多様化プロセス、体細胞超変異(SHM)、クラススイッチ組換え(CSR)、遺伝子変換(GC)である。 AIDは一本鎖DNA上でアクティブになることがin vitroで示されており、また、その脱アミノ活性を発揮するには活性転写を必要とすることが示されている。 シス因子の関与は疑われており、AID活性は、AID活性への関与が知られる他のゲノム領域よりも免疫グロブリン"可変"領域中で数段強くなっている。これは、人工的なレポーター遺伝子構造とゲノムに統合されてきた導入遺伝子(トランスジーン)からも真である。.
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5'キャップ
5'キャップとは、真核生物の細胞質mRNAなどの5'末端に見られる修飾構造で、成熟mRNAの安定性と翻訳開始などに関与している。ミトコンドリアや葉緑体のmRNAにはキャップ構造は存在しない。.
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