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103 関係: AMP、AMPヌクレオシダーゼ、AMPデアミナーゼ、ATP測定法、安息香酸CoAリガーゼ、尿素回路、化合物一覧、化学に関する記事の一覧、チロシンtRNAリガーゼ、ハツタケ、バリンtRNAリガーゼ、ポリリン酸、メチオニンtRNAリガーゼ、メバロン酸経路、リン酸塩、リボースリン酸ジホスホキナーゼ、リボヌクレオチド、リボフラビン、リシンtRNAリガーゼ、リシンtRNAPylリガーゼ、ロイシンtRNAリガーゼ、ヌクレオチド、トリプトファンtRNAリガーゼ、トレオニンtRNAリガーゼ、ブルガキサンチン、プリン塩基、プリン代謝、プロリンtRNAリガーゼ、プロピオン酸CoAリガーゼ、ヒスチジンtRNAリガーゼ、ビオチンCoAリガーゼ、ビタミン、ビタミンB群、ピロリン酸塩、フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ、フィタン酸CoAリガーゼ、フェニルアラニンラセマーゼ (ATP加水分解)、フェニルアラニンtRNAリガーゼ、フェニル酢酸CoAリガーゼ、ホスホリボシル二リン酸、呼吸、アミノアシルtRNA合成酵素、アミドホスホリボシルトランスフェラーゼ、アミガサタケ、アラニンtRNAリガーゼ、アラキドン酸CoAリガーゼ、アリールアルデヒドデヒドロゲナーゼ (NADP+)、アルギニンtRNAリガーゼ、アデノシン-3',5'-ビスリン酸、アデノシン三リン酸、...、アデノシン二リン酸、アデニリル-硫酸レダクターゼ (チオレドキシン)、アデニリル-硫酸レダクターゼ (グルタチオン)、アデニリル硫酸レダクターゼ、アデニル酸ジメチルアリルトランスフェラーゼ、アデニロコハク酸リアーゼ、アデニロコハク酸シンターゼ、アデニン、アディポネクチン、アシルCoA、アスパラギンシンテターゼ、アスパラギン酸tRNAAsnリガーゼ、アスパラギン酸tRNAリガーゼ、アスパラギンtRNAリガーゼ、アセトンカルボキシラーゼ、アセト酢酸CoAリガーゼ、イノシン酸、イソロイシンtRNAリガーゼ、オキソアニオン、カルノシン合成酵素、グリシンtRNAリガーゼ、グルコーストランスポーター、グルタミン酸tRNAリガーゼ、グルタミン酸tRNAGlnリガーゼ、グルタミンtRNAリガーゼ、シトルリン、システインtRNAリガーゼ、ジカルボン酸CoAリガーゼ、セリンtRNAリガーゼ、サルベージ経路、サイトカイニン、B8、C4型光合成、睡眠、糖尿病の治療、生物学に関する記事の一覧、略称・略号の一覧 (化合物名)、D-アラニン-ポリ(ホスホリビトール)リガーゼ、酢酸、GMPシンターゼ、MRNA前駆体、NAD+合成酵素、NAD+シンターゼ、O-スクシニル安息香酸CoAリガーゼ、RNAリガーゼ、核酸、2-フロ酸CoAリガーゼ、3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン酸CoAリガーゼ、4-ヒドロキシ安息香酸CoAリガーゼ、4-クマル酸CoAリガーゼ、4-クマロイルCoA、4-クロロ安息香酸CoAリガーゼ、6-カルボキシヘキサン酸CoAリガーゼ。 インデックスを展開 (53 もっと) »
AMP
AMP.
AMPヌクレオシダーゼ
AMPヌクレオシダーゼ(AMP nucleosidase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。.
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AMPデアミナーゼ
AMPデアミナーゼ(AMP deaminase, AMPD)はプリン代謝に関わる酵素で、AMPをIMPに変換するアミノ加水分解酵素である。アデニル酸脱アミノ酵素(adenylate deaminase)とも呼ぶ。.
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ATP測定法
ATP測定法（ATPそくていほう）とは、すべての生物の細胞内に存在するATP（アデノシン三リン酸）を酵素などと組み合わせて発光させ、その発光量（Relative Light Unit；RLU）を測定する方法のことである。ATPふき取り検査とも呼ばれる。.
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安息香酸CoAリガーゼ
安息香酸CoAリガーゼ(Benzoate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと安息香酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とベンゾイルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、安息香酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、benzoate-coenzyme A ligase、benzoyl-coenzyme A synthetase、benzoyl CoA synthetase (AMP forming)等がある。 この酵素は、安息香酸の分解に関与している。.
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尿素回路
尿素回路（にょうそかいろ、Urea cycle）、またはオルニチン回路(Ornithine cycle)は、ほとんどの脊椎動物に見られる代謝回路のひとつ。肝臓細胞のミトコンドリアと細胞質において発現し、アンモニアから尿素を生成する。最初に発見された代謝回路であり、1932年にハンス・クレブスとクルツ・ヘンゼライトによって発見された（クレブスのクエン酸回路は1937年に発見）。.
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化合物一覧
化合物一覧（かごうぶついちらん）では、日本語版ウィキペディアに記事が存在する化合物の一覧を掲載する。.
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化学に関する記事の一覧
このページの目的は、化学に関係するすべてのウィキペディアの記事の一覧を作ることです。この話題に興味のある方はサイドバーの「リンク先の更新状況」をクリックすることで、変更を見ることが出来ます。 化学の分野一覧と重複することもあるかもしれませんが、化学分野の項目一覧です。化学で検索して出てきたものです。数字、英字、五十音順に配列してあります。濁音・半濁音は無視し同音がある場合は清音→濁音→半濁音の順、長音は無視、拗音・促音は普通に（ゃ→や、っ→つ）変換です。例：グリニャール反応→くりにやるはんのう †印はその内容を内含する記事へのリダイレクトになっています。 註) Portal:化学#新着記事の一部は、ノート:化学に関する記事の一覧/化学周辺に属する記事に分離されています。.
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チロシンtRNAリガーゼ
チロシンtRNAリガーゼ(Tyrosine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-チロシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-チロシル-tRNATyrの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-チロシン:tRNATyrリガーゼ(AMP生成)(L-tyrosine:tRNATyr ligase (AMP-forming))である。この酵素は、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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ハツタケ
ハツタケ(Lactarius hatsudake Nobuj. Tanaka)は、担子菌門に属し、ベニタケ目 ベニタケ科のチチタケ属に分類されるキノコの一種である。.
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バリンtRNAリガーゼ
バリンtRNAリガーゼ(Valine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-バリンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-バリル-tRNAValの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-バリン:tRNAValリガーゼ(AMP生成)(L-Valine:tRNAVal ligase (AMP-forming))である。バリルtRNAシンターゼ、バリントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、バリン、ロイシン、イソロイシンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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ポリリン酸
ポリリン酸（ポリりんさん、polyphosphoric acid）は、酸素原子を共有して結合した四面体 PO4（リン酸）構造単位からなるポリマーのオキソ酸である。また、その塩やエステルについてもこの記事で説明する。2つの角が共有されたポリリン酸イオンは直鎖構造または環状構造をとることがある。生物学ではポリリン酸エステルであるアデノシン一リン酸、アデノシン二リン酸、およびアデノシン三リン酸 (ATP) がエネルギーの移動に関与する。 さまざまなポリリン酸塩が一般的に1 - 5 mg/Lの濃度で都市用水でのミネラル隔離に利用される。.
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メチオニンtRNAリガーゼ
メチオニンtRNAリガーゼ(Methionine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-メチオニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-メチオニル-tRNAMetの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-メチオニン:tRNAMetリガーゼ(AMP生成)(L-Methionine:tRNAMet ligase (AMP-forming))である。メチオニルtRNAシンターゼ、メチオニントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、メチオニン代謝、セレノアミノ酸代謝及びアミノアシルtRNAの生合成の3つの代謝経路に関与している。.
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メバロン酸経路
メバロン酸経路（メバロンさんけいろ）はテルペノイドやステロイド合成の出発物質であるイソペンテニル二リン酸およびジメチルアリル二リン酸をアセチルCoAから合成する生合成経路である。イソペンテニル二リン酸を合成する生合成経路は他に非メバロン酸経路がある。律速段階はヒドロキシメチルグルタリルCoA (HMG-CoA) がメバロン酸に還元される反応であり、これが名称の由来である。.
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リン酸塩
リン酸塩（リンさんえん、）は、1個のリンと4個の酸素から構成される多原子イオンまたは基から形成される物質である。リン酸イオンは−3価の電荷を持ち、PO43−と書き表される。食品添加物としても使用される。 有機化学においては、リン酸のアルキル誘導体は有機リン酸化合物と呼称される。 リン酸塩は通常、元素のリンを含み、種々のリン酸鉱物（リン鉱）として見出される。一方、単体のリンやホスフィンなど低酸化状態のリン化合物は自然界では見ることができない（稀に隕石中に、ホスフィン類が見出される）。.
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リボースリン酸ジホスホキナーゼ
リボースリン酸ジホスホキナーゼ(ribose-phosphate diphosphokinase)またはホスホリボシルピロリン酸シンターゼ(phosphoribosyl pyrophosphate synthetase, PRPS)は、リボース-5-リン酸をホスホリボシル二リン酸に変換する酵素である。.
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リボヌクレオチド
リボヌクレオチド(Ribonucleotide)またはリボチド(Ribotide)は、ペントース成分としてD-リボースを含むヌクレオチドである。核酸の前駆体であると考えられている。ヌクレオチドは、DNAやRNAを構築する基礎的なブロックである。リボヌクレオチド自体は、RNAの構成単位となるが、リボヌクレオチドレダクターゼによって還元されたデオキシリボヌクレオチドは、DNAの構成単位となる。連続するヌクレオチドの間は、ホスホジエステル結合で連結される。 リボヌクレオチドは、他の細胞機能にも用いられる。例えばAMPは、細胞調整や細胞シグナリングなどに用いられる。さらにリン酸基が2つついたATPは生物のエネルギー通貨となるり、環化した環状AMPはホルモンを調節する。生体で最も一般的なリボヌクレオチドの塩基は、アデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)、ウラシル(U)である。窒素塩基は、プリンとピリミジンの2つの種類に大別される。 リボヌクレオチドの一般的な構造:リン酸基 - D-リボース - 核酸塩基.
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リボフラビン
リボフラビン (Riboflavin) は、ビタミンB2 (Vitamin B2) 、ラクトフラビン（Lactoflavine）とも呼ばれ、ビタミンの中で水溶性ビタミンに分類される生理活性物質で、ヘテロ環状イソアロキサジン環に糖アルコールのリビトールが結合したものである。かつては成長因子 (growth factor) として知られていたことからビタミンGと呼ばれたこともある。.
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リシンtRNAリガーゼ
リシンtRNAリガーゼ(Lysine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-リシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-リシルtRNALysの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-リシン:tRNALysリガーゼ(AMP生成)(L-Lysine:tRNAIle ligase (AMP-forming))である。リシントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、リシンの生合成、アミノアシルtRNAの生合成、及び筋萎縮性側索硬化症の3つの代謝経路に関与している。.
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リシンtRNAPylリガーゼ
リシンtRNAPylリガーゼ(Lysine—tRNA(Pyl) ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-リシンとtRNAPylの3つの基質、AMPと二リン酸とL-リシルtRNAPylの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-リシン:tRNAPylリガーゼ(AMP生成)(L-lysine:tRNAPyl ligase (AMP-forming))である。.
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ロイシンtRNAリガーゼ
イシンtRNAリガーゼ(Leucine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-ロイシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-ロイシルtRNALeuの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-ロイシン:tRNATyrリガーゼ(AMP生成)(L-leucine:tRNATrp ligase (AMP-forming))である。ロイシルtRNAシンセターゼ、ロイシントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、バリン、ロイシン、イソロイシンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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ヌクレオチド
ヌクレオチド (nucleotide) とは、ヌクレオシドにリン酸基が結合した物質である。語源は“nucleo(核の)tide(結ばれた)”と言う意味である。英語では「ニュークリオタイド」と発音する。ヌクレオシドは五単糖の1位にプリン塩基またはピリミジン塩基がグリコシド結合したもの。DNAやRNAを構成する単位でもある。 ヌクレオチドが鎖のように連なりポリヌクレオチドになる。またアデノシン三リン酸はリン酸供与体としても機能し、加えてセカンドメッセンジャーの機能を持つcAMPなども知られる。遺伝暗号のコドンでは、ヌクレオチド3個でアミノ酸一つをコードしている。.
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トリプトファンtRNAリガーゼ
トリプトファンtRNAリガーゼ(Tryptophan—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-トリプトファンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-トリプトフィルtRNATrpの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-トリプトファン:tRNATyrリガーゼ(AMP生成)(L-tryptophan:tRNATrp ligase (AMP-forming))である。この酵素は、トリプトファンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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トレオニンtRNAリガーゼ
トレオニンtRNAリガーゼ(Threonine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-トレオニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-トレオニルtRNAThrの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-トレオニン:tRNAThrリガーゼ(AMP生成)(L-Threonine:tRNAThr ligase (AMP-forming))である。トレオニントランスラーゼ、トレオニルtRNAシンターゼ、TRS等とも呼ばれる。この酵素は、グリシン、セリン、トレオニンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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ブルガキサンチン
ブルガキサンチン(Vulgaxanthin)は、ベタキサンチンの分類であり、赤色のテーブルビートに含まれる優先的な黄色の色素である。他に、オシロイバナやフダンソウにも含まれる。抗酸化物質としての性質を持つ色素で、I、II、III、IV、Vの種類がある。全てのベタキサンチンと同様に、分解されずに酸によりアグリコンに加水分解されることはない。水分活性もこの抗酸化物質の安定性に影響を与えている。天然の栄養補助剤として研究されているが、不安定性が問題となっている。.
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プリン塩基
プリン塩基（プリンえんき、）は、プリン骨格を持った塩基である。つまり、プリン環を基本骨格とする生体物質で核酸あるいはアルカロイドの塩基性物質である。プリン体（プリンたい）とも総称される。 核酸塩基であるアデニン(図1.2)、グアニン(図1.3)などヌクレオシド/ヌクレオチド以外にもNADやFADの成分として、あるいはプリンアルカロイドのカフェイン(図1.7)、テオブロミン(図1.6)などが知られている。.
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プリン代謝
プリン代謝（プリンたいしゃ）とは、生物に含まれているプリン塩基の合成および分解の代謝経路である。.
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プロリンtRNAリガーゼ
プロリンtRNAリガーゼ(Proline—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-プロリンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-プロリルtRNAProの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-プロリン:tRNAProリガーゼ(AMP生成)(L-Proline:tRNAPro ligase (AMP-forming))である。プロリルtRNAシンターゼ、プロリントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アルギニン、プロリンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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プロピオン酸CoAリガーゼ
プロピオン酸CoAリガーゼ(Propionate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとプロピオン酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とプロピオン酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、プロピオン酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、propionyl-CoA synthetase等がある。.
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ヒスチジンtRNAリガーゼ
ヒスチジンtRNAリガーゼ(Histidine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-ヒスチジンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-ヒスチジルtRNAHisの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-ヒスチジン:tRNAHisリガーゼ(AMP生成)(L-Histidine:tRNAHis ligase (AMP-forming))である。ヒスチジルtRNAシンターゼ、ヒスチジントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、ヒスチジンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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ビオチンCoAリガーゼ
ビオチンCoAリガーゼ(Biotin-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとビオチンとCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とビオチンCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、ビオチン:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、biotinyl-CoA synthetase、biotin CoA synthetase、biotinyl coenzyme A synthetase等がある。 この酵素は、ビオチンの代謝に関与している。.
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ビタミン
ビタミン（ヴィタミン、 ）は、生物の生存・生育に微量に必要な栄養素のうち、炭水化物・タンパク質・脂質以外の有機化合物の総称である（なお栄養素のうち無機物はミネラルである）。 生物種によってビタミンとして働く物質は異なる。たとえばアスコルビン酸はヒトにはビタミンCだが、多くの生物にはそうではない。ヒトのビタミンは13種が認められている。 ビタミンは機能で分類され、物質名ではない。たとえばビタミンAはレチナール、レチノールなどからなる。 ビタミンはほとんどの場合、生体内で十分量合成することができないので、主に食料から摂取される（一部は腸内細菌から供給される）。ビタミンが不足すると、疾病や成長障害が起こりうる（ビタミン欠乏症）。日本では厚生労働省が日本人の食事摂取基準によって各ビタミンの指標を定めており、摂取不足の回避を目的とする3種類の指標と、過剰摂取による健康障害の回避を目的とする指標、及び生活習慣病の予防を目的とする指標から構成されている。.
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ビタミンB群
ビタミンB群とは、水溶性ビタミンのうち、ビタミンB1、ビタミンB2、ナイアシン、パントテン酸、ビタミンB6、ビタミンB12、葉酸、ビオチンの8種の総称で、ビタミンB複合体とも呼ばれる。発見当初ラットの発育に必須の単一の水溶性因子として知られていたが、後の研究で複数種の物質からなる混合物であることが突き止められた。ビタミンB群に含まれている8種の物質は、いずれも生体内において、補酵素として機能することが知られている。 ビタミンB群には平たく言えば水に溶けること（水溶性）と、炭水化物をエネルギーに変える手助けをするという2つの共通した働きがある。1910年（明治43年）鈴木梅太郎がオリザニン.
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ピロリン酸塩
化学において、ピロリン酸の陰イオン、塩、エステルはピロホスファート（pyrophosphate）と呼ばれる。2つのリン酸基を含む全ての塩あるいはエステルは二リン酸（diphosphate）と呼ばれる。食品添加物として、二リン酸類はE450として知られている。.
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フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ
フルクトース-1,6-ビスホスファターゼ(Fructose 1,6-bisphosphatase、FBPアーゼ、)は、同化過程の糖新生やカルビン回路でフルクトース-1,6-ビスリン酸をフルクトース-6-リン酸に変換する酵素である。FBPアーゼの触媒する反応は、解糖系におけるホスホフルクトキナーゼの逆反応である。これらの酵素はどちらも一方向しか触媒できず、フルクトース-2,6-ビスリン酸等の代謝産物によって制御されるため、どちらか一方の活性が高くなると、もう一方の活性が低くなる。つまり、フルクトース-2,6-ビスリン酸はFBPアーゼをアロステリック阻害するが、ホスホフルクトキナーゼ-Iを活性化させる。フルクトース-1,6-ビスリン酸は多くの異なる代謝経路に関与し、ほぼ全ての生物で見られる。FBPアーゼは、触媒に金属イオン（Mg2+とMn2+）を必要とし、Li2+に強く阻害される。 ブタのFBPアーゼのフォールディングは、イノシトール-1-ホスファターゼと相同である。イノシトールポリリン酸-1-ホスファターゼ、イノシトール-1-ホスファターゼ、FBPアーゼは、金属イオンに結合し触媒作用に関与していることが示されているAsp-Pro-Ile/Leu-Asp-Gly/Ser-Thr/Serのモチーフ配列を共有している。このモチーフは、菌類、細菌、酵母のイノシトール-1-ホスファターゼでも保存されている。これらのタンパク質は、イノシトールシグナル、糖新生、硫酸塩同化、そして恐らくキノン代謝等の様々な代謝経路に関与する。 3つの異なる種類のFBPアーゼのグループ（FBPアーゼI,II,III）が真核生物及び細菌で同定されている。最近まで古細菌では発見されていなかったが、イノシトールモノホスファターゼの活性も持つ4つめの新しいグループのFBPアーゼ（FBPアーゼIV）が最近になって同定された。 また、好熱性古細菌や超好熱性細菌Aquifex aeolicusでは、新しいグループのFBPアーゼ（FBPアーゼV）が発見された。このグループのFBPアーゼは基質特異性が高く、これらの生物の真のFBPアーゼであることが示唆されている。二次構造の研究により、FBPアーゼVは、通常の糖ホスファターゼが持つα-β-α-β-αの5層のサンドイッチ構造ではなく、新しいフォールディングであるα-β-β-αの4層構造を持っていることが明らかとなった。触媒部位の側鎖と金属リガンドの配列は、他のFBPアーゼの機構として提案されていた3つの金属イオンによる触媒機構と一致することが発見された。 低GC含量のグラム陽性細菌であるフィルミクテス門の持つFBPアーゼは、他の生物の持つFBPアーゼと配列上の類似性がほとんどない。枯草菌の酵素はアデノシン一リン酸で阻害されるが、ホスホエノールピルビン酸によりこの阻害は解除され、またMn2+イオンに依存する。この酵素を欠く変異体は、リンゴ酸やグリセロールのような糖新生成長基質でも生きることができる。.
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フィタン酸CoAリガーゼ
フィタン酸CoAリガーゼ(Phytanate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとフィタン酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とフィタノイルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、フィタン酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、phytanoyl-CoA ligase等がある。.
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フェニルアラニンラセマーゼ (ATP加水分解)
フェニルアラニンラセマーゼ (phenylalanine racemase) 、フェニルアラニンラセマーゼ（ATP加水分解）、グラミシジンSシンターゼI (gramicidin S synthetase I) は、アミノ酸と誘導体に作用する酵素である。フェニルアラニンのL, Dの双方の立体異性体に作用し、L-フェニルアラニルアデニル酸とD-フェニルアラニルアデニル酸を生成する。結合した化合物は酵素のチオールに転移、続けて立体配置が変換される。2種の異性体のうちD体の方が7:3の比率で有利である。フェニルアラニンのラセミ化はアデノシン三リン酸からアデニル酸と二リン酸への非常に有利な加水分解により熱力学的に進行する。二リン酸は無機リン酸へ速やかに加水分解されるためルシャトリエの原理により反応が進められる。フェニルアラニン代謝経路の酵素の一つであり、補因子としてピリドキサールリン酸を必要とする。.
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フェニルアラニンtRNAリガーゼ
フェニルアラニンtRNAリガーゼ(Phenylalanine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-フェニルアラニンとtRNAPheの3つの基質、AMPと二リン酸とL-フェニルアラニルtRNAPheの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-フェニルアラニン:tRNAPheリガーゼ(AMP生成)(L-phenylalanine:tRNAPhe ligase (AMP-forming))である。フェニルアラニルtRNAシンターゼ、フェニルアラニントランスラーゼ、PheRS等とも呼ばれる。この酵素は、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。 フェニルアラニンtRNAリガーゼは、アミノアシルtRNA合成酵素の中で最も複雑な酵素であることが知られている。細菌及びミトコンドリアのフェニルアラニンtRNAリガーゼは、挿入のないα+βモチーフを持つフェレドキシンフォールドのアンチコドン結合(FDX-ACB)ドメインを共有している。FDX-ACBドメインは、2つのαヘリックスを含む4鎖の逆平行βシートから構成される典型的なRNA認識フォールド(RRM)を示す。.
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フェニル酢酸CoAリガーゼ
フェニル酢酸CoAリガーゼ(Phenylacetate—CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとフェニル酢酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とフェニル酢酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に炭素-硫黄結合を形成する酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、フェニル酢酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、phenylacetyl-CoA ligase、PA-CoA ligase、phenylacetyl-CoA ligase (AMP-forming)等がある。この酵素は、チロシン代謝及びフェニルアラニン代謝に関与している。.
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ホスホリボシル二リン酸
ホスホリボシル二リン酸（ホスホリボシルにりんさん、Phosphoribosyl diphosphate）は糖リン酸の一つ。リボース-5-リン酸からリボースリン酸ジホスホキナーゼによって作られる。.
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呼吸
生物における呼吸（こきゅう）は、以下の二種類に分けられる。.
アミノアシルtRNA合成酵素
アミノアシルtRNA合成酵素 (aminoacyl-tRNA synthetase) とは、特定のアミノ酸 (またはその前駆体) その対応するtRNAにエステル結合させてアミノアシルtRNAを合成する酵素である。英語の略号としてaaRSやARSが用いられる。 アミノアシルtRNAは、リボソームに運ばれてtRNA部分の3塩基からなるアンチコドンが、mRNAのコーディング領域のコドンと対合し、タンパク質合成に用いられる。従って、3塩基のコドンと1アミノ酸の対応づけが行われる場はリボソームであっても、実際にコドンとアミノ酸の対応関係を示す遺伝暗号はaaRSの特異性にもとづいて規定されていることになる。 通常の生物では翻訳に使用されるアミノ酸20種類に対し、それぞれ対応するaaRSをもっている。例えば、アルギニンを認識してアルギニンtRNAにエステル結合する反応を触媒するaaRSはアルギニルtRNA合成酵素 (arginyl-tRNA synthetase) のように表記される。略号はArgRSのようにアミノ酸3文字表記+RSで表される。.
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アミドホスホリボシルトランスフェラーゼ
アミドホスホリボシルトランスフェラーゼ(amidophosphoribosyltransferase)またはグルタミンホスホリボシルピロリン酸アミドトランスフェラーゼ(glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase, GPAT)は、グルタミンの側鎖末端のアミノ基を用いてホスホリボシル二リン酸(PRPP)をホスホリボシルアミン(PRA)に変換する酵素である。プリン塩基のde novo合成経路の初発段階を担う。.
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アミガサタケ
アミガサタケ（Morchella esculenta (L.) Pers.
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アラニンtRNAリガーゼ
アラニンtRNAリガーゼ(Alanine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アラニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アラニル-tRNAAlaの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アラニン:tRNAAlaリガーゼ(AMP生成)(L-Alanine:tRNAAla ligase (AMP-forming))である。アラニルtRNAシンターゼ、アラニントランスラーゼ、AlaRS等とも呼ばれる。この酵素は、アラニン、アスパラギン酸の生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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アラキドン酸CoAリガーゼ
アラキドン酸CoAリガーゼ(Arachidonate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとアラキドン酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とアラキドン酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、アラキドン酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、arachidonoyl-CoA synthetase等がある。.
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アリールアルデヒドデヒドロゲナーゼ (NADP+)
アリールアルデヒドデヒドロゲナーゼ (NADP+)（aryl-aldehyde dehydrogenase (NADP+)）は、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 反応式の通り、この酵素の基質は芳香族アルデヒドとNADP+とAMPと二リン酸、生成物は芳香族カルボン酸とNADPHとH+とATPである。 組織名はaryl-aldehyde:NADP+ oxidoreductase (ATP-forming)で、別名にaromatic acid reductaseがある。.
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アルギニンtRNAリガーゼ
アルギニンtRNAリガーゼ(Arginine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アルギニンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アルギニルtRNAArgの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アルギニン:tRNAArgリガーゼ(AMP生成)(L-Arginine:tRNAHis ligase (AMP-forming))である。アルギニルtRNAシンターゼ、アルギニントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アルギニン、プロリンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。N末端に、アルギニル tRNAシンテターゼN末端ドメインまたはアディショナルドメイン1(Add-1)と呼ばれる保存ドメインを持つ。このドメインは約140残基の長さで、tRNA認識に関わっていると考えられている。.
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アデノシン-3',5'-ビスリン酸
アデノシン-3',5'-ビスリン酸（Adenosine 3',5'-bisphosphate）は、リボース環の異なる炭素に2つのリン酸が結合したアデノシンヌクレオチドである。リボースの5'炭素に二リン酸が結合したアデノシン二リン酸とは異なるヌクレオチドである。 アデノシン-3',5'-ビスリン酸は、補酵素の3'-ホスホアデノシン-5'-ホスホ硫酸からの硫酸基の供与によるスルホトランスフェラーゼの酵素反応生成物として生じる。 この生成物は、3'(2'),5'-ビスリン酸ヌクレオチダーゼによって加水分解され、アデノシン一リン酸（AMP）を与える。生じたAMPはアデノシン三リン酸（ATP）にリサイクルされる。.
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アデノシン三リン酸
アデノシン三リン酸（アデノシンさんリンさん、adenosine triphosphate）とは、アデノシンのリボース（＝糖）に3分子のリン酸が付き、2個の高エネルギーリン酸結合を持つヌクレオチドのこと。IUPAC名としては「アデノシン 5'-三リン酸」。一般的には、「adenosine triphosphate」の下線部のアルファベットをとり、短縮形で「ATP（エー・ティー・ピー）」と呼ばれている。.
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アデノシン二リン酸
アデノシン二リン酸（アデノシンにリンさん、Adenosine diphosphate, ADP と略）は、アデニン、リボース、および二つのリン酸分子からなる化学物質。リン酸は高エネルギーリン酸結合をとっており、ATP から ADP とリン酸基に分かれる際に放出されるエネルギーは生体内での主要なエネルギー源となっている。詳細は ATP の項目を参照のこと。 アデニル酸（AMP）とATPからアデニル酸キナーゼによって生成される。 ATPアーゼ（ATPase）によりATPが加水分解される場合にも生成される。 ADPは上記の化学反応のようにATPの分解やAMPのリン酸化によって生ずる。.
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アデニリル-硫酸レダクターゼ (チオレドキシン)
アデニリル-硫酸レダクターゼ (チオレドキシン)（adenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)）は、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 反応式の通り、この酵素の基質はAMPと亜硫酸とチオレドキシンジスルフィド、生成物は5'-アデニリル硫酸とチオレドキシンである。 組織名はAMP,sulfite:thioredoxin-disulfide oxidoreductase (adenosine-5'-phosphosulfate-forming)で、別名にthioredoxin-dependent 5'-adenylylsulfate reductaseがある。.
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アデニリル-硫酸レダクターゼ (グルタチオン)
アデニリル-硫酸レダクターゼ (グルタチオン)（Adenylyl-sulfate reductase (glutathione)）は、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 反応式の通り、この酵素の基質はAMPと亜硫酸とグルタチオンジスルフィド、生成物はアデニリル硫酸とグルタチオンである。 組織名はAMP,sulfite:glutathione-disulfide oxidoreductase (adenosine-5'-phosphosulfate-forming)で、別名にadenylyl-sulfate reductase (glutathione)、5'-adenylylsulfate reductase (also used for EC 1.8.99.2)、AMP,sulfite:oxidized-glutathione oxidoreductase (adenosine-5'-phosphosulfate-forming)、plant-type 5'-adenylylsulfate reductaseがある。.
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アデニリル硫酸レダクターゼ
アデニリル硫酸レダクターゼ（adenylyl-sulfate reductase）は、セレノアミノ酸、硫黄代謝酵素の一つで、次の化学反応を触媒する酸化還元酵素である。 反応式の通り、この酵素の基質はAMPと亜硫酸と受容体、生成物はアデニリル硫酸と還元型受容体である。 組織名はAMP,sulfite:acceptor oxidoreductase (adenosine-5'-phosphosulfate-forming)で、別名にadenosine phosphosulfate reductase、adenosine 5'-phosphosulfate reductase、APS-reductase、APS reductase、AMP, sulfite:(acceptor) oxidoreductase (adenosine-5'-phosphosulfate-forming)がある。.
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アデニル酸ジメチルアリルトランスフェラーゼ
アデニル酸ジメチルアリルトランスフェラーゼ(adenylate dimethylallyltransferase)は植物ホルモンの1つサイトカイニンの合成に関わる転移酵素で、次の化学反応を触媒する酵素である。 系統名はdimethylallyl-diphosphate:AMP dimethylallyltransferaseである。.
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アデニロコハク酸リアーゼ
アデニロコハク酸リアーゼ(adenylosuccinate lyase, ADSL)はプリン代謝のうちイノシン酸およびアデニル酸の合成に関わる酵素で、以下の2つの化学反応を触媒する。.
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アデニロコハク酸シンターゼ
アデニロコハク酸シンターゼ(adenylosuccinate synthase, ADSS)またはIMP-アスパラギン酸リガーゼ(IMP-aspartate ligase)はプリン代謝のうちアデニル酸の合成に関わる酵素で、以下の化学反応を触媒する。.
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アデニン
アデニン (adenine) は核酸を構成する5種類の主な塩基のうちのひとつで、生体内に広く分布する有機化合物である。 プリン骨格は糖ともアミノ酸とも異なる独特の形状をしているにもかかわらず、アデニン、グアニンの他、コーヒーや茶に含まれるカフェイン、ココアに含まれるテオブロミン、緑茶に含まれるテオフィリンなどを構成し、また最近ではプリン体をカットしたビールなども販売されるほどありふれた有機物である。アデニンはシアン化水素とアンモニアを混合して加熱するだけで合成されるため、原始の地球でもありふれた有機物であったと考えられる。.
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アディポネクチン
アディポネクチンは、脂肪細胞から分泌される分泌蛋白である。血中濃度は一般的なホルモンに比べて桁違いに多く、μg/mlオーダーに達する。作用としては、インスリン受容体を介さない糖取り込み促進作用、脂肪酸の燃焼、細胞内の脂肪酸を減少してインスリン受容体の感受性を上げる作用、肝臓のAMPキナーゼを活性化させることによるインスリン感受性の亢進、動脈硬化抑制、抗炎症、心筋肥大抑制など、多彩である。受容体にはAdipoR1、AdipoR2、T-Cadherinなどが報告されている。AdipoR1とAdipoR2の同定論文については研究不正があるという告発が2016年になされたが 告発文１_5cvq.pdf Ordinary_researchers 2016年8月14日 2016年12月7日閲覧 Science 2016年9月23日 2016年12月7日閲覧 選択 2016年10月号 2017年9月13日閲覧、掲載誌にすでに修正公告 Nature, 431, 1123 (28 October 2004)を出しているという理由によって調査対象から外された Yahoo news 詫摩雅子 2017年8月14日 2017年8月17日閲覧 日本テレビ 2017年8月1日 18:28 2017年9月13日閲覧 東京大学 2018年3月17日閲覧。AdipoR1とAdipoR2の同定論文の責任著者である門脇孝は、2016年に出版した自伝において、AdipoR1やAdipoR2は部下の山内敏正が清水孝雄の研究室に出入りして同定してきたものであり、最初は門脇自身がアディポネクチンの受容体であることが信じられなかったが、今はT-Cadherinより正当な受容体と考えられると主張している。 血中アディポネクチン濃度は内臓脂肪量に逆相関する。そのメカニズムは不明な点が多いが、一部は肥満脂肪組織で増加するTNF-αなどによるものと考えられている。低炭水化物食でアディポネクチンが増加するという報告がある。 骨格筋においてアディポネクチンは受容体に結合し、AMPキナーゼを活性化して、通常はインスリンにしか反応しないインスリン感受性のグルコーストランスポーターであるGLUT4を膜の表面へ移動させ、グルコースを取り込む作用がある。運動の結果によりアデノシン一リン酸（AMP、アデニル酸）が増加することが知られているが、このAMPがAMPキナーゼを活性化する経路と同じである。つまり、アディポネクチンは、インスリンの作用を介さずに、運動効果とほとんど類似のグルコースを取り込む作用を示すことになる鎌田勝雄（星薬科大学オープン・リサーチ）。.
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アシルCoA
アシルCoA（Acyl-CoA、アシルコエー、アシルコエンザイムエー）は、脂肪酸の代謝に関わる補酵素である。補酵素Aが細胞内で長鎖脂肪酸のカルボキシル基側の末端に結合することにより一時的に生じる。この後、補酵素Aは長鎖脂肪酸から2個の炭素を外して脂肪酸から脱離してアセチルCoAとなり、クエン酸回路に取り込まれアデノシン三リン酸の生合成に使われる。.
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アスパラギンシンテターゼ
アスパラギンシンテターゼ (asparagine synthetase、アスパラギン合成酵素) はL-アスパラギン酸とアンモニアからL-アスパラギンを生合成する酵素。アスパラギン酸‐アンモニアリガーゼ (aspartate-ammonia ligase) とも呼ばれる。 アデノシン三リン酸を1分子消費し、アデノシン一リン酸とピロリン酸を生成する反応を可逆的に触媒する。 この酵素は古細菌、真正細菌、真核生物に広く存在している。ヒトの培養細胞を用いた研究ではアミノ酸が欠乏すると転写量が上がることが知られている。.
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アスパラギン酸tRNAAsnリガーゼ
アスパラギン酸tRNAAsnリガーゼ(Aspartate—tRNA(Asn) ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アスパラギン酸とtRNAAsxの3つの基質、AMPと二リン酸とアスパルチルtRNAAsxの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アスパラギン酸:tRNAAsxリガーゼ(AMP生成)(L-Aspartate:tRNAAsx ligase (AMP-forming))である。nondiscriminating aspartyl-tRNA synthetase等とも呼ばれる。この酵素は、アラニンとアスパラギン酸の代謝に関与している。.
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アスパラギン酸tRNAリガーゼ
アスパラギン酸tRNAリガーゼ(Aspartate—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アスパラギン酸とRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アスパルチルtRNAAspの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アスパラギン酸:tRNAAspリガーゼ(AMP生成)(L-Aspartate:tRNAAsp ligase (AMP-forming))である。アスパルチルtRNAシンターゼ、アスパラギン酸トランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アラニンとアスパラギン酸の代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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アスパラギンtRNAリガーゼ
アスパラギンtRNAリガーゼ(Asparagine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-アスパラギンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-アスパラギニルtRNAAsnの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-アスパラギン:tRNAAsnリガーゼ(AMP生成)(L-Asparagine:tRNAAsn ligase (AMP-forming))である。アスパラギニルtRNAシンターゼ、アスパラギントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、アラニンとアスパラギン酸の代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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アセトンカルボキシラーゼ
アセトンカルボキシラーゼ(Aceton carboxylase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の基質は、アセトンと二酸化炭素とATPと水の4つ、生成物はアセト酢酸とAMPとリン酸の3つである。 この酵素はリガーゼ、特に炭素-炭素結合を形成するものに分類される。系統名は、アセトン:炭素-二酸素 リガーゼ (AMP形成)(acetone:carbon-dioxide ligase (AMP-forming))である。.
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アセト酢酸CoAリガーゼ
アセト酢酸CoAリガーゼ(Acetoacetate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとアセト酢酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とアセト酢酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、アセト酢酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、acetoacetyl-CoA synthetase等がある。 この酵素は、酪酸の代謝に関与している。.
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イノシン酸
イノシン酸（イノシンさん、inosinic acid）は、ヌクレオチド構造を持つ有機化合物の一種である。ヒポキサンチン（6-ヒドロキシプリン）と D-リボースとリン酸各1分子ずつで構成されたリボヌクレオチドで、イノシン 5'-リン酸、イノシン 5'-モノリン酸、イノシン一リン酸などとも呼ばれ、IMP と略記される。主に肉類の中に存在する天然化合物である。 呈味性ヌクレオチドの1つであり、日本では鰹節に含まれるうま味成分のひとつとして語られることが多い。 致死量はLD50.
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イソロイシンtRNAリガーゼ
イソロイシンtRNAリガーゼ(Isoleucine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-イソロイシンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-イソロイシルtRNAIleの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-イソロイシン:tRNAIleリガーゼ(AMP生成)(L-isoleucine:tRNAIle ligase (AMP-forming))である。イソロイシントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、バリン、ロイシン、イソロイシンの生合成及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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オキソアニオン
アニオン (oxoanion) またはオキシアニオン (oxyanion) は化学式 AxOyz-（Aはある元素を指し、Oは酸素原子を指す）で表される化合物である。多くの元素がオキソアニオンを作ることができる。単純なオキソアニオンの構造式はオクテット則により予想できる。縮合されたオキソアニオンの構造は AOn として、互いに辺や頂点を共有している多面体を単位にしてまとめられる。リン酸またはポリリン酸エステルである AMP、ADP、ATP は生物学において重要である。.
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カルノシン合成酵素
ルノシン合成酵素(Carnosine synthase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとL-ヒスチジンとβ-アラニン、3つの生成物はAMPと二リン酸とカルノシンである。 この酵素はリガーゼ、特に炭素-窒素結合を形成する酸-D-アミノ酸リガーゼ（ペプチドシンターゼ）に分類される。系統名は、L-ヒスチジン:β-アラニン リガーゼ(AMP生成)である。この他によく用いられる名前として、carnosine synthetase、carnosine-anserine synthetase、homocarnosine-carnosine synthetase、carnosine-homocarnosine synthetase等がある。 この酵素は、尿素回路、アラニン及びアスパラギン酸の代謝、ヒスチジンの代謝、β-アラニンの代謝の4つの代謝経路に関与している。.
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グリシンtRNAリガーゼ
リシンtRNAリガーゼ(Glycine—tRNA ligase、)は、酵素である。ヒトでは、GARS遺伝子によってコードされる。この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はグリシン:tRNAGlyリガーゼ(AMP生成)(Glycine:tRNAGly ligase (AMP-forming))である。グリシルtRNAシンテターゼ(Glycyl-tRNA synthetase)、グリシルトランスラーゼ(Glycyl translase)等とも呼ばれる。.
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グルコーストランスポーター
ルコーストランスポーターまたはグルコース輸送体ないし糖輸送体（英語：glucose transporter、GLUTあるいはSLC2Aと略記）は、大部分の哺乳類の細胞に見出される一連の膜タンパクファミリーである。.
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グルタミン酸tRNAリガーゼ
ルタミン酸tRNAリガーゼ(Glutamate—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-グルタミン酸とRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-グルタミルtRNAGlnの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-グルタミン酸:tRNAGlnリガーゼ(AMP生成)(L-Glutamate:tRNAGlu ligase (AMP-forming))である。グルタミルtRNAシンターゼ、グルタミン酸トランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、グルタミン酸の代謝、ポルフィリンやクロロフィルの代謝、及びアミノアシルtRNAの生合成の3つの代謝経路に関与している。.
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グルタミン酸tRNAGlnリガーゼ
ルタミン酸tRNAGlnリガーゼ(Glutamate—tRNA(Gln) ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-グルタミン酸とtRNAGlxの3つの基質、AMPと二リン酸とグルタミルtRNAGlxの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-グルタミン酸:tRNAGlxリガーゼ(AMP生成)(L-Glutamate:tRNAGlx ligase (AMP-forming))である。グルタミルtRNAシンテターゼ等とも呼ばれる。この酵素は、グルタミン酸の代謝に関与している。.
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グルタミンtRNAリガーゼ
ルタミンtRNAリガーゼ(Glutamine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-グルタミンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-グルタミニルtRNAGlnの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-グルタミン:tRNAGlnリガーゼ(AMP生成)(L-Glutamine:tRNAGln ligase (AMP-forming))である。グルタミニルtRNAシンターゼ、グルタミントランスラーゼ、GlnRS等とも呼ばれる。この酵素は、グルタミン酸の代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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シトルリン
トルリン（Citrulline）とはアミノ酸の一種で、尿素回路を構成する化合物のひとつである。1930年に日本でスイカの中から発見され、そのラテン語citrullusに因んで名づけられた。動物、特に哺乳類で広く存在する。化学式はC6H13N3O3、IUPAC命名法では2-アミノ-5-（カルバモイルアミノ）ペンタン酸であり分子量は175.2g/mol。CAS登録番号はである。 ミトコンドリアでオルニチントランスカルバモイラーゼによって触媒される、オルニチンとカルバモイルリン酸の反応でリン酸と共に生成する。またサイトソルでアスパラギン酸、ATPと反応しオルニチンとAMP、ピロリン酸となる。この反応はアルギニノコハク酸シンテターゼによって触媒されるがこの酵素が欠けていると血中にシトルリンが蓄積し、また尿中に排出されるようになってシトルリン血症（シトルリン尿症）を発症する。 シトルリンはコドンで指定されているアミノ酸ではないため、遺伝子転写には用いられない。転写直後はタンパク質に含まれないが、タンパク質中のアルギニン残基がペプチジルアルギニンデイミナーゼによってシトルリンに変えられる。また関節リウマチ患者の80%はシトルリンを含むフィラグリンに免疫反応を示すため、抗環状シトルリン化ペプチド抗体が診断に用いられている。.
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システインtRNAリガーゼ
テインtRNAリガーゼ(Cysteine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-システインとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-システイニルtRNACysの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-システイン:tRNACysリガーゼ(AMP生成)(L-Cysteine:tRNACys ligase (AMP-forming))である。システイニルtRNAシンターゼ、システイントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、システインの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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ジカルボン酸CoAリガーゼ
ルボン酸CoAリガーゼ(Dicarboxylate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとαω-ジカルボン酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とω-カルボキシアシルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、ω-ジカルボン酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、carboxylyl-CoA synthetase、dicarboxylyl-CoA synthetase等がある。.
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セリンtRNAリガーゼ
リンtRNAリガーゼ(Serine—tRNA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素は、ATPとL-セリンとRNAの3つの基質、AMPと二リン酸とL-セリル-tRNASerの3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はL-セリン:tRNASerリガーゼ(AMP生成)(L-Serine:tRNASer ligase (AMP-forming))である。セリルtRNAシンターゼ、セリントランスラーゼ等とも呼ばれる。この酵素は、グリシン、セリン、トレオニンの代謝及びアミノアシルtRNAの生合成に関与している。.
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サルベージ経路
ルベージ経路（サルベージけいろ、salvage pathway）は、ヌクレオチド（プリンとピリミジン）の分解経路の中間体から再びヌクレオチドを合成する経路である。 サルベージ経路はRNAとDNAの生分解で生成した核酸塩基とヌクレオチドの再生で使われる。脳や赤血球などのいくつかの組織はヌクレオシドの de novo の生合成能が低い、または持たないため、これは重要な経路である。.
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サイトカイニン
イトカイニン (cytokinin) は植物ホルモンの一種。一般に オーキシン存在下で細胞分裂、シュート形成の誘導効果をもつ化合物一群の総称とされる。略称 CK。.
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B8
B8.
C4型光合成
C4型光合成（C4がたこうごうせい）とは、光合成の過程で一般のCO2還元回路であるカルビン・ベンソン回路の他にCO2濃縮のためのC4経路を持つ光合成の一形態である。C4経路の名はCO2固定において、初期産物であるオキサロ酢酸がC4化合物であることに由来する（当初は炭素数4のリンゴ酸が初期産物だと思われていたが、後に誤りであることがわかった）。C4型光合成を行なう植物をC4植物と言い、維管束鞘細胞にも発達した葉緑体が存在するのが特徴である。これに対してカルビン・ベンソン回路しか持たない植物をC3植物という。 1950年代および1960年代初頭に、ヒューゴ・P・コーチャックおよびユーリ・カルピロフによって、一部の植物が立証されているC3型炭素固定を使わずに最初の段階でリンゴ酸およびアスパラギン酸を生産していることが示された。C4経路は最終的にオーストラリアのマーシャル・デビッドソン・ハッチとC・R・スラックによって1966年によって詳細に解明された。このため、C4経路はハッチ＝スラック回路と呼ばれることもある。.
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睡眠
る子供 眠る家猫 睡眠（すいみん、somnus、sommeil、sleep）は、眠ること、すなわち、周期的に繰り返す、意識を喪失する生理的な状態のことであるデジタル大辞泉。ねむりとも言う。体の動きが止まり、外的刺激に対する反応が低下して意識も失われているが、簡単に目覚める状態のことをこう呼んでいる。ヒトは通常は昼間に活動し、夜間に睡眠をとる。動物では夜間に活動し、昼間に睡眠をとるものも多いブリタニカ百科事典「睡眠」。 ヒトの睡眠中は、急速眼球運動（レム, REM）が生じ、ノンレム睡眠であるステージIからステージIVの4段階と、レム睡眠を、周期90～110分で反復する。睡眠は、心身の休息、身体の細胞レベルでの修復、また記憶の再構成など高次脳機能にも深く関わっているとされる。下垂体前葉は、睡眠中に2時間から3時間の間隔で成長ホルモンを分泌する。放出間隔は睡眠によって変化しないが、放出量は多くなる。したがって、子供の成長や創傷治癒、肌の新陳代謝は睡眠時に特に促進される。また、睡眠不足は身体にとってストレスである。 2018年6月13日、筑波大学の柳沢正史教授らのチームの研究により、マウスの実験で脳内の80種類のタンパク質の働きが活性化することで眠気が誘発されることが発見されたとネイチャー電子版に発表された。同チームはタンパク質が睡眠を促すことで神経を休息させ、機能の回復につながるという見方を示し、睡眠障害の治療法開発につながる可能性を指摘した。.
糖尿病の治療
糖尿病の治療では糖尿病患者における血糖の調節を行う治療行為について述べる。 血糖コントロールの目標は糖尿病性昏睡や低血糖を起こすことなく、糖尿病慢性期合併症を予防することである。.
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生物学に関する記事の一覧
---- 生物学に関する記事の一覧は、生物学と関係のある記事のリストである。ただし生物学者は生物学者の一覧で扱う。また生物の名前は生物学の研究材料としてある程度有名なもののみ加える。 このリストは必ずしも完全ではなく、本来ここにあるべきなのに載せられていないものや、ふさわしくないのに載せられているものがあれば、適時変更してほしい。また、Portal:生物学の新着項目で取り上げたものはいずれこのリストに追加される。 「⇒」はリダイレクトを、(aimai) は曖昧さ回避のページを示す。並べ方は例えば「バージェス動物群」なら「はしえすとうふつくん」となっている。 リンク先の更新を参照することで、このページからリンクしている記事に加えられた最近の変更を見ることが出来る。Portal:生物学、:Category:生物学も参照のこと。.
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略称・略号の一覧 (化合物名)
化合物名の略称・略号のアルファベット順リストを掲げる。 IUPAC名を示すことが目的とする。略称に続きIUPAC名を提示する（但し、社会通念上構造式の公開が不適当な略号は"!"で示し、IUPAC名を表さない）。尚、複数のIUPAC名が流通しているものはカンマで併記した。IUPAC名が複雑でNow printing状態のものは当面は"?"でご勘弁。同じ行で慣用名等は括弧を付して示す。略号、IUPAC名の日本語読みは付けないのでLink先を参照のこと。.
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D-アラニン-ポリ(ホスホリビトール)リガーゼ
D-アラニン-ポリ(ホスホリビトール)リガーゼ(D-alanine—poly(phosphoribitol) ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 ポリ(リビトールリン酸) 従って、この酵素は、ATPとD-アラニンとポリ(リビトールリン酸)の3つの基質、AMPと二リン酸とO-D-アラニル- ポリ(リビトールリン酸)の3つの生成物を持つ。 この酵素はリガーゼに分類され、特にアミノアシルtRNAと関連化合物に炭素-酸素結合を形成する。系統名はD-アラニン:ポリ(ホスホリビトール)リガーゼ(AMP生成)(D-alanine:poly(phosphoribitol) ligase (AMP-forming))である。D-アラニル-ポリ(ホスホリビトール)シンテターゼ、D-アラニン:膜受容体リガーゼ、D-アラニン活性化酵素等とも呼ばれる。この酵素は、D-アラニンの代謝に関与している。.
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酢酸
酢酸（さくさん、醋酸、acetic acid）は、化学式は示性式 CH3COOH、分子式 C2H4O2と表される簡単なカルボン酸の一種である。IUPAC命名法では酢酸は許容慣用名であり、系統名はエタン酸 (ethanoic acid) である。純粋なものは冬に凍結することから氷酢酸（ひょうさくさん）と呼ばれる。2分子の酢酸が脱水縮合すると別の化合物の無水酢酸となる。 食酢（ヴィネガー）に含まれる弱酸で、強い酸味と刺激臭を持つ。遊離酸・塩・エステルの形で植物界に広く分布する。酸敗したミルク・チーズのなかにも存在する。 試薬や工業品として重要であり、合成樹脂のアセチルセルロースや接着剤のポリ酢酸ビニルなどの製造に使われる。全世界での消費量は年間およそ6.5メガトンである。このうち1.5メガトンが再利用されており、残りは石油化学原料から製造される。生物資源からの製造も研究されているが、大規模なものには至っていない。.
GMPシンターゼ
GMPシンターゼ(GMP synthase, GMPS)はGMPの合成に関わる酵素である。以下の2つの化学反応を触媒する。.
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MRNA前駆体
mRNA前駆体（エムアールエヌエーぜんくたい）は、スプライシングなどのさまざまな加工を受けて成熟した mRNA になる前の RNA 分子。 一般に真核生物では、タンパク質をコードする遺伝子の多くがイントロンを持つ。これらの遺伝子は細胞核内でRNAに転写され一次転写産物となる。これはヘテロ核 RNA (hnRNA) とも呼ばれる。その後5' 末端へメチル化されたグアノシンが付加する5'キャップ、RNAスプライシングによるイントロンの除去、3' 末端に多数が数珠状に連なったアデニル酸が付加するポリA尾部といった装飾を経て、成熟mRNAとなる。このようにして出来た mRNA は核外に輸送され翻訳される。 一方で酵母や植物のミトコンドリア、葉緑体のゲノムにも、タンパク質をコードする遺伝子に自己スプライシングイントロンを持つ物があり、これらの一次転写産物も mRNA 前駆体の一種である。 Category:リボ核酸.
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NAD+合成酵素
NAD+合成酵素(NAD+ synthase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の基質はATPとデアミドNAD+とアンモニアの3つ、生成物はアデニル酸と二リン酸とNAD+の3つである。 この酵素はリガーゼ、特に酸-D-アンモニア（またはアミン）リガーゼ（アミドシンターゼ）に分類される。系統名は、デアミドNAD+:アンモニア リガーゼ (AMP形成)(deamido-NAD+:ammonia ligase (AMP-forming))である。この酵素は、ニコチン酸及びニコチンアミドの代謝、また窒素循環に関与している。.
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NAD+シンターゼ
NAD+シンターゼ(NAD+ synthase)は、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、基質はATP、デアミドNAD+、アンモニアの3つ、生成物はAMP、二リン酸、NAD+の3つである。 この酵素はリガーゼ、特に炭素-窒素結合を形成する酸-D-アンモニアリガーゼ（アミドシンターゼ）に分類される。系統名は、デアミドNAD+:アンモニアリガーゼ (AMP生成)(deamido-NAD+:ammonia ligase (AMP-forming))である。この酵素は、ニコチン酸及びニコチンアミド代謝や窒素循環に関わっている。.
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O-スクシニル安息香酸CoAリガーゼ
o-スクシニル安息香酸CoAリガーゼ(o-succinylbenzoate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPとo-スクシニル安息香酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸とo-スクシニルベンゾイルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、2-スクシニル安息香酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、2-succinylbenzoyl-coenzyme A synthetase、2-succinylbenzoate:CoA ligase (AMP-forming)等がある。 この酵素は、ユビキノンの生合成に関与している。.
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RNAリガーゼ
RNAリガーゼ(RNA ligase)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の基質は、ATPと(リボヌクレオチド)nと(リボヌクレオチド)mの3つ、生成物はAMPと二リン酸と(リボヌクレオチド)n+mの3つである。 この酵素はリガーゼ、特にリン酸エステル結合を形成するものに分類される。系統名は、ポリ(リボヌクレオチド):ポリ(リボヌクレオチド) リガーゼ (ADP形成)(poly(ribonucleotide):poly(ribonucleotide) ligase (AMP-forming))である。ポリリボヌクレオチドシンターゼ(polyribonucleotide synthase)、ポリリボヌクレオチドリガーゼ(polyribonucleotide ligase)等とも呼ばれる。.
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核酸
RNAとDNA、それぞれの核酸塩基 核酸（かくさん）は、リボ核酸 (RNA)とデオキシリボ核酸 (DNA)の総称で、塩基と糖、リン酸からなるヌクレオチドがホスホジエステル結合で連なった生体高分子である。糖の部分がリボースであるものがRNA、リボースの2'位の水酸基が水素基に置換された2-デオキシリボースであるものがDNAである。RNAは2'位が水酸基であるため、加水分解を受けることにより、DNAよりも反応性が高く、熱力学的に不安定である。糖の 1'位には塩基（核酸塩基）が結合している。さらに糖の 3'位と隣の糖の 5'位はリン酸エステル構造で結合しており、その結合が繰り返されて長い鎖状になる。転写や翻訳は 5'位から 3'位への方向へ進む。 なお、糖鎖の両端のうち、5'にリン酸が結合して切れている側のほうを 5'末端、反対側を 3'末端と呼んで区別する。また、隣り合う核酸上の領域の、5'側を上流、3'側を下流という。.
2-フロ酸CoAリガーゼ
2-フロ酸CoAリガーゼ(2-furoate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと2-フロ酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸と2-フロイルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、2-フロ酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、2-furoyl coenzyme A synthetase等がある。.
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3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン酸CoAリガーゼ
3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン酸CoAリガーゼ(3-alpha,7-alpha-dihydroxy-5-beta-cholestanate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと(25R)-3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸と(25R)-4-3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、3α,7α-ジヒドロキシ-5β-コレスタン-26-酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestanoyl coenzyme A synthetase、DHCA-CoA ligase、3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestanate:CoA ligase (AMP-forming)等がある。 この酵素は、胆汁酸の生合成に関与している。.
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4-ヒドロキシ安息香酸CoAリガーゼ
4-ヒドロキシ安息香酸CoAリガーゼ(4-hydroxybenzoate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと4-ヒドロキシ安息香酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸と4-ヒドロキシベンゾイルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、4-ヒドロキシ安息香酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、4-hydroxybenzoate-CoA synthetase、4-hydroxybenzoate-coenzyme A ligase (AMP-forming)、4-hydroxybenzoyl coenzyme A synthetase、4-hydroxybenzoyl-CoA ligase等がある。 この酵素は、安息香酸の分解に関与している。.
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4-クマル酸CoAリガーゼ
4-クマル酸CoAリガーゼ(4-Coumarate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと4-クマル酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸と4-クマル酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、4-クマル酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、4-coumaroyl-CoA synthetase、p-coumaroyl CoA ligase、p-coumaryl coenzyme A synthetase、p-coumaryl-CoA synthetase、p-coumaryl-CoA ligase、feruloyl CoA ligase、hydroxycinnamoyl CoA synthetase、4-coumarate:coenzyme A ligase、caffeolyl coenzyme A synthetase、p-hydroxycinnamoyl coenzyme A synthetase、feruloyl coenzyme A synthetase、sinapoyl coenzyme A synthetase、4-coumaryl-CoA synthetase、hydroxycinnamate:CoA ligase、p-coumaryl-CoA ligase、p-hydroxycinnamic acid:CoA ligase、4CL等がある。 この酵素は、フェニルプロパノイドの生合成に関与している。.
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4-クマロイルCoA
4-クマロイルCoA (4-Coumaroyl CoA) は、CoAの類縁体であり、p-クマル酸（4-ヒドロキシ桂皮酸）とCoAがチオエステル結合 (R-CO-S-R') した構造をもつ。脂肪酸やカルコンなどの生合成に深く関わっている。分子式は C30H42N7O18P3S、分子量913.67 g/mol、CAS登録番号は 。 生合成は4-クマロイルCoAリガーゼ (4-Coumarate CoA Ligase, EC 6.2.1.12) が触媒し、以下の反応式で表される。 反応には補因子としてMg2+が要求される。 Category:補酵素Aのチオエステル.
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4-クロロ安息香酸CoAリガーゼ
4-クロロ安息香酸CoAリガーゼ(4-chlorobenzoate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと4-クロロ安息香酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸と4-クロロベンゾイルCoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、4-クロロ安息香酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。 この酵素は、2,4-ジクロロ安息香酸の分解に関与している。補因子としてマグネシウムを必要とする。.
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6-カルボキシヘキサン酸CoAリガーゼ
6-カルボキシヘキサン酸CoAリガーゼ(6-carboxyhexanoate-CoA ligase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の3つの基質はATPと6-カルボキシヘキサン酸とCoA、3つの生成物はAMPと二リン酸と6-カルボキシヘキサン酸CoAである。 この酵素は、リガーゼ、特に酸-チオールリガーゼに分類される。系統名は、6-カルボキシヘキサン酸:CoAリガーゼ(AMP生成)である。その他よく用いられる名前に、6-carboxyhexanoyl-CoA synthetase、pimelyl-CoA synthetase等がある。 この酵素は、ビオチンの代謝に関与している。.
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