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ウリジン二リン酸

索引 ウリジン二リン酸

ウリジン二リン酸(ウリジンにリンさん、Uridine diphosphate)、略号 UDPはヌクレオチドの一種である。すなわちウリジンヌクレオシドのピロリン酸エステルである。UDPはピロリン酸基、五炭糖のリボース、核酸塩基のウラシルより構成される。.

22 関係: マンノース-6-リン酸ラクトースシンターゼリナマリンシンターゼヌクレオチドビリルビンピリミジン塩基フコシルガラクトシド 3-α-ガラクトシルトランスフェラーゼアデノシン受容体ウラシルウリジル酸ウリジン三リン酸ウリジン二リン酸ガラクトースウリジン二リン酸グルクロン酸ガラクトースガロタンニンキチンシンターゼサイカシン糖ヌクレオチドP-クマル酸P2受容体ファミリーP2Y受容体核酸

マンノース-6-リン酸

マンノース-6-リン酸(マンノース-6-リンさん、mannose-6-phosphate、略称: M6P)は、免疫系においてレクチンによって結合される分子である。M6Pはによってフルクトース-6-リン酸へと変換される。 M6Pは、リソソームへと輸送される予定ののための重要な標的シグナルである。M6Pタグはシス-ゴルジ体中のそういったタンパク質へ付加される。具体的には、ウリジン二リン酸(UDP)と''N''-アセチルグルコサミンが関わる反応において、がアスパラギン残基とM6PのN結合型グリコシル化を触媒する。M6P標的シグナルで一旦適切に印が付けられると、これらのタンパク質はトランス-ゴルジ網へと移動される。ここで、pH 6.5-6.7においてM6P部分がによって認識・結合される。 M6Pでタグ付けされたリソソーム酵素は小胞輸送によって後期エンドソームへと送り出される。いくつかのリソソーム蓄積症に対する(ERT)は、人工酵素をそれらが特定の基質を代謝することができるリソソームへと効率的に向かわせるためにこの経路に依存している。後期エンドソーム内のpHは6.0にも達し、これによって受容体からのM6Pの解離が引き起こされる。一旦遊離すると、酵素はリソソームにおけるそれらの最終目的地へと運ばれる。マンノース-6-リン酸受容体は後期エンドソームから離れるベシクルへと詰め込まれ、トランス-ゴルジ網へ戻る。このようにして、マンノース-6-リン酸受容体は再利用することができる。.

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ラクトースシンターゼ

ラクトースシンターゼ(英:Lactose synthase、EC )は、グルコースとUDP-ガラクトースからラクトースを合成する酵素である。ラクトースシンターゼは、N-アセチルラクトサミンシンターゼとα-ラクトアルブミンで構成されている。.

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リナマリンシンターゼ

リナマリンシンターゼ(Linamarin synthase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の2つの基質はウリジン二リン酸グルコースと2-ヒドロキシ-2-メチルプロパンニトリル、2つの生成物はウリジン二リン酸とリナマリンである。 この酵素は、グリコシルトランスフェラーゼ、特にヘキソシルトランスフェラーゼに分類される。系統名は、UDP-グルコース:2-ヒドロキシ-2-メチルプロパンニトリル 6-β-D-フルクトシルトランスフェラーゼである。その他よく用いられる名前に、sucrose 6-fructosyltransferase、beta-2,6-fructosyltransferase、beta-2,6-fructan:D-glucose 1-fructosyltransferase等がある。この酵素は、デンプンやスクロースの代謝に関与している。.

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ヌクレオチド

ヌクレオチド (nucleotide) とは、ヌクレオシドにリン酸基が結合した物質である。語源は“nucleo(核の)tide(結ばれた)”と言う意味である。英語では「ニュークリオタイド」と発音する。ヌクレオシドは五単糖の1位にプリン塩基またはピリミジン塩基がグリコシド結合したもの。DNAやRNAを構成する単位でもある。 ヌクレオチドが鎖のように連なりポリヌクレオチドになる。またアデノシン三リン酸はリン酸供与体としても機能し、加えてセカンドメッセンジャーの機能を持つcAMPなども知られる。遺伝暗号のコドンでは、ヌクレオチド3個でアミノ酸一つをコードしている。.

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ビリルビン

ビリルビン(英: Bilirubin)は、(以前はヘマトイジン(hematoidin、類血素)とも言われた)黄色のヘムの通常の分解代謝物である。ヘムはヘモグロビンの構成物であり、赤血球の主要構成物の一つである。ビリルビンは、胆汁または尿から排出され、異常な濃度上昇は何らかの疾病を指し示している。ビリルビンは、痣の黄色の原因物質であり、黄疸により黄色く変色が起こる原因物質である。 ビリルビンは、ゴクラクチョウカ科の数種の植物からも発見されている。.

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ピリミジン塩基

ピリミジン塩基(ピリミジンえんき、pyrimidine base)とは核酸の構成要素のうちピリミジン核を基本骨格とする塩基性物質である。核酸略号はPyr。細胞への紫外線照射によりピリミジン塩基の一部は二量体となり,遺伝子傷害の原因となる。.

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フコシルガラクトシド 3-α-ガラクトシルトランスフェラーゼ

フコシルガラクトシド 3-α-ガラクトシルトランスフェラーゼ(Fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の2つの基質はウリジン二リン酸ガラクトースとα-L-フコシル-(1->2)-D-ガラクトシル-R、2つの生成物はウリジン二リン酸とα-D-ガラクトシル-(1->3)--D-ガラクトシル-Rである。 この酵素は、グリコシルトランスフェラーゼ、特にヘキソシルトランスフェラーゼに分類される。系統名は、UDP-ガラクトース:α-L-フコシル-(1->2)-D-ガラクトシド 3-α-D-ガラクトシルトランスフェラーゼである。その他よく用いられる名前に、UDP-galactose:O-alpha-L-fucosyl(1->2)D-galactose, alpha-D-galactosyltransferase, UDPgalactose:glycoprotein-alpha-L-fucosyl-(1,2)-D-galactose, 3-alpha-D-galactosyltransferase, alpha-galactosyltransferase, blood-group substance B-dependent galactosyltransferase, glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-galactosyltransferase, histo-blood group B transferase, and histo-blood substance B-dependent galactosyltransferase等がある。この酵素は、スフィンゴ糖脂質やグリカン構造の生合成に関与している。.

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アデノシン受容体

アデノシン受容体(adenosine receptor)は、アデノシンに対するGタンパク質共役型の受容体分子。プリン受容体(表1)の一種として、P1受容体 (P1 receptor)とも呼ばれる。ヒトでは、A1、A2A、A2B、A3の4種類のサブタイプが存在する。 Wikipedia英語版より翻訳、改変。.

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ウラシル

ウラシル (uracil) はリボ核酸を構成している 4種類の主な塩基のうちのひとつ。ピリミジン塩基である。IUPAC名はピリミジン-2,4(1H,3H)-ジオン (pyrimidin-2,4(1H,3H)-dione)。分子量は 112.09、CAS登録番号は 。右図の構造のほか、互変異体として、ヒドロキシピリミジノン構造、2,4-ジヒドロキシピリミジン構造をとることができる。 ウラシルから誘導されるヌクレオシドはウリジンである。二本鎖リボ核酸ではアデニンと2つの水素結合を介して塩基対を形成している。塩基配列では U と略記される。 核酸を構成する 5種類の主な塩基(ウラシル、アデニン、グアニン、シトシン、チミン)のうち、ウラシルはリボ核酸 (RNA) 中に主に存在し、デオキシリボ核酸 (DNA) にはほとんど存在しない。DNA 中ではウラシルの代わりに、5位にメチル基が置換したチミンが存在している。 ウラシルの 5位にフッ素が導入されたフルオロウラシル (5-FU) は抗がん剤として使われている。.

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ウリジル酸

ウリジル酸(ウリジルさん、uridylic acid)は、ヌクレオチド構造を持つ有機化合物の一種である。ウリジン一リン酸 (uridine monophosphate) とも呼ばれ、UMPと略される。UMPはウラシル、五炭糖のリボース、1つのリン酸より構成されており、リン酸とウリジン(ヌクレオシド)との間でリン酸エステルが形成されている。リン酸エステルの位置により、2'-体、3'-体、5'-体が知られる。5'-体は RNA の部分構造としてあらわれ、その二ナトリウム塩はうま味調味料として用いられる。.

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ウリジン三リン酸

ウリジン三リン酸(ウリジンさんリンさん、Uridine triphosphate、略号UTP)は 糖であるリボースの1'位で核酸塩基のウラシルと連結し、糖の5' 位に三リン酸のエステル化された構造の ピリミジン ヌクレオチドである。ウリジン三リン酸のおもな役割は、転写のRNA合成の基質である。 他にはUTPには、ATPのように代謝反応の基質となることでエネルギー源や活性化因子となるの役割があるが、ATPの場合より特異性が高い。 UTPが活性化因子となる場合は、通常、基質はUDP化されて、無機リン酸が遊離する。 UDPグルコースはグリコーゲン合成の出発点である。UTPはガラクトース代謝にも利用され、UTPガラクトースがUTPグルコースに変換される。ウリジン二リン酸グルクロン酸はビリルビンの抱合にも利用され、水溶性の高い、ジグルクロン酸ビリルビンを生成する。.

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ウリジン二リン酸ガラクトース

ウリジン二リン酸ガラクトース(ウリジンにリンさんガラクトース、Uridine diphosphate galactose)は、ヌクレオチド糖の一種である。UDP-ガラクトースとも言う。多糖の生合成の中間体であり、また糖類の代謝の際にも活性型の中間体として重要な役割を果たす。.

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ウリジン二リン酸グルクロン酸

ウリジン二リン酸グルクロン酸(ウリジンにリンさんグルクロンさん、Uridine diphosphate glucuronic acid、UDP-グルクロン酸、UDP glucuronic acid)は、ウリジン二リン酸 (UDP) にグルクロン酸がグリコシド結合したもの。糖ヌクレオチドの一種で、多糖の合成に使われる。また、アスコルビン酸の生合成の中間生成物である(サル目とテンジクネズミを除く)。 NAD+を補因子としてUDP-グルコース-6-デヒドロゲナーゼ(EC 1.1.1.22)によってUDP-グルコースから作られる。この物質は、グルクロン酸転移酵素反応におけるグルクロノシル基(グルクロン酸)の供給元である。.

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ガラクトース

ラクトース(galactose)はアルドヘキソースに分類される単糖の一種である。乳製品や甜菜、ガム、および粘液で見出される他、ヒトの体内でも合成され各組織で糖脂質や糖タンパク質の一部を形成する。 エネルギーとなる食物である。.

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ガロタンニン

タンニン(Gallotannin)は、加水分解型タンニンの一つの分類である。ガロタンニンは、ポリフェノールモノマーの没食子酸がエステル化し、グルコースのようなポリオール炭水化物の水酸基と結合することで形成される。.

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キチンシンターゼ

チンシンターゼ(Chitin synthase、)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。 従って、この酵素の2つの基質はウリジン二リン酸-N-アセチルグルコサミンとn、2つの生成物はウリジン二リン酸とn+1である。 この酵素は、グリコシルトランスフェラーゼ、特にヘキソシルトランスフェラーゼに分類される。系統名は、UDP-N-アセチル-D-グルコサミン:キチン 4-β-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼである。その他よく用いられる名前に、chitin-UDP N-acetylglucosaminyltransferase、chitin-uridine diphosphate acetylglucosaminyltransferase、chitin synthetase、trans-N-acetylglucosaminosylase等がある。この酵素は、アミノ糖の代謝に関与している。.

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サイカシン

イカシン(英語、Cycasin)は、植物に含まれる化学物質(配糖体)の1つである。組成式は 、分子量は約252である。特にソテツ(種子、葉、幹など全草)に含まれる毒物として知られるGert.

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糖ヌクレオチド

糖ヌクレオチドは代謝における単糖の活性型である。糖ヌクレオチドはグリコシル化では糖の供給源となり、この反応はグリコシルトランスフェラーゼによって触媒される。.

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P-クマル酸

p-クマル酸(p-Coumaric acid)は、ケイ皮酸のヒドロキシ誘導体であるヒドロキシケイ皮酸である。クマル酸には、O-クマル酸、m-クマル酸、p-クマル酸の3つの異性体があり、フェニル基上のヒドロキシ基の位置で区別される。p-クマル酸は、3種類の中で天然に最も多く存在する。trans-p-クマル酸とcis-p-クマル酸の2種類がある。 結晶固体で、水にわずかに溶けるが、エタノールやジエチルエーテルにはよく溶ける。 シナピルアルコール及びコニフェリルアルコールとともに、リグニンの主要な構成要素となっている。.

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P2受容体ファミリー

P2受容体ファミリー (P2じゅようたいふぁみりー、P2 receptor family)は、ATP受容体とも呼ばれ、ATP、ADP、UTP、UDPなどの細胞外ヌクレオチドをリガンドとする細胞膜上受容体であり、大きく、P2X及びP2Yの2つのファミリーに分類することができる。 Wikipedia英語版より翻訳、改変。.

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P2Y受容体

P2Y受容体(P2Yじゅようたい、P2Y receptors)は、であるG蛋白質共役受容体に分類されるP2受容体ファミリーの一種である。ATP、ADP、UTP、UDP、UDPグルコース等の ヌクレオチドで刺激される。ヒトでは8種類の受容体が存在することが知られており、それぞれ、、、、、、、と呼ばれている。 P2Y受容体はヒトのほとんどの組織に存在しており、G蛋白質と共役する多彩な生物学的機能を担っている。.

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核酸

RNAとDNA、それぞれの核酸塩基 核酸(かくさん)は、リボ核酸 (RNA)とデオキシリボ核酸 (DNA)の総称で、塩基と糖、リン酸からなるヌクレオチドがホスホジエステル結合で連なった生体高分子である。糖の部分がリボースであるものがRNA、リボースの2'位の水酸基が水素基に置換された2-デオキシリボースであるものがDNAである。RNAは2'位が水酸基であるため、加水分解を受けることにより、DNAよりも反応性が高く、熱力学的に不安定である。糖の 1'位には塩基(核酸塩基)が結合している。さらに糖の 3'位と隣の糖の 5'位はリン酸エステル構造で結合しており、その結合が繰り返されて長い鎖状になる。転写や翻訳は 5'位から 3'位への方向へ進む。 なお、糖鎖の両端のうち、5'にリン酸が結合して切れている側のほうを 5'末端、反対側を 3'末端と呼んで区別する。また、隣り合う核酸上の領域の、5'側を上流、3'側を下流という。.

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